More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5040 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5040  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 323 aa  671    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.0567661 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5590  glycosyl transferase family 2  50.77 
 
 		 328 aa  324  1e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6397  glycosyl transferase family protein  46.84 
 
 		 333 aa  291  7e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.441453  normal  0.138484 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5246  glycosyl transferase family protein  46.44 
 
 		 348 aa  289  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0170348 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5649  glycosyl transferase family protein  46.52 
 
 		 333 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0900976  normal  0.264223 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1382  glycosyl transferase family protein  46.2 
 
 		 333 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6447  glycosyl transferase family protein  46.2 
 
 		 333 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0237769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6038  glycosyl transferase family protein  45.89 
 
 		 333 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.738252 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  45.45 
 
 		 344 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  45.45 
 
 		 344 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5443  glycosyl transferase family protein  45.11 
 
 		 333 aa  270  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.966664  hitchhiker  0.00908127 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1987  glycosyl transferase, group 2 family protein  45.89 
 
 		 333 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1386  glycosyl transferase, group 2 family protein  45.89 
 
 		 333 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.343804  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3039  glycosyl transferase, group 2 family protein  45.89 
 
 		 333 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200076  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1010  glycosyl transferase, group 2 family protein  45.89 
 
 		 333 aa  265  5e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.374388  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1298  glycosyl transferase, group 2 family protein  45.89 
 
 		 333 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.472979  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2274  glycosyl transferase, group 2 family protein  45.89 
 
 		 333 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.102891  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4384  glycosyl transferase family protein  45.85 
 
 		 328 aa  265  8.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3168  glycosyl transferase, group 2 family protein  45.57 
 
 		 333 aa  262  6e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3110  glycosyl transferase family 2  39.01 
 
 		 325 aa  236  4e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2643  family 2 glycosyl transferase  34.89 
 
 		 321 aa  140  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11260  histidinol-phosphate phosphatase family protein  32.4 
 
 		 499 aa  133  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130521  normal  0.23358 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0716  HAD family hydrolase  38.05 
 
 		 501 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.358199  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1570  hydrolase, HAD-superfamily, subfamily IIIA  33.33 
 
 		 498 aa  112  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.892629  normal  0.0176466 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0456  hydrolase, HAD-superfamily, subfamily IIIA  32.92 
 
 		 499 aa  100  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3169  glycosyl transferase family 2  27 
 
 		 344 aa  99  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4035  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 		 344 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  29.95 
 
 		 305 aa  92.8  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  31.63 
 
 		 272 aa  88.2  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0884  b-glycosyltransferase  31.97 
 
 		 283 aa  85.5  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  32.09 
 
 		 333 aa  82.8  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  28.99 
 
 		 305 aa  82.4  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0156  glycosyl transferase family protein  30.1 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3194  glycosyl transferase family 2  27.35 
 
 		 455 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  30.67 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 		 528 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07881  glycosyl transferase family protein  30.24 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.111057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2354  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.358669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  29.75 
 
 		 924 aa  78.2  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10111  glycosyl transferase family protein  30.33 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0906885 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2081  glycosyl transferase  27.99 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08131  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  25.1 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 		 311 aa  75.5  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08121  glycosyl transferase family protein  29.29 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2111  glycosyl transferase family 2  32 
 
 		 236 aa  75.1  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0883  glycosyl transferase family protein  32.43 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.178472 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0379  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 		 891 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  30.47 
 
 		 345 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3632  glycosyl transferase family 2  29.37 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2476  glycosyl transferase family 2  29.37 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  29.22 
 
 		 334 aa  74.3  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3149  glycosyl transferase family protein  27.98 
 
 		 753 aa  73.9  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2064  glycosyl transferase family protein  29.18 
 
 		 322 aa  73.2  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.346015  normal  0.195007 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1552  glycosyl transferase family 2  27.89 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3392  glycosyl transferase family protein  25.94 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0760  glycosyl transferase family protein  29.29 
 
 		 303 aa  72.4  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1274  glycosyl transferase family 2  30.81 
 
 		 303 aa  72.4  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2271  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 		 319 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3671  glycosyl transferase family 2  28.84 
 
 		 300 aa  72  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2801  glycosyl transferase family 2  26.87 
 
 		 328 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  27.75 
 
 		 345 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10710  membrane sugar transferase  30.28 
 
 		 470 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.456153 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0155  glycosyl transferase family 2  27.36 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  28.07 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4464  glycosyl transferase family 2  26.8 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3457  b-glycosyltransferase  27.31 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0284988 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0962  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3699  glycosyl transferase family protein  34.35 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.780358 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0548  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.34 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4538  glycosyl transferase family protein  34.35 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3825  glycosyl transferase family protein  34.35 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  26.73 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08321  glycosyl transferase family protein  27.67 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.389273  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2889  glycosyltransferase-like  26.73 
 
 		 316 aa  69.3  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1960  glycosyl transferase family 2  35.34 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2811  glycosyl transferase family 2  30.2 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.104457 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  31.62 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1272  glycosyl transferase family 2  31.47 
 
 		 306 aa  68.9  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.294715  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2480  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.34 
 
 		 326 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2618  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.34 
 
 		 326 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0913  putative glycosyltransferase  35.34 
 
 		 1066 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193043  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2241  glycosyl transferase family 2, involved in cell wall biogenesis  35.34 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0118567  normal  0.43942 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2462  glycosyl transferase family 2  26.61 
 
 		 421 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.278728  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16631  glycosyl transferase family protein  26.45 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.505772 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1248  glycosyltransferase  30.1 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0573246  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4531  family 2 glycosyl transferase  27.93 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1842  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 		 884 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3045  glycosyl transferase family protein  25.4 
 
 		 305 aa  67  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.144194  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1813  glycosyl transferase family 2  30.47 
 
 		 272 aa  67  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0428  glycosyl transferase family 2  29.26 
 
 		 438 aa  66.6  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4887  family 2 glycosyl transferase  28.29 
 
 		 312 aa  67  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2532  putative glycosyl transferase  34.33 
 
 		 317 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.218216 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  27.21 
 
 		 477 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3182  glycosyl transferase family 2  28.92 
 
 		 322 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1376  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.76 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4928  glycosyl transferase family 2  30.63 
 
 		 513 aa  66.6  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  27.13 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>