173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2089 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2089  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
493 aa  1018    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0985  glycosyl transferase family 2  62.67 
 
 
482 aa  582  1.0000000000000001e-165  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.576527  hitchhiker  0.00119227 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01470  glycosyl transferase  60.86 
 
 
481 aa  570  1e-161  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.312762  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3497  glycosyl transferase family protein  60.05 
 
 
496 aa  549  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0161  glycosyl transferase family 2  39.16 
 
 
475 aa  257  4e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3499  glycosyl transferase family 2  35.28 
 
 
497 aa  250  4e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.802267  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2958  glycosyl transferase family 2  28.35 
 
 
395 aa  147  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3648  hypothetical protein  27.59 
 
 
365 aa  110  8.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3764  N-glycosyltransferase  25.61 
 
 
425 aa  84.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  25.61 
 
 
425 aa  84.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0288  N-glycosyltransferase  25.24 
 
 
424 aa  84.3  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393224  normal  0.0606217 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3117  N-glycosyltransferase  25.25 
 
 
421 aa  83.2  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3010  N-glycosyltransferase  24.92 
 
 
421 aa  82.4  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3658  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 
349 aa  82.4  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2925  N-glycosyltransferase  26.1 
 
 
421 aa  81.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0377  glycosyl transferase family 2  27.48 
 
 
523 aa  77.4  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  26.97 
 
 
1099 aa  73.9  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2129  N-glycosyltransferase  24.81 
 
 
444 aa  73.9  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.772993  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2143  N-glycosyltransferase  24.81 
 
 
444 aa  73.9  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.382592  normal  0.0135691 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2239  N-glycosyltransferase  24.81 
 
 
444 aa  73.9  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.423629  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4484  N-glycosyltransferase  25.15 
 
 
423 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.230285  normal  0.930554 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1942  N-glycosyltransferase  26.69 
 
 
423 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4264  N-glycosyltransferase  25.89 
 
 
423 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219891  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3513  N-glycosyltransferase  26.55 
 
 
423 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4102  N-glycosyltransferase  25.89 
 
 
423 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0468214  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3421  N-glycosyltransferase  25.89 
 
 
423 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.543844  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3996  N-glycosyltransferase  26.55 
 
 
423 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.706651  normal  0.0922124 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2293  N-glycosyltransferase  26.39 
 
 
412 aa  72  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00369291  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04326  N-glycosyltransferase  25.87 
 
 
417 aa  72.4  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.780445  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2718  N-glycosyltransferase  25.78 
 
 
418 aa  70.9  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0752  N-glycosyltransferase  21.67 
 
 
433 aa  70.1  0.00000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  22.75 
 
 
441 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  22.75 
 
 
441 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  22.75 
 
 
441 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2790  N-glycosyltransferase  25.48 
 
 
418 aa  68.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.347496  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  22.75 
 
 
412 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  22.75 
 
 
441 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  22.75 
 
 
441 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  22.75 
 
 
412 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0179  N-glycosyltransferase  26.71 
 
 
451 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574055  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  24.81 
 
 
1120 aa  67.4  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4608  N-glycosyltransferase  23.11 
 
 
442 aa  64.7  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  24.02 
 
 
399 aa  64.3  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  24.02 
 
 
399 aa  64.3  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  22.71 
 
 
442 aa  63.9  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  25.31 
 
 
410 aa  63.2  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  23.22 
 
 
1124 aa  62  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  25.29 
 
 
1101 aa  61.2  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2158  glycosyltransferase  24.54 
 
 
452 aa  59.3  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  26.54 
 
 
509 aa  59.3  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39140  Glycosyl transferase, family 2  23.71 
 
 
863 aa  58.2  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0104614  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  23.9 
 
 
752 aa  57.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  23.25 
 
 
395 aa  57.4  0.0000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  23.66 
 
 
1118 aa  57.4  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1593  glycosyl transferase family protein  24.12 
 
 
425 aa  57  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.901855  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1390  glycosyl transferase family protein  31.06 
 
 
302 aa  56.6  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5289  glycosyl transferase family 2  23.24 
 
 
403 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4777  glycosyl transferase family 2  23.47 
 
 
393 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.340207 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0448  glycosyl transferase family protein  29.32 
 
 
282 aa  55.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0726747  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  24.07 
 
 
433 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5030  glycosyl transferase family protein  24.16 
 
 
433 aa  55.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2600  glycosyl transferase family protein  25.74 
 
 
919 aa  55.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0728813  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  21.71 
 
 
1115 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1332  glycosyl transferase family protein  25.39 
 
 
831 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0376589 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5361  N-acetylglucosaminyltransferase  23.02 
 
 
433 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.190593  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4933  N-acetylglucosaminyltransferase  23.7 
 
 
433 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.443938  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5327  glycosyl transferase, group 2 family  23.7 
 
 
433 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76631e-28 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4918  glycosyl transferase  23.7 
 
 
433 aa  53.9  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0768338  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  24.8 
 
 
637 aa  53.9  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5356  glycosyl transferase domain-containing protein  23.7 
 
 
433 aa  53.9  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  21.75 
 
 
927 aa  53.9  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  23.17 
 
 
872 aa  53.5  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  21.75 
 
 
1119 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  23.2 
 
 
461 aa  53.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  21.32 
 
 
1115 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  21.75 
 
 
1115 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  21.71 
 
 
1115 aa  52.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07655  glycosyltransferase  31.71 
 
 
285 aa  52.8  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.445114  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0081  glycosyltransferase  20.61 
 
 
435 aa  51.6  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000323026  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1562  glycosyl transferase family protein  19.94 
 
 
435 aa  51.6  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3771  glycosyl transferase family protein  23.79 
 
 
433 aa  51.6  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1742  glycosyltransferase  25.77 
 
 
281 aa  51.2  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  24.43 
 
 
549 aa  51.2  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  21.29 
 
 
1002 aa  51.2  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0176  glycosyl transferase family 2  30.53 
 
 
285 aa  50.8  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.020767  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  23.19 
 
 
495 aa  51.2  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  22.48 
 
 
411 aa  50.4  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1272  glycosyl transferase family 2  21.88 
 
 
494 aa  50.4  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102707  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0967  glycosyl transferase family protein  26.2 
 
 
288 aa  50.4  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3677  glycosyl transferase family 2  25.7 
 
 
479 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1338  glycosyl transferase family protein  27.13 
 
 
772 aa  49.7  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2715  glycosyl transferase family protein  25.18 
 
 
395 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1840  cell wall membrane glycosyltransferase  27.12 
 
 
308 aa  49.3  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3140  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.62 
 
 
395 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.648773 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1524  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.41 
 
 
842 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.566497  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3933  glycosyl transferase family 2  22.03 
 
 
423 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3521  glycosyl transferase family protein  25.36 
 
 
479 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1474  glycosyltransferase  21.92 
 
 
447 aa  48.1  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3641  glycosyl transferase family protein  22.33 
 
 
423 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144986  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1085  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
329 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>