More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3138 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3138  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
236 aa  472  1e-132  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2341  glycosyl transferase family protein  80.52 
 
 
236 aa  390  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0140  glycosyl transferase family protein  51.26 
 
 
244 aa  225  4e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  33.65 
 
 
236 aa  84.7  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  33.17 
 
 
235 aa  75.9  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2111  glycosyl transferase family 2  36.13 
 
 
236 aa  73.9  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3183  glycosyl transferase family 2  30.36 
 
 
358 aa  73.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000292304  decreased coverage  0.0000016442 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3254  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.42 
 
 
314 aa  73.6  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2467  glycosyl transferase family protein  33.92 
 
 
322 aa  70.1  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1366  glycosyl transferase family protein  31.52 
 
 
247 aa  69.3  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  30.24 
 
 
335 aa  69.3  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0708  glycosyl transferase family protein  34.47 
 
 
235 aa  69.3  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0202797  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  35.38 
 
 
428 aa  68.9  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  31.3 
 
 
308 aa  68.9  0.00000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  32.68 
 
 
345 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0670  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
322 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.996244 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  29.95 
 
 
327 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2451  glycosyl transferase family 2  31.96 
 
 
222 aa  66.6  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0527  glycosyl transferase family protein  37.96 
 
 
374 aa  66.6  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.347971  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3194  glycosyl transferase family 2  29.77 
 
 
455 aa  65.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  30.85 
 
 
276 aa  65.5  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  28 
 
 
274 aa  65.5  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0947  glycosyl transferase family 2  30.22 
 
 
227 aa  65.5  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1742  glycosyltransferase  33.68 
 
 
281 aa  65.1  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  29.73 
 
 
309 aa  64.3  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1526  glycosyl transferase family 2  31.67 
 
 
227 aa  64.3  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000141803  normal  0.0950404 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1447  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 
233 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0726839  normal  0.0201369 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3111  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 
297 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3115  glycosyl transferase family 2  31.16 
 
 
235 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3171  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 
297 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675731  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  28.72 
 
 
289 aa  63.9  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  31.41 
 
 
230 aa  63.5  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1274  glycosyl transferase family 2  29.19 
 
 
303 aa  63.5  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2855  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  38.46 
 
 
123 aa  63.2  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1910  glycosyl transferase family 2  37.84 
 
 
622 aa  63.2  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00799183  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  28.17 
 
 
328 aa  63.2  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0746  glycosyl transferase family 2  27.64 
 
 
352 aa  62.8  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0487138  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2934  family 2 glycosyl transferase  42.42 
 
 
295 aa  62.8  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.349608 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1776  glycosyl transferase family 2  31.89 
 
 
311 aa  63.2  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1571  glycosyl transferase family 2  27.33 
 
 
342 aa  62.8  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.79772e-16 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  28.19 
 
 
420 aa  62.8  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2859  glycosyl transferase family protein  23.72 
 
 
291 aa  62.8  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0761346  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  29.23 
 
 
302 aa  62.4  0.000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  24.29 
 
 
302 aa  62  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0137  glycosyl transferase family protein  34.36 
 
 
296 aa  62  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.145337  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1200  glycosyl transferase family 2  31.1 
 
 
237 aa  61.6  0.000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1623  glycosyl transferase family protein  32.61 
 
 
224 aa  61.6  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.243447  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  30.95 
 
 
333 aa  61.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3556  glycosyl transferase family 2  29.11 
 
 
244 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0239607 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1548  glycosyl transferase family 2  37.96 
 
 
316 aa  60.5  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.566859  normal  0.346969 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  31.96 
 
 
230 aa  60.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1407  putative glycosyl transferase  25.23 
 
 
243 aa  60.8  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06181  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  27.23 
 
 
234 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.630616  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2271  glycosyl transferase family 2  30.94 
 
 
555 aa  60.1  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.464934  normal  0.787256 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2471  glycosyl transferase family 2  30.6 
 
 
311 aa  60.1  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1549  glycosyl transferase family 2  36.28 
 
 
308 aa  59.7  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26  normal  0.473314 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02661  glycosyltransferase  27.44 
 
 
248 aa  60.1  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4087  glycosyl transferase family protein  31.12 
 
 
336 aa  59.3  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445004  normal  0.177761 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2017  glycosyl transferase family protein  33.16 
 
 
322 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  34.42 
 
 
299 aa  59.3  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  29.7 
 
 
752 aa  58.9  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  28.88 
 
 
1015 aa  58.9  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  26.73 
 
 
528 aa  58.9  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2355  glycosyl transferase family protein  30.88 
 
 
232 aa  58.5  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0219  glycosyl transferase family protein  24.77 
 
 
247 aa  58.5  0.00000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1173  hypothetical protein  33.5 
 
 
422 aa  58.5  0.00000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  34.95 
 
 
544 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3586  glycosyl transferase family 2  39.78 
 
 
272 aa  58.5  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0435  glycosyltransferase  38 
 
 
512 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  28.12 
 
 
672 aa  58.5  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3897  glycosyl transferase family 2  25.68 
 
 
501 aa  58.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2889  glycosyltransferase-like  26.92 
 
 
316 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0938  glycosyl transferase family protein  39.18 
 
 
317 aa  57.8  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  29.08 
 
 
1124 aa  58.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05340  Glycosyl transferase, family 2  32.29 
 
 
321 aa  57.8  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000520172  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2333  glycosyl transferase family protein  26.74 
 
 
327 aa  58.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.012677  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  26.75 
 
 
310 aa  58.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2595  glycosyl transferase family protein  44.33 
 
 
256 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00230887  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0011  putative glycosyltransferase  39.8 
 
 
320 aa  57.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.171814  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1110  glycosyl transferase family 2  28.66 
 
 
227 aa  57  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0704361  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  29.02 
 
 
301 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3353  glycosyl transferase family protein  31.18 
 
 
312 aa  57.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3473  glycosyl transferase family 2  30.32 
 
 
228 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  30.47 
 
 
477 aa  57.4  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  28.97 
 
 
305 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3324  glycosyl transferase family protein  30.81 
 
 
487 aa  57  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.624929 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3563  glycosyl transferase family 2  30.96 
 
 
242 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.365642  normal  0.553979 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3392  glycosyl transferase family protein  26.8 
 
 
287 aa  57  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  25.94 
 
 
398 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0941  glycosyl transferase family 2  27.49 
 
 
376 aa  56.6  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  32.74 
 
 
414 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  30.96 
 
 
1101 aa  56.6  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0640  glycosyl transferase family 2  38.53 
 
 
321 aa  56.6  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4914  family 2 glycosyl transferase  24.08 
 
 
306 aa  56.2  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2643  family 2 glycosyl transferase  31.79 
 
 
321 aa  56.2  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  26.54 
 
 
374 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2811  glycosyl transferase family 2  27.48 
 
 
307 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.104457 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4933  N-acetylglucosaminyltransferase  23.18 
 
 
433 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.443938  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
305 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3641  glycosyl transferase family protein  31.71 
 
 
423 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144986  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>