More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0602 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0602  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 
282 aa  577  1e-164  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000299087  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2393  glycosyl transferase family 2  36.97 
 
 
281 aa  155  6e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0345  glycosyl transferase family protein  27.34 
 
 
279 aa  132  5e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0405304 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5280  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.52 
 
 
273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5124  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.52 
 
 
273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5523  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.52 
 
 
273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0742  glycosyl transferase family 2  31.17 
 
 
281 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.18736  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0461  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.48 
 
 
279 aa  109  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00018304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5677  group 2 family glycosyl transferase  30.16 
 
 
267 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  28.12 
 
 
305 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1323  glycosyl transferase family protein  27.47 
 
 
281 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.315586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1342  glycosyl transferase family protein  28.19 
 
 
353 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.371395 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1306  glycosyl transferase family protein  28.19 
 
 
321 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.627335  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  28.71 
 
 
305 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1075  WecB/TagA/CpsF family glycosyl transferase  26.84 
 
 
561 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.255325  normal  0.693925 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2069  glycosyl transferase family protein  25.53 
 
 
292 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0388687  normal  0.475446 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2063  glycosyl transferase family 2  22.73 
 
 
321 aa  80.9  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3392  glycosyl transferase family protein  24.83 
 
 
287 aa  80.5  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3149  glycosyl transferase family protein  26.42 
 
 
753 aa  78.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3347  glycosyl transferase family protein  24.12 
 
 
308 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0334  hypothetical protein  25.45 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0356311  decreased coverage  0.000000899719 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  24.24 
 
 
528 aa  68.9  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4105  glycosyl transferase family 2  27.36 
 
 
317 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.852576  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  26.98 
 
 
260 aa  67.4  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1357  glycosyl transferase family 2  24.04 
 
 
293 aa  66.6  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  25.4 
 
 
337 aa  65.9  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3671  glycosyl transferase family 2  22.54 
 
 
300 aa  64.7  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4093  glycosyl transferase family 2  21.12 
 
 
296 aa  63.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  24.56 
 
 
309 aa  63.5  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  21.92 
 
 
344 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  21.92 
 
 
344 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3219  glycosyl transferase family 2  23.45 
 
 
314 aa  62.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1351  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 
362 aa  62.4  0.000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0434  glycosyl transferase family 2  24.79 
 
 
460 aa  62.4  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2680  glycosyl transferase family protein  22.39 
 
 
426 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2531  putative glycosyltransferase  26.88 
 
 
337 aa  62.4  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0725  family 2 glycosyl transferase  25 
 
 
292 aa  61.6  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0538326 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4928  glycosyl transferase family 2  21.2 
 
 
513 aa  60.1  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  23.25 
 
 
333 aa  60.1  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0243  glycosyl transferase family protein  28.19 
 
 
573 aa  59.3  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0249  glycosyl transferase family protein  28.19 
 
 
573 aa  59.3  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2191  glycosyl transferase family 2  24.78 
 
 
331 aa  58.9  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2253  glycosyl transferase family 2  24.78 
 
 
331 aa  58.9  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.628199  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  24.02 
 
 
477 aa  58.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1147  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
338 aa  58.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.466774  hitchhiker  0.00852999 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4681  glycosyl transferase family protein  24.36 
 
 
345 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627848  normal  0.36467 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  24.06 
 
 
301 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  29.36 
 
 
1250 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0354  glycosyl transferase family 2  24.19 
 
 
331 aa  57.4  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  24.9 
 
 
395 aa  57  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3433  glycosyl transferase family protein  22.87 
 
 
309 aa  57.4  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.503328 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3182  glycosyl transferase family 2  23.11 
 
 
322 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3253  glycosyl transferase family 2  24.55 
 
 
305 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.24393  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2971  glycosyl transferase family 2  21.43 
 
 
324 aa  56.2  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1366  glycosyl transferase family protein  23.53 
 
 
331 aa  56.6  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.959052  normal  0.0372616 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  22.28 
 
 
792 aa  56.6  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3463  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 
332 aa  56.2  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0230104  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5207  glycosyl transferase family 2  30.63 
 
 
254 aa  56.2  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3180  glycosyl transferase family 2  27.19 
 
 
322 aa  56.2  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0269  glycosyl transferase family protein  25.32 
 
 
335 aa  55.8  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1581  glycosyl transferase family protein  22.95 
 
 
466 aa  55.8  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  23.12 
 
 
299 aa  55.8  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2889  glycosyltransferase-like  21.9 
 
 
316 aa  55.8  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0938  glycosyl transferase family protein  34.69 
 
 
317 aa  55.8  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  25.7 
 
 
289 aa  55.8  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1697  glycosyl transferase family 2  28.72 
 
 
366 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.696391  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5644  glycosyl transferase family protein  22.74 
 
 
307 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223754  normal  0.273017 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  26.42 
 
 
694 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4024  glycosyl transferase family protein  23 
 
 
322 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1586  glycosyl transferase family protein  22.44 
 
 
444 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.807446  normal  0.639173 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1832  glycosyl transferase family protein  32.65 
 
 
318 aa  54.3  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.52931  hitchhiker  0.00130568 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3930  glycosyl transferase family 2  23.02 
 
 
413 aa  53.5  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.555455  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1841  glycosyl transferase family protein  32.67 
 
 
306 aa  53.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0893  glycosyl transferase family 2  27.5 
 
 
337 aa  53.9  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3864  glycosyl transferase family 2  27.04 
 
 
288 aa  53.5  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.707292 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2753  glycosyl transferase family 2  29.37 
 
 
310 aa  53.5  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.8402 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1123  glycosyl transferase family protein  31.13 
 
 
315 aa  53.1  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0764134 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3038  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.62 
 
 
247 aa  53.1  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.654585  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4914  family 2 glycosyl transferase  29.84 
 
 
306 aa  53.1  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1255  glycosyltransferase  33.62 
 
 
247 aa  53.1  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  hitchhiker  0.000000000031539 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6392  glycosyl transferase family protein  23.72 
 
 
307 aa  53.1  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863517  normal  0.0945582 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3110  glycosyl transferase family 2  27.32 
 
 
325 aa  52.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  26.05 
 
 
309 aa  52.8  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0518  glycosyl transferase family protein  21.4 
 
 
341 aa  52.4  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  32.99 
 
 
302 aa  52.8  0.000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  31 
 
 
326 aa  52.4  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  21.65 
 
 
403 aa  52.4  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3180  glycosyl transferase family protein  26.11 
 
 
249 aa  52.4  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.589075  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  28.28 
 
 
362 aa  52.4  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1429  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.09 
 
 
327 aa  51.6  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2471  glycosyl transferase family 2  23.65 
 
 
311 aa  52  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0926  glycosyl transferase family 2  24.42 
 
 
310 aa  51.6  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  31.68 
 
 
303 aa  51.6  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4122  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
311 aa  51.6  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.408918  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  21.37 
 
 
1035 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2677  glycosyl transferase family protein  30.68 
 
 
317 aa  52  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.73 
 
 
310 aa  50.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3738  glycosyl transferase family 2  23.76 
 
 
279 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1536  glycosyl transferase family 2  25.12 
 
 
238 aa  51.2  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2956  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 
319 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>