More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5927 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5927  succinoglycan biosynthesis protein  100 
 
 		 341 aa  709    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4957  glycosyl transferase family protein  67.68 
 
 		 330 aa  487  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.083679 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0657  glycosyl transferase family protein  59.24 
 
 		 331 aa  379  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1959  glycosyl transferase family protein  51.88 
 
 		 329 aa  329  4e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.465626 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1222  glycosyl transferase family protein  52.38 
 
 		 329 aa  323  3e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.966529  normal  0.285342 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2563  glycosyl transferase family protein  52.38 
 
 		 329 aa  323  4e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4805  glycosyl transferase family protein  49.55 
 
 		 339 aa  317  1e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4523  glycosyl transferase family protein  43.33 
 
 		 336 aa  245  9e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0722  succinoglycan biosynthesis protein ExoA  41.07 
 
 		 353 aa  241  1e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4622  glycosyl transferase family protein  42.21 
 
 		 355 aa  230  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0686248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1349  glycosyltransferase  34.91 
 
 		 343 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3875  glycosyl transferase family 2  32.91 
 
 		 331 aa  156  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2541  putative glycosyl transferase  33.65 
 
 		 341 aa  155  6e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4113  glycosyl transferase family 2  31.39 
 
 		 343 aa  152  8e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.902695  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0718  family 2 glycosyl transferase  30.86 
 
 		 352 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00805458 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1038  glycosyl transferase family protein  34.41 
 
 		 355 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.378242  normal  0.03094 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7649  glycosyl transferase family 2  32.06 
 
 		 352 aa  132  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0838  glycosyl transferase family 2  30.79 
 
 		 368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08480  glycosyl transferase  31.96 
 
 		 324 aa  129  5.0000000000000004e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.525807 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0604  putative glycosyl transferase  31.98 
 
 		 340 aa  119  7e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.781878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3183  glycosyl transferase family 2  28.18 
 
 		 358 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000292304  decreased coverage  0.0000016442 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0228  glycosyl transferase family protein  26.59 
 
 		 333 aa  103  5e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000082788  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3564  glycosyl transferase family protein  27.99 
 
 		 389 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  31.65 
 
 		 822 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  25.79 
 
 		 337 aa  91.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1661  glycosyl transferase family protein  22.9 
 
 		 316 aa  89  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1029  glycosyl transferase family protein  29.5 
 
 		 360 aa  87  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05860  glycosyl transferase  25.86 
 
 		 351 aa  78.2  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181902 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0913  glycosyl transferase, group 2 family protein  21.43 
 
 		 341 aa  76.3  0.0000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000688111  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05340  Glycosyl transferase, family 2  28.35 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000520172  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3111  glycosyl transferase family protein  27.3 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3171  glycosyl transferase family protein  27.3 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3835  hypothetical protein  26.64 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3180  glycosyl transferase family 2  21 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3231  glycosyl transferase family protein  27.68 
 
 		 316 aa  65.9  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000094491  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1291  glycosyl transferase family protein  29.06 
 
 		 351 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1662  glycosyl transferase family protein  29.07 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.363785  hitchhiker  0.00433752 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 1124 aa  63.2  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4484  N-glycosyltransferase  23.91 
 
 		 423 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.230285  normal  0.930554 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1781  glycosyl transferase family 2  26.99 
 
 		 326 aa  60.8  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.456914  normal  0.601286 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  25.1 
 
 		 441 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  25.1 
 
 		 441 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  25.1 
 
 		 441 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  25.1 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  25.1 
 
 		 441 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  25.1 
 
 		 441 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  25.1 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  24.03 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0288  N-glycosyltransferase  23.05 
 
 		 424 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393224  normal  0.0606217 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3764  N-glycosyltransferase  22.65 
 
 		 425 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2859  glycosyl transferase family protein  25.75 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0761346  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2011  glycosyl transferase family 2  25.23 
 
 		 335 aa  57.4  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.814426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  22.65 
 
 		 425 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2360  glycosyl transferase family 2  25.27 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.571738  normal  0.010101 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3305  glycosyl transferase family protein  28.65 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1791  b-glycosyltransferase  21.66 
 
 		 344 aa  56.6  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3996  N-glycosyltransferase  23.91 
 
 		 423 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.706651  normal  0.0922124 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3351  glycosyl transferase family protein  32.03 
 
 		 434 aa  56.2  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0805099  normal  0.0745204 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3513  N-glycosyltransferase  23.91 
 
 		 423 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0140  glycosyl transferase family protein  25.37 
 
 		 244 aa  55.8  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04995  glycosyl transferase  29.19 
 
 		 259 aa  55.5  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  26.61 
 
 		 313 aa  55.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3473  glycosyl transferase family 2  27.84 
 
 		 228 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3745  glycosyl transferase family 2  27.5 
 
 		 226 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2467  glycosyl transferase family protein  32.03 
 
 		 251 aa  54.7  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000260943  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0621  hypothetical protein  28.29 
 
 		 321 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0768751  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2552  glycosyl transferase family protein  28.06 
 
 		 245 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0262728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2017  glycosyl transferase family protein  26.89 
 
 		 322 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1942  N-glycosyltransferase  24.11 
 
 		 423 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  22.18 
 
 		 305 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2333  glycosyl transferase family protein  25.45 
 
 		 327 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.012677  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4264  N-glycosyltransferase  24.51 
 
 		 423 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219891  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3421  N-glycosyltransferase  24.51 
 
 		 423 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.543844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4102  N-glycosyltransferase  24.51 
 
 		 423 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0468214  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  23.53 
 
 		 1268 aa  55.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  26.53 
 
 		 304 aa  53.9  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0526  glycosyl transferase family 2  28.89 
 
 		 309 aa  53.9  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  23.25 
 
 		 1099 aa  53.9  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  26.24 
 
 		 330 aa  53.1  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0057  putative glycosyltransferase  23.36 
 
 		 443 aa  53.1  0.000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  24.17 
 
 		 528 aa  53.1  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  24.92 
 
 		 789 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0328  glycosyl transferase family 2  28.26 
 
 		 270 aa  52.8  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.127312 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  24.92 
 
 		 789 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  24.92 
 
 		 789 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.46 
 
 		 379 aa  52.4  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  34.27 
 
 		 298 aa  52.4  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  24.7 
 
 		 428 aa  52  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  33.61 
 
 		 420 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0481  glycosyl transferase family protein  32.2 
 
 		 321 aa  52.4  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1880  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.75 
 
 		 336 aa  51.6  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  33.88 
 
 		 411 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0060  putative glycosyltransferase  22.35 
 
 		 439 aa  51.6  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2894  hypothetical protein  26.13 
 
 		 316 aa  51.6  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0314909 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  33.61 
 
 		 414 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0674  glycosyl transferase family 2  25.62 
 
 		 382 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  25.12 
 
 		 328 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4987  glycosyl transferase family protein  33.06 
 
 		 235 aa  51.2  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278061  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3451  hypothetical protein  25.81 
 
 		 300 aa  51.2  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0487  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 284 aa  51.2  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>