164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3001 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_3001  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
217 aa  443  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3134  glycosyl transferase, group 2 family protein  91.71 
 
 
217 aa  407  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0455635  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2540  glycosyl transferase family protein  63.26 
 
 
219 aa  267  8.999999999999999e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.409391 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5418  glycosyl transferase family protein  60 
 
 
218 aa  237  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39706  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2238  glycosyl transferase family 2  57.14 
 
 
218 aa  218  6e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2029  glycosyl transferase family protein  55.4 
 
 
217 aa  217  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80207  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2639  glycosyl transferase family protein  53.46 
 
 
232 aa  215  5e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.613658 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4939  glycosyl transferase family protein  52.73 
 
 
227 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2505  glycosyl transferase family protein  52.07 
 
 
219 aa  210  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5874  glycosyl transferase family protein  53.27 
 
 
270 aa  209  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.191955 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3256  glycosyl transferase, group 2 family protein  52.07 
 
 
219 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0789044  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2655  glycosyl transferase family protein  53.24 
 
 
223 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584909  normal  0.786422 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1798  glycosyl transferase family protein  42.2 
 
 
224 aa  170  1e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.521662  normal  0.0312048 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0557  glycosyl transferase family 2  40.68 
 
 
250 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0022  glycosyl transferase family protein  40.99 
 
 
234 aa  128  8.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.647116  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20090  glycosyl transferase  37.77 
 
 
255 aa  125  5e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.308185  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0337  glycosyl transferase family protein  35.24 
 
 
273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0203  glycosyl transferase family 2  39.65 
 
 
225 aa  108  6e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.856102  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0510  glycosyl transferase family 2  37.55 
 
 
270 aa  108  9.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.319403  decreased coverage  0.000000276564 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3270  glycosyl transferase family 2  33.48 
 
 
247 aa  89.7  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141739  hitchhiker  0.0000443809 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2569  glycosyl transferase family 2  31.86 
 
 
227 aa  84.7  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392565  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10920  acylphosphatase  32.8 
 
 
393 aa  84.3  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.551581  normal  0.319268 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01090  uncharacterized LmbE-like protein  32.54 
 
 
708 aa  84.3  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0560  glycosyl transferase family protein  31.96 
 
 
225 aa  74.3  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0578  glycosyl transferase family protein  27.89 
 
 
419 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  28.44 
 
 
236 aa  68.2  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3596  glycosyl transferase family 2  29.48 
 
 
418 aa  67  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4101  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 
390 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0116147  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2977  glycosyl transferase family protein  30.65 
 
 
390 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.707645  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0799  glycosyl transferase family 2  29.84 
 
 
369 aa  62.8  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.958251 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3446  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.16 
 
 
253 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  26.7 
 
 
235 aa  62  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3138  glycosyltransferase  38.16 
 
 
253 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259725  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3459  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.16 
 
 
253 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0198533  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3205  glycosyltransferase  38.16 
 
 
253 aa  61.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150696  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1536  glycosyl transferase family 2  26.09 
 
 
238 aa  61.2  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3232  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.16 
 
 
193 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0263281  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0119  glycosyl transferase family protein  35.25 
 
 
232 aa  60.5  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2919  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
384 aa  60.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60146  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3434  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.84 
 
 
253 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3442  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.84 
 
 
253 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.184184  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4582  glycosyl transferase family 2  29.08 
 
 
386 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.077978 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1742  glycosyltransferase  27.62 
 
 
281 aa  58.5  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1366  glycosyl transferase family protein  33.96 
 
 
247 aa  57.4  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5107  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 
364 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.120649  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1173  glycosyl transferase family 2  29.22 
 
 
372 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2360  glycosyl transferase family 2  33.12 
 
 
354 aa  57.4  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.571738  normal  0.010101 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1256  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 
240 aa  57.4  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000223583  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  26.57 
 
 
477 aa  57  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4212  glycosyl transferase family protein  29.08 
 
 
386 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.787376  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4727  glycosyl transferase family 2  28.8 
 
 
386 aa  57  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0134814 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  27.89 
 
 
315 aa  57  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0044  glycosyltransferase  40.86 
 
 
352 aa  56.6  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117079  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2333  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
327 aa  56.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.012677  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1078  glycosyl transferase family protein  24.76 
 
 
232 aa  55.8  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892634  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1200  glycosyl transferase family 2  29.05 
 
 
237 aa  55.5  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1343  glycosyl transferase family protein  30.22 
 
 
522 aa  55.5  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725214  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0140  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 
244 aa  54.3  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4777  glycosyl transferase family 2  32.61 
 
 
393 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.340207 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  25.12 
 
 
333 aa  53.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3115  glycosyl transferase family 2  26.96 
 
 
235 aa  53.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03040  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.66 
 
 
231 aa  53.5  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0219  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
247 aa  53.1  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2334  glycosyl transferase family 2  35.51 
 
 
417 aa  52.8  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.876722  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2328  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.73 
 
 
466 aa  52.8  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.417791  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0487  glycosyl transferase family protein  24.35 
 
 
284 aa  52.8  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.843285 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1675  glycosyl transferase family 2  27.62 
 
 
415 aa  52.8  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9270  glycosyltransferase-like protein  25.63 
 
 
243 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  33.06 
 
 
694 aa  52  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2042  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.73 
 
 
466 aa  52  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2370  glycosyltransferase  26.52 
 
 
319 aa  51.6  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0808  glycosyl transferase family 2  29.25 
 
 
334 aa  51.2  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227461  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.78 
 
 
382 aa  50.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1394  glycosyl transferase family 2  28.4 
 
 
362 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.295637 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3499  glycosyl transferase family 2  35.37 
 
 
497 aa  50.1  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.802267  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1447  glycosyl transferase family protein  23.92 
 
 
233 aa  49.7  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0726839  normal  0.0201369 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5289  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
403 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  25.64 
 
 
337 aa  49.3  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1788  glycosyl transferase family protein  24.14 
 
 
418 aa  49.7  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4464  glycosyl transferase family 2  28.14 
 
 
335 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1810  glycosyl transferase family protein  31.97 
 
 
513 aa  49.3  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0885657  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1704  glycosyl transferase family 2  30.56 
 
 
398 aa  48.9  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0435  glycosyltransferase  30.36 
 
 
512 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1525  glycosyl transferase family protein  32.63 
 
 
240 aa  48.5  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.201491  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2554  glycosyl transferase family 2  32.38 
 
 
385 aa  48.5  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2953  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 
268 aa  48.5  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666852  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1232  glycosyl transferase family protein  26.72 
 
 
362 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0370  glycosyl transferase family 2  23.53 
 
 
438 aa  48.1  0.00009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0460104  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  29.25 
 
 
479 aa  47.8  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  25.85 
 
 
345 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2467  glycosyl transferase family protein  28.92 
 
 
322 aa  47.8  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3023  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.38 
 
 
505 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3305  glycosyl transferase family protein  32.41 
 
 
342 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3658  glycosyl transferase family protein  31.18 
 
 
349 aa  47  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  29.46 
 
 
479 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  38.54 
 
 
355 aa  47.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6545  glycosyl transferase family protein  37.93 
 
 
293 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.125421 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5602  glycosyl transferase family 2  33.06 
 
 
412 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.922712  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0943  glycosyl transferase family 2  29.36 
 
 
351 aa  46.6  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.799144  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2079  glycosyl transferase family 2  42.37 
 
 
401 aa  46.6  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.959735 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>