More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3149 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3149  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
753 aa  1395    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  35.81 
 
 
528 aa  237  7e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  35.17 
 
 
477 aa  215  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  34.55 
 
 
792 aa  173  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10710  membrane sugar transferase  33.66 
 
 
470 aa  159  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.456153 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5057  glycosyl transferase family protein  41.88 
 
 
470 aa  155  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  34.28 
 
 
337 aa  152  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4928  glycosyl transferase family 2  37.55 
 
 
513 aa  152  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3434  methyltransferase type 11  39.39 
 
 
286 aa  149  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012204 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1299  glycosyl transferase family protein  33.78 
 
 
470 aa  146  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0628268 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1004  glycosyl transferase family protein  34.74 
 
 
470 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1021  glycosyl transferase family protein  34.74 
 
 
470 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1031  glycosyl transferase family protein  34.74 
 
 
470 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0821008  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  35.74 
 
 
924 aa  135  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3324  glycosyl transferase family protein  33.18 
 
 
487 aa  126  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.624929 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3773  glycosyl transferase family 2  32.44 
 
 
484 aa  125  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  32.41 
 
 
305 aa  120  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  30.7 
 
 
305 aa  119  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0770  glycosyl transferase family 2  40.16 
 
 
505 aa  117  6e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0300  glycosyl transferase family protein  31.28 
 
 
322 aa  110  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2359  glycosyl transferase family 2  40.69 
 
 
487 aa  107  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000227961  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4024  glycosyl transferase family protein  35.19 
 
 
322 aa  104  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3182  glycosyl transferase family 2  36.7 
 
 
322 aa  104  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2989  family 2 glycosyl transferase  29.92 
 
 
322 aa  103  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3930  glycosyl transferase family 2  35.54 
 
 
413 aa  103  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.555455  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1959  glycosyl transferase family 2  32.46 
 
 
321 aa  103  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0466  glycosyl transferase family protein  35.04 
 
 
302 aa  102  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0600433  unclonable  0.0000113237 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  32.49 
 
 
309 aa  99.4  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2680  glycosyl transferase family protein  37.4 
 
 
426 aa  99  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3110  glycosyl transferase family 2  32.03 
 
 
325 aa  98.6  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3169  glycosyl transferase family 2  31.1 
 
 
344 aa  97.8  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  33.18 
 
 
315 aa  96.3  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4035  glycosyl transferase family protein  29.78 
 
 
344 aa  90.9  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1818  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 
335 aa  90.1  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4588  glycosyl transferase family protein  32.18 
 
 
307 aa  90.1  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.151626  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1214  glycosyl transferase family 2  28.69 
 
 
328 aa  90.1  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1244  glycosyl transferase family 2  28.69 
 
 
328 aa  90.1  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.161463 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  28.04 
 
 
1340 aa  89.4  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  27.63 
 
 
994 aa  89.4  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3671  glycosyl transferase family 2  33.19 
 
 
300 aa  89  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1842  glycosyl transferase family 2  31.7 
 
 
884 aa  89  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  27.56 
 
 
260 aa  86.7  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5590  glycosyl transferase family 2  27.21 
 
 
328 aa  86.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0428  glycosyl transferase family 2  35.14 
 
 
438 aa  86.3  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1586  glycosyl transferase family protein  34.02 
 
 
444 aa  86.3  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.807446  normal  0.639173 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
841 aa  86.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  30.2 
 
 
461 aa  85.9  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  31.67 
 
 
1644 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  31.67 
 
 
1644 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5040  glycosyl transferase family 2  27.98 
 
 
323 aa  84.7  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.0567661 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  31.46 
 
 
841 aa  84.3  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4384  glycosyl transferase family protein  34.26 
 
 
328 aa  83.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3195  glycosyl transferase family 2  28.76 
 
 
394 aa  83.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  36.82 
 
 
345 aa  84  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  30.34 
 
 
304 aa  83.2  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
328 aa  82  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 
311 aa  82.4  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  30.71 
 
 
344 aa  82.4  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  30.71 
 
 
344 aa  82.4  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  29.32 
 
 
1162 aa  81.6  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0434  glycosyl transferase family 2  33.86 
 
 
460 aa  81.3  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0602  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.64 
 
 
282 aa  79.3  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000299087  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1776  glycosyl transferase family 2  29.61 
 
 
311 aa  79.3  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  32.14 
 
 
822 aa  78.6  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3045  glycosyl transferase family protein  33.18 
 
 
305 aa  78.6  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.144194  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1880  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.16 
 
 
336 aa  77.4  0.0000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0379  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 
891 aa  77  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5246  glycosyl transferase family protein  31.97 
 
 
348 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0170348 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1841  glycosyl transferase family protein  46.15 
 
 
306 aa  76.3  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2467  glycosyl transferase family protein  31.63 
 
 
322 aa  75.9  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  24.92 
 
 
312 aa  75.5  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  31.88 
 
 
838 aa  75.1  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  33.79 
 
 
748 aa  75.1  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4681  glycosyl transferase family protein  32.07 
 
 
345 aa  74.7  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627848  normal  0.36467 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  29.79 
 
 
1267 aa  74.7  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2471  glycosyl transferase family 2  29.13 
 
 
311 aa  74.7  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3973  glycosyl transferase family 2  38.73 
 
 
525 aa  74.7  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0772213  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2462  glycosyl transferase family 2  30.22 
 
 
421 aa  74.3  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.278728  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  30.34 
 
 
752 aa  73.9  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  29.3 
 
 
525 aa  73.9  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1977  glycosyl transferase, group 2 family protein  36 
 
 
380 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  23.44 
 
 
1739 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3183  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 
358 aa  73.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000292304  decreased coverage  0.0000016442 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  32.69 
 
 
236 aa  73.9  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  32.61 
 
 
683 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1147  glycosyl transferase family 2  24.37 
 
 
338 aa  72.8  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.466774  hitchhiker  0.00852999 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0929  glycosyl transferase family protein  28.72 
 
 
796 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.283533 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  27.54 
 
 
333 aa  72.4  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3392  glycosyl transferase family protein  29.11 
 
 
287 aa  72.4  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1655  glycosyl transferase family protein  32.31 
 
 
385 aa  72.4  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.645193  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2214  glycosyl transferase family 2  35.92 
 
 
371 aa  72  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1482  glycosyl transferase family 2  42.61 
 
 
301 aa  72  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  27.97 
 
 
310 aa  72  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0137  glycosyl transferase family protein  29.67 
 
 
296 aa  72  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.145337  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1651  glycosyl transferase family 2  29.95 
 
 
313 aa  72  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 
1523 aa  71.6  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0354  glycosyl transferase family 2  25.46 
 
 
331 aa  71.6  0.00000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4288  hypothetical protein  32.3 
 
 
247 aa  71.6  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3253  glycosyl transferase family 2  34.23 
 
 
305 aa  71.6  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.24393  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0884  b-glycosyltransferase  26.51 
 
 
283 aa  71.6  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030368  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>