More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1075 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1075  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 312 aa  649    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.475969  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3186  glycosyl transferase family 2  80.77 
 
 		 322 aa  541  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0967  glycosyl transferase family protein  56.89 
 
 		 288 aa  341  1e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1390  glycosyl transferase family protein  43.53 
 
 		 302 aa  235  7e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2546  glycosyl transferase family 2  35.02 
 
 		 304 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.143441 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3567  glycosyl transferase family 2  35.02 
 
 		 306 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2871  glycosyl transferase family 2  34.88 
 
 		 330 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2963  glycosyl transferase family 2  34.88 
 
 		 330 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2342  glycosyl transferase family protein  34.14 
 
 		 307 aa  160  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2775  glycosyl transferase family protein  32.86 
 
 		 332 aa  149  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4273  glycosyl transferase family protein  30.63 
 
 		 310 aa  138  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174616  normal  0.314255 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0722  glycosyl transferase family protein  25.42 
 
 		 294 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.178232  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0448  glycosyl transferase family protein  26.99 
 
 		 282 aa  116  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0726747  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0176  glycosyl transferase family 2  31.08 
 
 		 285 aa  105  9e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.020767  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1115  glycosyltransferase  26.42 
 
 		 318 aa  100  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07655  glycosyltransferase  29.03 
 
 		 285 aa  86.7  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.445114  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  25.56 
 
 		 322 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  24.89 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  31.05 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  27.12 
 
 		 398 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  28.97 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  29 
 
 		 1032 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0161  glycosyl transferase family 2  30.16 
 
 		 475 aa  62.8  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  27.93 
 
 		 397 aa  62.8  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  27.22 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5661  hypothetical protein  24.12 
 
 		 355 aa  62.4  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3897  glycosyl transferase family 2  25.21 
 
 		 501 aa  62  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.2 
 
 		 367 aa  61.6  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  28.41 
 
 		 341 aa  61.2  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  29.28 
 
 		 1120 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  25.11 
 
 		 872 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  27.01 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  33.86 
 
 		 1118 aa  60.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  29.51 
 
 		 349 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4087  glycosyl transferase family protein  25.5 
 
 		 336 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445004  normal  0.177761 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3648  hypothetical protein  30.53 
 
 		 365 aa  60.1  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  23.38 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1158  glycosyl transferase family protein  24.62 
 
 		 403 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  30 
 
 		 1115 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 		 344 aa  59.3  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  29.79 
 
 		 927 aa  59.3  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3305  glycosyl transferase family protein  36.63 
 
 		 342 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  29.1 
 
 		 1115 aa  58.5  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  25.54 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1593  glycosyl transferase family protein  30.16 
 
 		 425 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.901855  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  29.79 
 
 		 1115 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  30 
 
 		 1119 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0847  glycosyl transferase family 2  26.49 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1850  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.29 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.492055  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  24.64 
 
 		 1154 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0952  glycosyl transferase family 2  26.94 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2627  glycosyl transferase family protein  26.15 
 
 		 425 aa  57.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.528621  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1840  cell wall membrane glycosyltransferase  28.32 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0071  glycosyl transferase family 2  34.85 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  26.26 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  29.17 
 
 		 1115 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  23.39 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  30.25 
 
 		 337 aa  57  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3393  glycosyl transferase family protein  30.56 
 
 		 324 aa  57  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0266  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.52 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0443  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  25.52 
 
 		 382 aa  56.6  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000679717 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0674  glycosyl transferase family 2  27.81 
 
 		 382 aa  56.2  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0984  glycosyl transferase family 2  27.37 
 
 		 393 aa  56.2  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00499556  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  27.91 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  28.89 
 
 		 461 aa  56.2  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  27.27 
 
 		 412 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0219  glycosyl transferase family protein  25.29 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  26.14 
 
 		 412 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  26.82 
 
 		 1177 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0757  glycosyl transferase family 2  29.82 
 
 		 384 aa  55.8  0.0000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.122576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  27.14 
 
 		 1099 aa  55.8  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  26.14 
 
 		 441 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  26.14 
 
 		 441 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  25.28 
 
 		 380 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 303 aa  55.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  25.93 
 
 		 321 aa  55.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  26.14 
 
 		 441 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3499  glycosyl transferase family 2  29.32 
 
 		 497 aa  55.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.802267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0430  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  24.62 
 
 		 642 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3791  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.17 
 
 		 317 aa  55.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2370  glycosyltransferase  31.36 
 
 		 319 aa  55.1  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  22.86 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03901  glycosyl transferase  28.91 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.56256  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  26.14 
 
 		 441 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  26.14 
 
 		 441 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2700  glycosyl transferase family 2  29.29 
 
 		 584 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00534164 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  26.5 
 
 		 306 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3612  glycosyl transferase family 2  26.42 
 
 		 479 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0273319  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  28.09 
 
 		 1101 aa  54.7  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0120  glycosyl transferase family protein  26.47 
 
 		 375 aa  54.7  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2431  glycosyl transferase family 2  26.56 
 
 		 397 aa  55.1  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1778  glycosyl transferase family 2  24.19 
 
 		 292 aa  55.1  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345176  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  30.88 
 
 		 341 aa  54.3  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  33.68 
 
 		 390 aa  54.7  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  35.79 
 
 		 390 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1851  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.6 
 
 		 214 aa  53.9  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  25.65 
 
 		 1124 aa  53.9  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1529  glycosyl transferase family 2  25.6 
 
 		 214 aa  53.9  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.322486  normal  0.0695414 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0584  glycosyl transferase family protein  26.15 
 
 		 481 aa  53.9  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>