More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0176 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0176  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 285 aa  595  1e-169  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.020767  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0448  glycosyl transferase family protein  53.38 
 
 		 282 aa  330  1e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0726747  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07655  glycosyltransferase  45.91 
 
 		 285 aa  298  8e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.445114  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1390  glycosyl transferase family protein  36.21 
 
 		 302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2342  glycosyl transferase family protein  33.18 
 
 		 307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2775  glycosyl transferase family protein  34.8 
 
 		 332 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2546  glycosyl transferase family 2  30.94 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.143441 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3567  glycosyl transferase family 2  30.94 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4273  glycosyl transferase family protein  32.58 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174616  normal  0.314255 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2963  glycosyl transferase family 2  29.57 
 
 		 330 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2871  glycosyl transferase family 2  29.57 
 
 		 330 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3186  glycosyl transferase family 2  31.51 
 
 		 322 aa  105  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1075  glycosyl transferase family 2  31.08 
 
 		 312 aa  105  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.475969  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1115  glycosyltransferase  24.65 
 
 		 318 aa  101  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0967  glycosyl transferase family protein  32.2 
 
 		 288 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0219  glycosyl transferase family protein  29.9 
 
 		 247 aa  85.9  7e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  32.45 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0299  teichoic acid biosynthesis protein X, putative  30.37 
 
 		 354 aa  77  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.192136  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1840  cell wall membrane glycosyltransferase  30.51 
 
 		 308 aa  77.4  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0722  glycosyl transferase family protein  25.37 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.178232  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  25.77 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  29.7 
 
 		 1154 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  34.04 
 
 		 689 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  31.06 
 
 		 330 aa  72  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  26.47 
 
 		 327 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  31.91 
 
 		 495 aa  70.5  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1327  hypothetical protein  37.19 
 
 		 338 aa  70.1  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0232591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  32 
 
 		 332 aa  70.1  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0314  glycosyl transferase family protein  35.66 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.06758  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  31.73 
 
 		 373 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  27.22 
 
 		 1120 aa  68.9  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2700  glycosyl transferase family 2  26.97 
 
 		 584 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00534164 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1146  glycosyl transferase family protein  27.68 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.811113 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0778  glycosyl transferase family 2  33.08 
 
 		 384 aa  67.8  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  28.41 
 
 		 398 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  30.08 
 
 		 1115 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  30.7 
 
 		 872 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2329  glycosyl transferase family 2  28.03 
 
 		 344 aa  66.6  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3460  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.83 
 
 		 330 aa  67  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1330  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.99 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.472766  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  29.82 
 
 		 927 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  28.42 
 
 		 235 aa  67  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  29.82 
 
 		 1115 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  29.82 
 
 		 1119 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1272  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 		 494 aa  66.2  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102707  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  32.12 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  29.82 
 
 		 1115 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0938  glycosyl transferase family protein  34.03 
 
 		 317 aa  65.9  0.0000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  37.07 
 
 		 672 aa  65.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  35.33 
 
 		 374 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  23.56 
 
 		 334 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  31.45 
 
 		 425 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0011  glycosyl transferase family 2  31.01 
 
 		 291 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000912491 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3764  N-glycosyltransferase  31.45 
 
 		 425 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  32.52 
 
 		 1099 aa  64.3  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  28.07 
 
 		 1115 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  26.07 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0120  glycosyl transferase family protein  33.62 
 
 		 375 aa  64.3  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2252  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.01 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  26.09 
 
 		 752 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  46.15 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  31.64 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1844  glycosyl transferase family 2  30.56 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0377  glycosyl transferase family 2  29.93 
 
 		 523 aa  63.9  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3180  glycosyl transferase family 2  33.6 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  24.17 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0218  glycosyl transferase family protein  31.4 
 
 		 379 aa  63.2  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1007  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.67 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000779145  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.51 
 
 		 367 aa  63.2  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0362  glycosyl transferase family protein  29.84 
 
 		 364 aa  63.2  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.279909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2088  AMP-dependent synthetase and ligase  30.51 
 
 		 807 aa  63.2  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  24.86 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1013  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 		 812 aa  63.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3906  putative glycosyl transferase  28.24 
 
 		 344 aa  63.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66206  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07275  glycosyl transferase  32.06 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.170431  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  32.54 
 
 		 395 aa  63.2  0.000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3652  glycosyl transferase family 2  29.66 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0575879  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22610  glycosyl transferase  31.39 
 
 		 497 aa  62.8  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.634128  normal  0.441487 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5661  hypothetical protein  24.51 
 
 		 355 aa  62.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  28.18 
 
 		 337 aa  62.4  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2790  N-glycosyltransferase  27.64 
 
 		 418 aa  62.4  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.347496  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1123  glycosyl transferase family protein  36.79 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1455  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.59 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.937083  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3925  putative glycosyl transferase  27.48 
 
 		 344 aa  62.4  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2822  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 317 aa  62  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1536  glycosyl transferase family 2  34.88 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  32.59 
 
 		 330 aa  62  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  27.87 
 
 		 367 aa  62  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1479  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.62 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0517693  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0005  glycosyl transferase  36.05 
 
 		 708 aa  62  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.164795  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1309  glycosyl transferase family 2  28.83 
 
 		 272 aa  62  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1763  glycosyl transferase family 2  25.81 
 
 		 333 aa  62  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4104  glycosyl transferase family protein  25.64 
 
 		 512 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  25.81 
 
 		 363 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1158  glycosyl transferase family protein  40 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1087  glycosyl transferase family 2  29.13 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.674225 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0614  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  48.39 
 
 		 529 aa  61.2  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.597487 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>