More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1704 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1704  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 398 aa  815    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1811  glycosyl transferase family protein  73.05 
 
 		 401 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1378  glycosyl transferase, group 2 family protein  61.58 
 
 		 396 aa  514  1e-144  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.80225 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1852  glycosyl transferase family 2  67.65 
 
 		 397 aa  507  9.999999999999999e-143  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2079  glycosyl transferase family 2  36.99 
 
 		 401 aa  229  8e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.959735 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1675  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 		 415 aa  161  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1099  glycosyl transferase family protein  32.69 
 
 		 437 aa  159  6e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0201328  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2328  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.63 
 
 		 466 aa  159  6e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.417791  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0177  glycosyl transferase family 2  30.42 
 
 		 425 aa  159  7e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00145418  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2042  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.63 
 
 		 466 aa  159  8e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1788  glycosyl transferase family protein  32.61 
 
 		 418 aa  157  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4794  glycosyl transferase family protein  34.08 
 
 		 406 aa  146  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5289  glycosyl transferase family 2  32.35 
 
 		 403 aa  145  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0837  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  38.55 
 
 		 411 aa  145  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0333  glycosyl transferase family 2  27.71 
 
 		 420 aa  145  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4777  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 		 393 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.340207 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2334  glycosyl transferase family 2  29.72 
 
 		 417 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.876722  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1411  glycosyl transferase family protein  35.1 
 
 		 424 aa  136  8e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.584249 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1434  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.33 
 
 		 396 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1210  glycosyl transferase family 2  28.84 
 
 		 444 aa  132  9e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.47071  normal  0.038027 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0370  glycosyl transferase family 2  27.04 
 
 		 438 aa  130  3e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0460104  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1009  glycosyl transferase family protein  32.21 
 
 		 410 aa  122  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.411292  normal  0.902987 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0835  glycosyl transferase family 2  25.32 
 
 		 435 aa  116  6.9999999999999995e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.445477  hitchhiker  0.00049802 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1138  glycosyltransferase, group 2 family protein  27.37 
 
 		 411 aa  113  5e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2715  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 395 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3140  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.98 
 
 		 395 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.648773 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2574  glycosyl transferase family protein  30.71 
 
 		 395 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2905  glycosyl transferase family protein  31.35 
 
 		 395 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1842  cell wall membrane glycosyltransferase  27.18 
 
 		 407 aa  105  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.606296  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1499  glycosyl transferase family 2  28.53 
 
 		 432 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0824671  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1403  glycosyl transferase family 2  30.37 
 
 		 434 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0691788  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2456  glycosyl transferase family protein  31.98 
 
 		 432 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130133  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0081  glycosyltransferase  28.69 
 
 		 435 aa  88.6  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000323026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1562  glycosyl transferase family protein  26.51 
 
 		 435 aa  86.7  6e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3853  glycosyl transferase family 2  26.35 
 
 		 396 aa  86.7  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  25.5 
 
 		 420 aa  83.6  0.000000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  25.19 
 
 		 475 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  25.19 
 
 		 475 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3583  glycosyl transferase family protein  23.94 
 
 		 395 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  25.44 
 
 		 495 aa  80.5  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  23.81 
 
 		 509 aa  76.6  0.0000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1988  glycosyl transferase family 2  28.06 
 
 		 445 aa  76.6  0.0000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  23.65 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5356  glycosyl transferase domain-containing protein  23.85 
 
 		 433 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4918  glycosyl transferase  23.39 
 
 		 433 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0768338  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4933  N-acetylglucosaminyltransferase  23.39 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.443938  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4093  glycosyl transferase family protein  25.1 
 
 		 863 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.363982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5327  glycosyl transferase, group 2 family  23.39 
 
 		 433 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76631e-28 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5030  glycosyl transferase family protein  23.21 
 
 		 433 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1272  glycosyl transferase family 2  26.22 
 
 		 494 aa  75.5  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102707  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  26.95 
 
 		 461 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5361  N-acetylglucosaminyltransferase  23.19 
 
 		 433 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.190593  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3708  glycosyl transferase family 2  24.26 
 
 		 403 aa  73.6  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal  0.144342 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3771  glycosyl transferase family protein  23.51 
 
 		 433 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0430  glycosyl transferase family 2  24.4 
 
 		 473 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.912379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21281  glycosyl transferase family protein  27.89 
 
 		 438 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.133481  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1526  beta-(1-3)-glucosyl transferase, putative  23.95 
 
 		 863 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.166405 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1135  glycosyl transferase family protein  23.95 
 
 		 862 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67659 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4198  glycosyl transferase family protein  23.95 
 
 		 863 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80228  normal  0.702129 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3861  glycosyl transferase family 2  27.99 
 
 		 397 aa  71.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0793444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1089  glycosyl transferase family protein  23.95 
 
 		 885 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1257  glycosyl transferase family protein  27.49 
 
 		 438 aa  70.5  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2749  glycosyl transferase family protein  26.63 
 
 		 502 aa  70.5  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924892  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  24.84 
 
 		 399 aa  70.5  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0377  glycosyl transferase family 2  27.2 
 
 		 523 aa  70.5  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1593  glycosyl transferase family protein  25.5 
 
 		 425 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.901855  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0652  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  38.05 
 
 		 301 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.218524  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  24.74 
 
 		 441 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  24.74 
 
 		 441 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  24.74 
 
 		 441 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4425  glycosyl transferase family 2  29.24 
 
 		 476 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  24.74 
 
 		 441 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  24.74 
 
 		 412 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  24.74 
 
 		 441 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5398  glycosyl transferase family 2  24.9 
 
 		 507 aa  68.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.298595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22610  glycosyl transferase  24.52 
 
 		 497 aa  68.6  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.634128  normal  0.441487 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  24.74 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2217  glycosyl transferase family protein  26.94 
 
 		 468 aa  68.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  29.05 
 
 		 1154 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1375  glycosyl transferase family 2  22.34 
 
 		 433 aa  67.4  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2190  glycosyl transferase family 2  25.94 
 
 		 450 aa  67.4  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  24.85 
 
 		 1120 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0166  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  25.3 
 
 		 513 aa  67  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.873802  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5020  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.92 
 
 		 390 aa  67  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971161  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0166  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  26.18 
 
 		 391 aa  67  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0635  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 		 471 aa  66.6  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00269925  normal  0.0269839 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  26.52 
 
 		 505 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  27.17 
 
 		 520 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0060  putative glycosyltransferase  25.1 
 
 		 439 aa  65.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4704  glycosyl transferase family 2  25.41 
 
 		 483 aa  65.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0279225  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4949  glycosyl transferase family protein  24.16 
 
 		 446 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816666  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1811  glycosyl transferase family protein  24.55 
 
 		 402 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000206288  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  24.85 
 
 		 1099 aa  65.1  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  26.42 
 
 		 1101 aa  65.5  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2904  glycosyl transferase family protein  23.8 
 
 		 546 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2627  glycosyl transferase family protein  25.44 
 
 		 425 aa  65.1  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.528621  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0057  putative glycosyltransferase  24.72 
 
 		 443 aa  64.7  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  24.47 
 
 		 476 aa  64.7  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  27.51 
 
 		 662 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39140  Glycosyl transferase, family 2  22.46 
 
 		 863 aa  63.9  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0104614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>