169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_01470 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_01470  glycosyl transferase  100 
 
 
481 aa  987    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.312762  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3497  glycosyl transferase family protein  64.72 
 
 
496 aa  629  1e-179  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0985  glycosyl transferase family 2  61.65 
 
 
482 aa  601  1.0000000000000001e-171  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.576527  hitchhiker  0.00119227 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2089  glycosyl transferase family 2  60.86 
 
 
493 aa  560  1e-158  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0161  glycosyl transferase family 2  36.6 
 
 
475 aa  240  4e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3499  glycosyl transferase family 2  33.26 
 
 
497 aa  221  3e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.802267  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2958  glycosyl transferase family 2  30.26 
 
 
395 aa  166  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3648  hypothetical protein  27.08 
 
 
365 aa  97.4  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0377  glycosyl transferase family 2  27.48 
 
 
523 aa  81.6  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3658  glycosyl transferase family protein  29.39 
 
 
349 aa  79.3  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0288  N-glycosyltransferase  24.71 
 
 
424 aa  70.5  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393224  normal  0.0606217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  26.6 
 
 
752 aa  66.6  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  25.88 
 
 
1099 aa  65.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  25.65 
 
 
395 aa  64.7  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  25.76 
 
 
549 aa  64.3  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3764  N-glycosyltransferase  23.14 
 
 
425 aa  64.7  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  23.14 
 
 
425 aa  64.7  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2718  N-glycosyltransferase  26.17 
 
 
418 aa  61.6  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  26.06 
 
 
509 aa  61.2  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  26.05 
 
 
1120 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4484  N-glycosyltransferase  23.42 
 
 
423 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.230285  normal  0.930554 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0448  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 
282 aa  58.9  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0726747  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1390  glycosyl transferase family protein  31.76 
 
 
302 aa  58.9  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0176  glycosyl transferase family 2  32.84 
 
 
285 aa  58.2  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.020767  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4777  glycosyl transferase family 2  24.07 
 
 
393 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.340207 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1942  N-glycosyltransferase  24.12 
 
 
423 aa  57  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  26.48 
 
 
428 aa  57  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5289  glycosyl transferase family 2  23.02 
 
 
403 aa  56.6  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4794  glycosyl transferase family protein  26.17 
 
 
406 aa  56.6  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1280  glycosyl transferase family protein  23.03 
 
 
889 aa  55.8  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0531421  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  23.72 
 
 
412 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  23.72 
 
 
412 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0472996 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  23.72 
 
 
441 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  23.72 
 
 
441 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2293  N-glycosyltransferase  21 
 
 
412 aa  55.5  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00369291  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0179  N-glycosyltransferase  23.85 
 
 
451 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574055  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3513  N-glycosyltransferase  23.1 
 
 
423 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0967  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 
288 aa  55.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1593  glycosyl transferase family protein  23.26 
 
 
425 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.901855  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07655  glycosyltransferase  29.13 
 
 
285 aa  55.8  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.445114  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  23.72 
 
 
441 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  23.72 
 
 
441 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  23.72 
 
 
441 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3996  N-glycosyltransferase  23.1 
 
 
423 aa  55.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.706651  normal  0.0922124 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  24.53 
 
 
1101 aa  54.7  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  23.37 
 
 
1154 aa  53.9  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  26.85 
 
 
333 aa  53.9  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2790  N-glycosyltransferase  22.31 
 
 
418 aa  53.5  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.347496  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  22.6 
 
 
1002 aa  53.5  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04326  N-glycosyltransferase  22.05 
 
 
417 aa  53.5  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.780445  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1742  glycosyltransferase  27.31 
 
 
281 aa  53.5  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  48.08 
 
 
235 aa  53.5  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  22.71 
 
 
1124 aa  53.5  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  23.86 
 
 
1118 aa  52.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2905  glycosyl transferase family protein  23.05 
 
 
395 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  21.18 
 
 
403 aa  52.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  23.62 
 
 
461 aa  52.4  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4264  N-glycosyltransferase  22.96 
 
 
423 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219891  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4102  N-glycosyltransferase  22.96 
 
 
423 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0468214  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2617  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 
328 aa  52.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  22.06 
 
 
442 aa  52.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3421  N-glycosyltransferase  22.96 
 
 
423 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.543844  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00787  cellulose synthase catalytic subunit  19.07 
 
 
707 aa  52  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4562  glycosyl transferase family protein  34.19 
 
 
651 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.829181  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4650  glycosyl transferase family protein  34.19 
 
 
651 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.492865  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4945  glycosyl transferase family protein  34.19 
 
 
651 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.420909  normal  0.200608 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  47.27 
 
 
331 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  22.44 
 
 
399 aa  51.2  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  22.44 
 
 
399 aa  51.2  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1272  glycosyl transferase family 2  22.18 
 
 
494 aa  51.2  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102707  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0663  hypothetical protein  29.08 
 
 
376 aa  50.4  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  23.23 
 
 
694 aa  50.4  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4608  N-glycosyltransferase  21.94 
 
 
442 aa  50.4  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1698  glycosyl transferase family 2  23.7 
 
 
844 aa  49.7  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000612337  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2925  N-glycosyltransferase  23.67 
 
 
421 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1474  glycosyltransferase  23.15 
 
 
447 aa  49.7  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  42.86 
 
 
236 aa  50.1  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1675  glycosyl transferase family 2  26.9 
 
 
415 aa  49.7  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  19.16 
 
 
872 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3738  glycosyl transferase family 2  40 
 
 
279 aa  49.3  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2023  family 2 glycosyl transferase  27.97 
 
 
292 aa  48.5  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2129  N-glycosyltransferase  21.71 
 
 
444 aa  48.9  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.772993  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0595  glycosyl transferase family protein  21.74 
 
 
402 aa  48.5  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2143  N-glycosyltransferase  21.71 
 
 
444 aa  48.9  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.382592  normal  0.0135691 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5030  glycosyl transferase family protein  24.14 
 
 
433 aa  49.3  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2239  N-glycosyltransferase  21.71 
 
 
444 aa  48.9  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.423629  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3010  N-glycosyltransferase  22.33 
 
 
421 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3442  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.16 
 
 
253 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.184184  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1330  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.08 
 
 
294 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.472766  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1807  glycosyl transferase family 2  37.62 
 
 
222 aa  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5361  N-acetylglucosaminyltransferase  22.96 
 
 
433 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.190593  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  18.51 
 
 
1115 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  19.62 
 
 
1115 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  18.51 
 
 
927 aa  47.8  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3117  N-glycosyltransferase  22 
 
 
421 aa  47.8  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3521  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 
479 aa  47.8  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  25.83 
 
 
322 aa  47.8  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0443  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  27.97 
 
 
382 aa  47.8  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000679717 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0266  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.17 
 
 
408 aa  47.4  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2170  glycosyl transferase family 2  45.1 
 
 
532 aa  47.4  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>