More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0299 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0299  teichoic acid biosynthesis protein X, putative  100 
 
 		 354 aa  735    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.192136  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0678  glycosyl transferase family protein  34.75 
 
 		 353 aa  229  4e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0663  glycosyl transferase family protein  34.75 
 
 		 353 aa  229  4e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  34.65 
 
 		 330 aa  88.2  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1847  glycosyl transferase family 2  26.47 
 
 		 1116 aa  85.5  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.944284  normal  0.0115409 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  38.66 
 
 		 326 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12320  glycosyl transferase  31 
 
 		 343 aa  84.7  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  37.39 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  35.29 
 
 		 326 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3987  putative glycosyl transferase  36.09 
 
 		 344 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4032  putative glycosyl transferase  36.09 
 
 		 344 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0315657  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03473  predicted glycosyl transferase  36.23 
 
 		 344 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.320225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0090  glycosyl transferase family 2  36.23 
 
 		 344 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0093  putative glycosyl transferase  36.23 
 
 		 344 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.516407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1212  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  27.63 
 
 		 946 aa  81.6  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.333736  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03424  hypothetical protein  36.23 
 
 		 344 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.245637  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  36.13 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3951  putative glycosyl transferase  36.23 
 
 		 344 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.174357  normal  0.660654 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3906  putative glycosyl transferase  36.84 
 
 		 344 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66206  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4118  putative glycosyl transferase  35.17 
 
 		 344 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.910618  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4042  putative glycosyl transferase  35.29 
 
 		 344 aa  81.3  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3827  putative glycosyl transferase  36.23 
 
 		 344 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0526095  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  27.4 
 
 		 386 aa  80.5  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3925  putative glycosyl transferase  36.09 
 
 		 344 aa  80.5  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  28.85 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  25.88 
 
 		 398 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4093  putative glycosyl transferase  36.09 
 
 		 344 aa  80.1  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  34.45 
 
 		 326 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0754  glycosyl transferase family 2  27.11 
 
 		 341 aa  79.7  0.00000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.909004 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1429  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.08 
 
 		 327 aa  79  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5387  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.76 
 
 		 350 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5438  N-acetylglucosaminyltransferase  30.23 
 
 		 353 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0784  glycosyl transferase family 2  25.37 
 
 		 325 aa  78.6  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.33296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  28.18 
 
 		 1035 aa  79  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1362  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 		 324 aa  78.6  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  35.29 
 
 		 326 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  35.83 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0176  glycosyl transferase family 2  30.37 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.020767  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3520  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.18 
 
 		 323 aa  76.6  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  35.04 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  33.8 
 
 		 333 aa  76.6  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1087  glycosyl transferase family 2  35.25 
 
 		 209 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.674225 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  27.19 
 
 		 322 aa  75.5  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0898  sugar transferase  29.17 
 
 		 333 aa  75.5  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.137243  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 		 390 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1203  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  26.48 
 
 		 616 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.811759 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  37.3 
 
 		 341 aa  75.1  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  26.07 
 
 		 390 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  35.25 
 
 		 345 aa  74.3  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 323 aa  74.3  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0118  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.89 
 
 		 351 aa  73.9  0.000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000526958 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4087  glycosyl transferase family protein  24.91 
 
 		 336 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445004  normal  0.177761 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0098  glycosyltransferase-like protein  25 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000850354 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  23.58 
 
 		 397 aa  73.6  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  37.61 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  38.94 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  35.51 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2881  glycosyl transferase family protein  45.36 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  36.21 
 
 		 689 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  29.06 
 
 		 276 aa  72.8  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0058  glycosyl transferase family 2  33.88 
 
 		 337 aa  72.8  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.246717 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1085  glycosyl transferase family 2  31.08 
 
 		 329 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  33.05 
 
 		 327 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  26.47 
 
 		 344 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1479  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  36.44 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0517693  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1309  glycosyl transferase family 2  26.55 
 
 		 272 aa  72.4  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  39.39 
 
 		 349 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26480  glycosyl transferase  28.57 
 
 		 672 aa  72.8  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  39.34 
 
 		 373 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1327  hypothetical protein  38.83 
 
 		 338 aa  71.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0232591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  42.61 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08980  glycosyl transferase  29.49 
 
 		 329 aa  72  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.150997 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  31.75 
 
 		 380 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2759  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 340 aa  71.2  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  25 
 
 		 327 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  25 
 
 		 327 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.69 
 
 		 327 aa  70.9  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.69 
 
 		 327 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0636  family 2 glycosyl transferase  23.65 
 
 		 785 aa  70.5  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.678698 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1165  glycosyl transferase CpsO(V)  26.89 
 
 		 327 aa  70.1  0.00000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0353426  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1242  glycosyltransferase  24.91 
 
 		 389 aa  70.5  0.00000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000038464  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  33.05 
 
 		 352 aa  70.1  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0353  glycosyl transferase family 2  38.26 
 
 		 354 aa  70.1  0.00000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  26.24 
 
 		 1157 aa  69.7  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  35.34 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0808  glycosyl transferase family 2  32.88 
 
 		 334 aa  69.7  0.00000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227461  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0703  glycosyl transferase family 2  27.64 
 
 		 348 aa  69.7  0.00000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.39468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1692  glycosyl transferase family protein  28.3 
 
 		 518 aa  69.7  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  26.97 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  34.78 
 
 		 318 aa  69.3  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1690  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 		 518 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0342764  hitchhiker  0.00101578 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1268  glycosyl transferase family 2  41.05 
 
 		 369 aa  69.3  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.6355  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.22 
 
 		 327 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  26.24 
 
 		 1032 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  38.24 
 
 		 321 aa  68.9  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1697  glycosyl transferase family 2  29.06 
 
 		 366 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.696391  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2370  glycosyltransferase  35 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1428  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 		 244 aa  68.9  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  24.22 
 
 		 327 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  26.88 
 
 		 789 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>