More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1004 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1004  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
470 aa  929    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10710  membrane sugar transferase  72.98 
 
 
470 aa  687    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.456153 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1021  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
470 aa  929    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1299  glycosyl transferase family protein  80 
 
 
470 aa  739    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0628268 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1031  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
470 aa  929    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0821008  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5057  glycosyl transferase family protein  76.55 
 
 
470 aa  722    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3773  glycosyl transferase family 2  48.63 
 
 
484 aa  367  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4928  glycosyl transferase family 2  49.36 
 
 
513 aa  342  7e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3324  glycosyl transferase family protein  37.97 
 
 
487 aa  222  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.624929 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2359  glycosyl transferase family 2  39.61 
 
 
487 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000227961  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0770  glycosyl transferase family 2  35.88 
 
 
505 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 
477 aa  169  8e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 
528 aa  150  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3149  glycosyl transferase family protein  45.85 
 
 
753 aa  137  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  32.78 
 
 
792 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0532  glycosyl transferase family 2  35.03 
 
 
549 aa  120  7e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00736806  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4035  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 
344 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0466  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 
302 aa  90.5  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0600433  unclonable  0.0000113237 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1959  glycosyl transferase family 2  28.82 
 
 
321 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0300  glycosyl transferase family protein  26.34 
 
 
322 aa  88.6  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3169  glycosyl transferase family 2  28.52 
 
 
344 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  35.44 
 
 
1267 aa  87.8  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4588  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
307 aa  87.4  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.151626  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 
924 aa  86.3  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  27.64 
 
 
1077 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3195  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 
394 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  32.81 
 
 
1317 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3110  glycosyl transferase family 2  27.17 
 
 
325 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1244  glycosyl transferase family 2  24.79 
 
 
328 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.161463 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1214  glycosyl transferase family 2  24.79 
 
 
328 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 
1359 aa  81.6  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0434  glycosyl transferase family 2  32.03 
 
 
460 aa  81.3  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  29.01 
 
 
785 aa  80.9  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  28.75 
 
 
305 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2753  glycosyl transferase family 2  30.96 
 
 
310 aa  79.7  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.8402 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0316  glycosyl transferase family protein  28.88 
 
 
320 aa  78.6  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  32.68 
 
 
274 aa  78.2  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0546  glycosyl transferase  27.41 
 
 
348 aa  77.8  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483878  normal  0.249879 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0684  glycosyl transferase family 2  29.66 
 
 
350 aa  77.4  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.584656 
 
 
-
 
NC_002950  PG1880  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.25 
 
 
336 aa  77  0.0000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
1759 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3930  glycosyl transferase family 2  29.32 
 
 
413 aa  76.6  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.555455  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  25.56 
 
 
311 aa  76.3  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  31.74 
 
 
700 aa  75.9  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2989  family 2 glycosyl transferase  29.05 
 
 
322 aa  76.3  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  34.3 
 
 
1267 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  27.02 
 
 
525 aa  75.5  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1529  glycosyl transferase family 2  27.21 
 
 
748 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  28.26 
 
 
841 aa  74.3  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  27.68 
 
 
309 aa  74.7  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  34.68 
 
 
345 aa  74.3  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  25.83 
 
 
355 aa  73.6  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2949  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 
392 aa  73.6  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1932  glycosyl transferase family protein  25.45 
 
 
359 aa  73.6  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.506489  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02586  glycosyl transferase  27.54 
 
 
292 aa  73.2  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00173399  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  24.74 
 
 
358 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1555  glycosyl transferase family 2  29.2 
 
 
1188 aa  72.8  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
733 aa  71.6  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5040  glycosyl transferase family 2  29.49 
 
 
323 aa  72.4  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.0567661 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  35.85 
 
 
334 aa  71.6  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3277  glycosyl transferase family protein  26.05 
 
 
273 aa  71.2  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2111  glycosyl transferase family 2  34.67 
 
 
236 aa  70.9  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  26.89 
 
 
353 aa  70.5  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1878  glycosyl transferase family 2  35.1 
 
 
597 aa  70.9  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  27.9 
 
 
260 aa  70.5  0.00000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4025  glycosyl transferase family protein  35.02 
 
 
346 aa  70.1  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2354  glycosyl transferase family protein  32.7 
 
 
297 aa  70.1  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.358669  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  25.81 
 
 
994 aa  70.1  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0140  glycosyl transferase family protein  30.48 
 
 
244 aa  69.3  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 
328 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  27.31 
 
 
337 aa  69.3  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  29 
 
 
1340 aa  69.7  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3764  N-glycosyltransferase  25.45 
 
 
425 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2074  glycosyl transferase family 2  30.41 
 
 
374 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  25.45 
 
 
425 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  32.89 
 
 
411 aa  68.6  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3110  glycosyl transferase family protein  33.63 
 
 
310 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  25.39 
 
 
338 aa  68.9  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3362  glycosyl transferase family 2  30.88 
 
 
425 aa  68.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000110111  normal  0.0175779 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3170  glycosyl transferase family protein  33.63 
 
 
310 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.845407 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4197  glycosyl transferase family 2  24.67 
 
 
352 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  24.89 
 
 
305 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0508  glycosyl transferase family protein  27.6 
 
 
351 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.239818  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3553  glycosyl transferase family 2  32.24 
 
 
619 aa  68.6  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0189873  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  30.14 
 
 
752 aa  67.8  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  24.02 
 
 
2401 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3434  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 
753 aa  67.8  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0399  glycosyl transferase family 2  31.08 
 
 
454 aa  67.8  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  29.36 
 
 
337 aa  67.8  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2342  glycosyl transferase family protein  29.27 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  28.24 
 
 
1644 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  28.24 
 
 
1644 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  29.77 
 
 
301 aa  67  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1274  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 
303 aa  67  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  25.88 
 
 
1268 aa  67  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  26.21 
 
 
988 aa  67  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4280  hypothetical protein  27.17 
 
 
1171 aa  66.6  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0777  glycosyl transferase family 2  29.19 
 
 
280 aa  66.6  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  31.51 
 
 
282 aa  66.6  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 
333 aa  65.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>