More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0448 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0448  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
282 aa  582  1.0000000000000001e-165  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0726747  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0176  glycosyl transferase family 2  53.38 
 
 
285 aa  330  1e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.020767  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07655  glycosyltransferase  53.19 
 
 
285 aa  308  5.9999999999999995e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.445114  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1390  glycosyl transferase family protein  30.63 
 
 
302 aa  152  5e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2963  glycosyl transferase family 2  28.38 
 
 
330 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2871  glycosyl transferase family 2  27.95 
 
 
330 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2342  glycosyl transferase family protein  30.28 
 
 
307 aa  125  7e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0967  glycosyl transferase family protein  30.93 
 
 
288 aa  123  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3567  glycosyl transferase family 2  27.3 
 
 
306 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2775  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 
332 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2546  glycosyl transferase family 2  27.3 
 
 
304 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.143441 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1075  glycosyl transferase family 2  26.99 
 
 
312 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.475969  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4273  glycosyl transferase family protein  28.27 
 
 
310 aa  115  6.9999999999999995e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174616  normal  0.314255 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3186  glycosyl transferase family 2  27.76 
 
 
322 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1115  glycosyltransferase  23.83 
 
 
318 aa  86.7  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  30.53 
 
 
330 aa  73.9  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3648  hypothetical protein  27.31 
 
 
365 aa  73.6  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0161  glycosyl transferase family 2  32.5 
 
 
475 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0722  glycosyl transferase family protein  25.93 
 
 
294 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.178232  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  31.3 
 
 
373 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0299  teichoic acid biosynthesis protein X, putative  27.41 
 
 
354 aa  66.2  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.192136  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  30.17 
 
 
235 aa  65.5  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 
398 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1742  glycosyltransferase  30.4 
 
 
281 aa  64.3  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  25 
 
 
1120 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0219  glycosyl transferase family protein  29.78 
 
 
247 aa  64.3  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2790  N-glycosyltransferase  28.1 
 
 
418 aa  63.5  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.347496  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0938  glycosyl transferase family protein  32.73 
 
 
317 aa  63.5  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  25.21 
 
 
752 aa  62.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  28.67 
 
 
1099 aa  62.4  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0778  glycosyl transferase family 2  28.24 
 
 
384 aa  62  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1112  glycosyl transferase family 8  30.08 
 
 
1014 aa  60.5  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2088  AMP-dependent synthetase and ligase  30.09 
 
 
807 aa  60.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0377  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
523 aa  60.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3827  putative glycosyl transferase  25.19 
 
 
344 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0526095  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  23.85 
 
 
321 aa  59.7  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3658  glycosyl transferase family protein  33.06 
 
 
349 aa  59.7  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3738  glycosyl transferase family 2  30.58 
 
 
279 aa  59.3  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01470  glycosyl transferase  31.82 
 
 
481 aa  58.9  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.312762  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0968  hypothetical protein  33.86 
 
 
235 aa  58.9  0.00000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.683686  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1571  glycosyl transferase family 2  31.45 
 
 
342 aa  58.5  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.79772e-16 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1930  glycosyl transferase family 2  25.7 
 
 
246 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000462816 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  27.59 
 
 
236 aa  58.2  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1013  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 
812 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3460  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.27 
 
 
330 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  30.71 
 
 
689 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  28.03 
 
 
380 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  25.23 
 
 
637 aa  57  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0752  N-glycosyltransferase  31.4 
 
 
433 aa  57  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4118  putative glycosyl transferase  24.44 
 
 
344 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.910618  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0487  glycosyl transferase family 2  24.89 
 
 
284 aa  57.4  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  25.98 
 
 
322 aa  57  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  25.81 
 
 
344 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03473  predicted glycosyl transferase  24.44 
 
 
344 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.320225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0090  glycosyl transferase family 2  24.44 
 
 
344 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0093  putative glycosyl transferase  24.44 
 
 
344 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.516407  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03424  hypothetical protein  24.44 
 
 
344 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.245637  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0746  glycosyl transferase family 2  36.19 
 
 
352 aa  56.6  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0487138  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0985  glycosyl transferase family 2  29.93 
 
 
482 aa  56.6  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.576527  hitchhiker  0.00119227 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1913  glycosyl transferase family 2  26.09 
 
 
286 aa  56.2  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2089  glycosyl transferase family 2  29.32 
 
 
493 aa  56.2  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3497  glycosyl transferase family protein  28.36 
 
 
496 aa  56.2  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  27.63 
 
 
373 aa  56.2  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1840  cell wall membrane glycosyltransferase  27.13 
 
 
308 aa  55.8  0.0000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2582  glycosyl transferase family 2  24.76 
 
 
1038 aa  55.8  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601969  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  25.12 
 
 
1124 aa  55.8  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3499  glycosyl transferase family 2  27.01 
 
 
497 aa  55.8  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.802267  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3951  putative glycosyl transferase  23.7 
 
 
344 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.174357  normal  0.660654 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  30.58 
 
 
1032 aa  55.8  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2085  glycosyl transferase family 2  29.13 
 
 
262 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.545808  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2061  glycosyl transferase family 2  29.13 
 
 
262 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  27.48 
 
 
307 aa  55.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  29.66 
 
 
345 aa  54.7  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  29.66 
 
 
324 aa  55.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  26.87 
 
 
1154 aa  55.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4042  putative glycosyl transferase  24.81 
 
 
344 aa  55.5  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2759  glycosyl transferase family protein  26.27 
 
 
340 aa  55.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  25.99 
 
 
374 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0802  glycosyl transferase family 2  27.12 
 
 
338 aa  55.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.865033  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  29.85 
 
 
495 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1844  glycosyl transferase family 2  28 
 
 
387 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 
397 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1763  glycosyl transferase family 2  26.23 
 
 
333 aa  54.7  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  25.16 
 
 
379 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1408  glycosyl transferase family protein  25.42 
 
 
930 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.266781 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0010  glycosyl transferase family protein  25.41 
 
 
275 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.591764  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0550  glycosyl transferase family protein  44.83 
 
 
391 aa  54.7  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000102779  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0849  glycosyl transferase family 2  26.27 
 
 
336 aa  54.7  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  26.87 
 
 
347 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2334  glycosyl transferase family 2  29.51 
 
 
417 aa  53.9  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.876722  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3183  glycosyl transferase family 2  28.69 
 
 
358 aa  53.9  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000292304  decreased coverage  0.0000016442 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  29.1 
 
 
704 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1536  glycosyl transferase family 2  29.92 
 
 
238 aa  53.9  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1627  glycosyl transferase family protein  33.91 
 
 
234 aa  53.9  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0667673  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5661  hypothetical protein  26.4 
 
 
355 aa  53.1  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0179  N-glycosyltransferase  28.93 
 
 
451 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574055  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3090  glycosyl transferase family protein  27.41 
 
 
310 aa  53.1  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.933883  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2458  glycosyl transferase family protein  25.37 
 
 
774 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.745195  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2628  glycosyl transferase family protein  26.23 
 
 
350 aa  53.1  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0011  glycosyl transferase family 2  23.37 
 
 
291 aa  53.1  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000912491 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>