More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3773 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3773  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
484 aa  949    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10710  membrane sugar transferase  48.42 
 
 
470 aa  393  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.456153 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1299  glycosyl transferase family protein  47.37 
 
 
470 aa  382  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0628268 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5057  glycosyl transferase family protein  45.89 
 
 
470 aa  374  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1004  glycosyl transferase family protein  48.63 
 
 
470 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1021  glycosyl transferase family protein  48.63 
 
 
470 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1031  glycosyl transferase family protein  48.63 
 
 
470 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0821008  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4928  glycosyl transferase family 2  45.47 
 
 
513 aa  299  1e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3324  glycosyl transferase family protein  37.58 
 
 
487 aa  219  8.999999999999998e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.624929 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2359  glycosyl transferase family 2  35.14 
 
 
487 aa  186  6e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000227961  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  33.17 
 
 
477 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0770  glycosyl transferase family 2  32.45 
 
 
505 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  27.18 
 
 
528 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3149  glycosyl transferase family protein  32.88 
 
 
753 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  31.98 
 
 
792 aa  121  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0532  glycosyl transferase family 2  32.66 
 
 
549 aa  101  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00736806  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1214  glycosyl transferase family 2  23.55 
 
 
328 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1244  glycosyl transferase family 2  23.55 
 
 
328 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.161463 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  32.31 
 
 
841 aa  87.4  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  30.3 
 
 
924 aa  87  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4588  glycosyl transferase family protein  28.41 
 
 
307 aa  85.1  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.151626  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  30.17 
 
 
822 aa  82.8  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
305 aa  81.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0300  glycosyl transferase family protein  24.9 
 
 
322 aa  81.3  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2989  family 2 glycosyl transferase  27.13 
 
 
322 aa  80.9  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  30.85 
 
 
308 aa  80.5  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 
311 aa  80.5  0.00000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  30.58 
 
 
838 aa  79.7  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1959  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
321 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  25.63 
 
 
1340 aa  77.4  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  25.78 
 
 
305 aa  77  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0684  glycosyl transferase family 2  27.48 
 
 
350 aa  76.3  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.584656 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4035  glycosyl transferase family protein  28.31 
 
 
344 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  28.17 
 
 
836 aa  75.5  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  27.73 
 
 
328 aa  73.2  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0399  glycosyl transferase family 2  30.17 
 
 
454 aa  72.4  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3930  glycosyl transferase family 2  31.08 
 
 
413 aa  71.6  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.555455  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  24.11 
 
 
358 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  29.25 
 
 
1267 aa  71.2  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0466  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 
302 aa  71.2  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0600433  unclonable  0.0000113237 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0011  putative glycosyltransferase  33.33 
 
 
320 aa  71.2  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.171814  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  29.65 
 
 
313 aa  70.5  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  26.8 
 
 
355 aa  70.5  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 
420 aa  70.1  0.00000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  25.39 
 
 
294 aa  70.1  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  29.15 
 
 
752 aa  70.1  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1880  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.06 
 
 
336 aa  69.7  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0428  glycosyl transferase family 2  31.8 
 
 
438 aa  69.7  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  30.49 
 
 
683 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  24.67 
 
 
338 aa  68.9  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  26.07 
 
 
1486 aa  68.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  27.06 
 
 
1359 aa  68.9  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3169  glycosyl transferase family 2  27.91 
 
 
344 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 
1267 aa  67.8  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  24.91 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1932  glycosyl transferase family protein  24.32 
 
 
359 aa  67.8  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.506489  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3195  glycosyl transferase family 2  28.47 
 
 
394 aa  67.8  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  30.92 
 
 
691 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  25.6 
 
 
309 aa  67.4  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0883  glycosyl transferase family 2  26.98 
 
 
723 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  26.75 
 
 
2401 aa  67.4  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3183  glycosyl transferase family 2  29.14 
 
 
358 aa  67.4  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000292304  decreased coverage  0.0000016442 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  30.81 
 
 
274 aa  67  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  26.45 
 
 
337 aa  67  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  28.18 
 
 
525 aa  67  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1948  glycosyl transferase family 2  31.9 
 
 
721 aa  66.6  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3077  glycosyl transferase family protein  28.27 
 
 
313 aa  66.6  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.243281 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  27.07 
 
 
1077 aa  66.6  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  24.65 
 
 
337 aa  66.6  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1818  glycosyl transferase family protein  27.64 
 
 
335 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  30.92 
 
 
691 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 
282 aa  66.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1492  glycosyl transferase family 2  25.64 
 
 
958 aa  65.9  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  32.44 
 
 
291 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3553  glycosyl transferase family 2  31.34 
 
 
619 aa  65.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0189873  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  31.22 
 
 
345 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  27.66 
 
 
345 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  25.78 
 
 
422 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  23.65 
 
 
1120 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  27.98 
 
 
1099 aa  65.1  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.97 
 
 
610 aa  65.1  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  32 
 
 
598 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3277  glycosyl transferase family protein  25.37 
 
 
273 aa  65.1  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0054  glycosyl transferase family 2  32.29 
 
 
557 aa  65.1  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2074  glycosyl transferase family 2  29.47 
 
 
374 aa  64.7  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  30.48 
 
 
301 aa  64.7  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0546  glycosyl transferase  26.19 
 
 
348 aa  64.7  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483878  normal  0.249879 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  26.07 
 
 
1124 aa  63.9  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  29.32 
 
 
880 aa  64.3  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02586  glycosyl transferase  29.32 
 
 
292 aa  64.3  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00173399  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  29.73 
 
 
1644 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0137  glycosyl transferase family protein  30.68 
 
 
296 aa  63.9  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.145337  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  29.73 
 
 
1644 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3254  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.23 
 
 
314 aa  63.5  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0462  glycosyl transferase family 2  27.37 
 
 
325 aa  63.5  0.000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2680  glycosyl transferase family protein  34.09 
 
 
426 aa  63.2  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  30.05 
 
 
637 aa  63.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1274  glycosyl transferase family 2  25.1 
 
 
303 aa  62.8  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  24.37 
 
 
304 aa  63.2  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2471  glycosyl transferase family 2  25.6 
 
 
311 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>