More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0137 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0137  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
296 aa  591  1e-168  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.145337  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0466  glycosyl transferase family protein  43.01 
 
 
302 aa  207  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0600433  unclonable  0.0000113237 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0138  glycosyl transferase family protein  41.87 
 
 
293 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39175  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  32.49 
 
 
477 aa  86.3  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  30.13 
 
 
305 aa  85.5  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  29.91 
 
 
305 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  24.65 
 
 
528 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  24.45 
 
 
337 aa  76.6  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  37.3 
 
 
301 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  26.46 
 
 
1340 aa  75.5  0.0000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  27.14 
 
 
309 aa  75.1  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0203  glycosyl transferase family protein  32.99 
 
 
313 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.326499 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1274  glycosyl transferase family 2  34.15 
 
 
303 aa  73.6  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 
340 aa  72.8  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0146  glycosyl transferase family 2  32.34 
 
 
313 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  28.34 
 
 
260 aa  72  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 
683 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  28.82 
 
 
272 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1272  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 
306 aa  71.2  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.294715  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  24.31 
 
 
860 aa  70.9  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  26.61 
 
 
304 aa  70.9  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3180  glycosyl transferase family 2  25.21 
 
 
322 aa  70.1  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3149  glycosyl transferase family protein  30.56 
 
 
753 aa  70.1  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  35.76 
 
 
691 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  30.11 
 
 
924 aa  69.7  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1880  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.47 
 
 
336 aa  68.9  0.00000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  33.94 
 
 
691 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1366  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
247 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  33.94 
 
 
691 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0742  glycosyl transferase family 2  30.33 
 
 
281 aa  67.8  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.18736  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  27.09 
 
 
328 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
345 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3110  glycosyl transferase family 2  27.16 
 
 
325 aa  67  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2859  glycosyl transferase family protein  28.45 
 
 
291 aa  67  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0761346  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 
340 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
311 aa  67  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3553  glycosyl transferase family 2  32.79 
 
 
619 aa  66.6  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0189873  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  28.39 
 
 
333 aa  66.2  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1776  glycosyl transferase family 2  28.78 
 
 
311 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4035  glycosyl transferase family protein  29.36 
 
 
344 aa  65.5  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0884  b-glycosyltransferase  35.97 
 
 
283 aa  65.9  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030368  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0287  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
315 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.201037  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3250  glycosyl transferase family 2  33.98 
 
 
307 aa  64.3  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  31.85 
 
 
525 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2063  glycosyl transferase family 2  27.84 
 
 
321 aa  64.7  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19750  predicted glycosyltransferase  30.95 
 
 
664 aa  63.5  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1791  b-glycosyltransferase  24.18 
 
 
344 aa  63.9  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5590  glycosyl transferase family 2  30.99 
 
 
328 aa  64.3  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  31.22 
 
 
270 aa  63.5  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0354  glycosyl transferase family 2  24.9 
 
 
331 aa  63.5  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  22.31 
 
 
703 aa  62.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2471  glycosyl transferase family 2  28.29 
 
 
311 aa  62.4  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  32.89 
 
 
785 aa  62.4  0.000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05340  Glycosyl transferase, family 2  30.43 
 
 
321 aa  62  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000520172  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  28.08 
 
 
824 aa  61.6  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1447  glycosyl transferase family protein  27.52 
 
 
233 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0726839  normal  0.0201369 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  29.22 
 
 
994 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5057  glycosyl transferase family protein  31.21 
 
 
470 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5246  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
348 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0170348 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2081  glycosyl transferase  27.1 
 
 
316 aa  60.8  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1818  glycosyl transferase family protein  27.67 
 
 
335 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2333  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 
327 aa  60.1  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.012677  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1299  glycosyl transferase family protein  33.11 
 
 
470 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0628268 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4464  glycosyl transferase family 2  30.71 
 
 
335 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0851  glycosyl transferase family protein  30.29 
 
 
1152 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3950  glycosyl transferase family protein  25.69 
 
 
778 aa  59.7  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.75941 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3277  glycosyl transferase family protein  31.64 
 
 
273 aa  60.1  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  25.64 
 
 
403 aa  59.7  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3169  glycosyl transferase family 2  28.22 
 
 
344 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  24.89 
 
 
2401 aa  59.3  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1428  hypothetical protein  30.43 
 
 
346 aa  58.9  0.00000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.166911  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1078  glycosyl transferase family protein  28.89 
 
 
232 aa  58.5  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892634  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2811  glycosyl transferase family 2  27.73 
 
 
307 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.104457 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  27.4 
 
 
700 aa  58.5  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4777  glycosyl transferase family 2  31.69 
 
 
742 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2719  glycosyl transferase family 2  28.35 
 
 
662 aa  58.9  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6733  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 
333 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  24.68 
 
 
369 aa  58.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  28.16 
 
 
315 aa  58.9  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0428  glycosyl transferase family 2  28.42 
 
 
438 aa  58.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3253  glycosyl transferase family 2  30.41 
 
 
305 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.24393  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2894  hypothetical protein  26.88 
 
 
316 aa  58.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0314909 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  25.7 
 
 
892 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  26.34 
 
 
710 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3463  glycosyl transferase family protein  26.11 
 
 
332 aa  57.4  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0230104  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4255  glycosyl transferase family protein  32.1 
 
 
330 aa  57.4  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  26.79 
 
 
717 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 
748 aa  57  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  31.28 
 
 
283 aa  57  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4384  glycosyl transferase family protein  28.9 
 
 
328 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  24.62 
 
 
841 aa  56.2  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  25.1 
 
 
694 aa  56.2  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  30.25 
 
 
836 aa  55.8  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2889  glycosyltransferase-like  24.54 
 
 
316 aa  55.8  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01307  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  23.81 
 
 
326 aa  56.2  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  25.55 
 
 
717 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  24.44 
 
 
401 aa  55.5  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  26.76 
 
 
1077 aa  55.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11260  histidinol-phosphate phosphatase family protein  35.77 
 
 
499 aa  55.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130521  normal  0.23358 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1097  glycosyl transferase family protein  28.95 
 
 
326 aa  55.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000713189  normal  0.938252 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>