242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4794 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4794  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 406 aa  815    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5289  glycosyl transferase family 2  39.07 
 
 		 403 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2905  glycosyl transferase family protein  49.03 
 
 		 395 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4777  glycosyl transferase family 2  38.99 
 
 		 393 aa  259  8e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.340207 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2574  glycosyl transferase family protein  46.59 
 
 		 395 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2715  glycosyl transferase family protein  48.14 
 
 		 395 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3140  glycosyl transferase, group 2 family protein  46.31 
 
 		 395 aa  256  7e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.648773 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1009  glycosyl transferase family protein  44.51 
 
 		 410 aa  249  6e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.411292  normal  0.902987 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1811  glycosyl transferase family protein  35.25 
 
 		 401 aa  152  8.999999999999999e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1704  glycosyl transferase family 2  33.88 
 
 		 398 aa  149  9e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1378  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.17 
 
 		 396 aa  147  3e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.80225 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2079  glycosyl transferase family 2  30.94 
 
 		 401 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.959735 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1852  glycosyl transferase family 2  31.83 
 
 		 397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1434  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.1 
 
 		 396 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1675  glycosyl transferase family 2  27.73 
 
 		 415 aa  107  6e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2374  glycosyl transferase family protein  42.79 
 
 		 380 aa  106  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.222982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0837  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.41 
 
 		 411 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1138  glycosyltransferase, group 2 family protein  28.28 
 
 		 411 aa  102  2e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2334  glycosyl transferase family 2  27.04 
 
 		 417 aa  95.9  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.876722  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1842  cell wall membrane glycosyltransferase  27.99 
 
 		 407 aa  95.1  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.606296  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1788  glycosyl transferase family protein  24.52 
 
 		 418 aa  95.1  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0177  glycosyl transferase family 2  29.08 
 
 		 425 aa  94  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00145418  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0333  glycosyl transferase family 2  25.07 
 
 		 420 aa  90.1  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2328  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.55 
 
 		 466 aa  88.6  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.417791  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2042  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.55 
 
 		 466 aa  87.8  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1099  glycosyl transferase family protein  24.21 
 
 		 437 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0201328  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0370  glycosyl transferase family 2  26.53 
 
 		 438 aa  80.5  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0460104  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1411  glycosyl transferase family protein  29.79 
 
 		 424 aa  80.5  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.584249 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1210  glycosyl transferase family 2  26.13 
 
 		 444 aa  74.7  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.47071  normal  0.038027 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0835  glycosyl transferase family 2  25.58 
 
 		 435 aa  73.6  0.000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.445477  hitchhiker  0.00049802 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3658  glycosyl transferase family protein  30.49 
 
 		 349 aa  73.2  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0377  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 		 523 aa  67.4  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1549  glycosyl transferase family protein  34 
 
 		 228 aa  62  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1593  glycosyl transferase family protein  25.86 
 
 		 425 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.901855  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4704  glycosyl transferase family 2  28.13 
 
 		 483 aa  61.2  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0279225  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05405  putative glycosyltransferase  35.96 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.507881  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2627  glycosyl transferase family protein  32.6 
 
 		 425 aa  60.5  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.528621  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3553  glycosyl transferase family 2  29.44 
 
 		 456 aa  60.1  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0550  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 391 aa  59.3  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000102779  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1403  glycosyl transferase family 2  31.62 
 
 		 434 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0691788  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1499  glycosyl transferase family 2  30.16 
 
 		 432 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0824671  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0167  glycosyl transferase family 2  31.48 
 
 		 365 aa  58.9  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00277804  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0383  glycosyl transferase family protein  27.44 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.138846  normal  0.0930893 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2958  glycosyl transferase family 2  28.62 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1988  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 		 445 aa  58.2  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0218  glycosyl transferase family protein  19.82 
 
 		 379 aa  57.8  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2456  glycosyl transferase family protein  32.47 
 
 		 432 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130133  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  25.99 
 
 		 509 aa  57  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0652  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  41.23 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.218524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1041  glycosyl transferase family protein  41.05 
 
 		 222 aa  57  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0213116 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01470  glycosyl transferase  26.17 
 
 		 481 aa  56.2  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.312762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0166  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  35.64 
 
 		 513 aa  55.8  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.873802  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  26.42 
 
 		 461 aa  55.8  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  34.17 
 
 		 355 aa  55.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0452  putative glycosyl transferase  25.21 
 
 		 332 aa  55.1  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0581  glycosyl transferase family protein  34.88 
 
 		 228 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.529493  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0161  glycosyl transferase family 2  25.94 
 
 		 475 aa  55.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1090  glycosyl transferase family protein  38 
 
 		 236 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.11948  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9270  glycosyltransferase-like protein  41.57 
 
 		 243 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  25.17 
 
 		 1118 aa  55.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0396  glycosyl transferase family protein  37.21 
 
 		 229 aa  55.1  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.54121  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3708  glycosyl transferase family 2  21.95 
 
 		 403 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal  0.144342 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1366  glycosyl transferase family protein  34.88 
 
 		 228 aa  54.7  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000927738 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1438  glycosyl transferase family 2  36.67 
 
 		 213 aa  53.9  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.192606  normal  0.0852028 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3499  glycosyl transferase family 2  26.12 
 
 		 497 aa  53.9  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.802267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0837  glycosyl transferase family 2  37.08 
 
 		 253 aa  53.5  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1305  glycosyl transferase family protein  32.63 
 
 		 229 aa  53.5  0.000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4238  glycosyl transferase family protein  34.86 
 
 		 332 aa  53.1  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.440412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1232  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 481 aa  53.1  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  35.29 
 
 		 1120 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1142  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  38.3 
 
 		 321 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1563  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 		 252 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.633792  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0734  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 230 aa  52.4  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0939265  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  26.9 
 
 		 752 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  22.11 
 
 		 1115 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2254  glycosyl transferase family 2  24.81 
 
 		 486 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0096  glycosyl transferase family 2  38.83 
 
 		 382 aa  51.2  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.86731 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2824  glycosyl transferase family 2  31.15 
 
 		 375 aa  51.6  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0593  glycosyl transferase family protein  42.65 
 
 		 268 aa  51.2  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1457  glycosyl transferase family protein  38.14 
 
 		 356 aa  51.6  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.7433 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1698  glycosyl transferase family 2  23.47 
 
 		 844 aa  51.2  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000612337  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  34.83 
 
 		 336 aa  51.2  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  21.56 
 
 		 1115 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  22.71 
 
 		 927 aa  51.2  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  22.71 
 
 		 1115 aa  50.8  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  23.23 
 
 		 403 aa  50.8  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3947  glycosyl transferase family 2  25.19 
 
 		 445 aa  50.8  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1795  glycosyl transferase family 2  33.02 
 
 		 357 aa  50.4  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00120607  normal  0.517558 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  22.71 
 
 		 1119 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3137  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 		 261 aa  50.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2961  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  37.37 
 
 		 334 aa  50.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.720485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  36.36 
 
 		 291 aa  50.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1592  glycosyl transferase family protein  37.62 
 
 		 346 aa  50.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1390  glycosyl transferase family protein  30.19 
 
 		 302 aa  50.1  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0083  glycosyltransferase  26.8 
 
 		 228 aa  50.1  0.00007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.413849  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1377  glycosyl transferase family protein  36.04 
 
 		 323 aa  50.1  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0520964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  22.22 
 
 		 872 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2190  glycosyl transferase family 2  22.97 
 
 		 450 aa  50.1  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  22.7 
 
 		 399 aa  50.1  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  22.7 
 
 		 399 aa  50.1  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>