More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1548 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1548  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
316 aa  646    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.566859  normal  0.346969 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1549  glycosyl transferase family 2  58.91 
 
 
308 aa  297  2e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26  normal  0.473314 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08980  glycosyl transferase  31.82 
 
 
329 aa  72.8  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.150997 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  23.29 
 
 
341 aa  67.8  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0715  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.22 
 
 
334 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.887983  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0636  family 2 glycosyl transferase  31.42 
 
 
785 aa  67.4  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.678698 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0380  glycosyl transferase family 2  38 
 
 
298 aa  67  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0706  glycosyl transferase group 2 family protein  26.22 
 
 
334 aa  67  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.912597  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2040  glycosyl transferase family 2  37.3 
 
 
386 aa  66.6  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.12763  normal  0.970209 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1081  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 
324 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0364187  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0249  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 
573 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0243  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 
573 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0992  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  29.74 
 
 
637 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  32.35 
 
 
317 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5165  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  29.01 
 
 
1168 aa  63.5  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1212  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  27.31 
 
 
946 aa  63.5  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.333736  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2781  glycosyl transferase family 2  32.67 
 
 
295 aa  63.2  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.217678 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0269  glycosyl transferase family protein  40.57 
 
 
346 aa  63.2  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  30.71 
 
 
333 aa  62.8  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0321  glycosyl transferase family protein  26.91 
 
 
342 aa  62  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0132  glycosyl transferase family 2  30.08 
 
 
403 aa  62  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.227934  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  35.29 
 
 
300 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3348  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
315 aa  62.4  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4914  family 2 glycosyl transferase  28.81 
 
 
306 aa  61.6  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2262  glycosyl transferase, group 2  30.04 
 
 
386 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 
326 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0784  glycosyl transferase family 2  28.39 
 
 
325 aa  60.8  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.33296  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2919  glycosyl transferase family protein  39.78 
 
 
271 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  37.4 
 
 
362 aa  60.1  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4959  glycosyl transferase family protein  26.24 
 
 
340 aa  60.1  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0171285 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1163  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  36.73 
 
 
275 aa  60.1  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0532064  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0177  putative glycosyl transferase  41.05 
 
 
268 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  29.05 
 
 
335 aa  59.7  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  35.54 
 
 
310 aa  59.7  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  23.33 
 
 
322 aa  59.7  0.00000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  30.09 
 
 
300 aa  59.3  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0488  glycosyl transferase family protein  33.08 
 
 
609 aa  59.3  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0655  glycosyl transferase  25.32 
 
 
346 aa  58.9  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0670645  normal  0.883616 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02310  glycosyl transferase  42.05 
 
 
354 aa  58.5  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  38.71 
 
 
230 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  28.84 
 
 
333 aa  58.5  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  37.63 
 
 
230 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3694  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.17 
 
 
266 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  26.27 
 
 
226 aa  57.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3759  glycosyl transferase family 2  39.78 
 
 
258 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03473  predicted glycosyl transferase  29.33 
 
 
344 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.320225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0090  glycosyl transferase family 2  29.33 
 
 
344 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  26.86 
 
 
672 aa  57.4  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4032  putative glycosyl transferase  27.65 
 
 
344 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0315657  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1199  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  27.88 
 
 
941 aa  57.8  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.457578 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3906  putative glycosyl transferase  28.57 
 
 
344 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66206  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3987  putative glycosyl transferase  27.65 
 
 
344 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0093  putative glycosyl transferase  29.33 
 
 
344 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.516407  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4118  putative glycosyl transferase  29.33 
 
 
344 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.910618  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03424  hypothetical protein  29.33 
 
 
344 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.245637  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  30.19 
 
 
326 aa  57.4  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3951  putative glycosyl transferase  29.33 
 
 
344 aa  57  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.174357  normal  0.660654 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1570  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
252 aa  57  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1145  general glycosylation pathway protein  22.65 
 
 
309 aa  57  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4042  putative glycosyl transferase  29.33 
 
 
344 aa  57.4  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1651  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.17 
 
 
266 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590239  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2888  glycosyl transferase family protein  36.08 
 
 
247 aa  56.6  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468847  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30120  Glycosyl transferase, family 2 protein  29.96 
 
 
328 aa  56.2  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  32.65 
 
 
325 aa  56.2  0.0000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0769  glycosyl transferase family 2  27.11 
 
 
352 aa  56.2  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 
302 aa  56.2  0.0000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2011  glycosyl transferase family 2  31.13 
 
 
335 aa  55.8  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.814426  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1270  general glycosylation pathway protein  23 
 
 
309 aa  55.8  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.553122  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3827  putative glycosyl transferase  29.02 
 
 
344 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0526095  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4093  putative glycosyl transferase  27.65 
 
 
344 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2038  glycosyl transferase family 2  27.54 
 
 
340 aa  55.8  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.723912 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  26.92 
 
 
988 aa  55.8  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  29.25 
 
 
326 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0299  teichoic acid biosynthesis protein X, putative  24.44 
 
 
354 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.192136  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2017  glycosyl transferase family 2  27.95 
 
 
324 aa  54.7  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000864394 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1282  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  35.56 
 
 
269 aa  54.7  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1271  glycosyltransferase  29.17 
 
 
237 aa  54.3  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2900  glycosyl transferase family 2  39.78 
 
 
349 aa  54.7  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  34.15 
 
 
300 aa  54.3  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3925  putative glycosyl transferase  27.65 
 
 
344 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3066  glycosyl transferase family protein  32.43 
 
 
402 aa  54.7  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3023  glycosyl transferase family 2  31.86 
 
 
323 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  27.18 
 
 
344 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  29.25 
 
 
326 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  42.57 
 
 
326 aa  54.7  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0186  glycosyl transferase family protein  32.73 
 
 
348 aa  55.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2528  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
307 aa  53.9  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.591132  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  29.25 
 
 
326 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0522  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  28.81 
 
 
729 aa  54.3  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  32.29 
 
 
310 aa  53.9  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2371  glycosyltransferase  26.34 
 
 
326 aa  53.9  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1424  glycosyltransferase-like protein  23.22 
 
 
385 aa  53.9  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0593  general glycosylation pathway protein  22.3 
 
 
309 aa  53.5  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.422601  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3970  glycosyl transferase family protein  26 
 
 
252 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.827134  normal  0.0578688 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1853  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.1 
 
 
274 aa  53.5  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00329609  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0754  glycosyl transferase family 2  25.42 
 
 
341 aa  53.5  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.909004 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  36.84 
 
 
321 aa  53.5  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3044  glycosyl transferase family protein  31.63 
 
 
297 aa  53.9  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  26.94 
 
 
1991 aa  53.5  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2583  glycosyl transferase family 2  28.78 
 
 
296 aa  53.9  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.373197 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>