More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1852 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1852  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
397 aa  815    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1811  glycosyl transferase family protein  70.92 
 
 
401 aa  559  1e-158  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1704  glycosyl transferase family 2  67.65 
 
 
398 aa  525  1e-148  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1378  glycosyl transferase, group 2 family protein  62.88 
 
 
396 aa  510  1e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.80225 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2079  glycosyl transferase family 2  35.13 
 
 
401 aa  203  4e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.959735 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5289  glycosyl transferase family 2  34.07 
 
 
403 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0177  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 
425 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00145418  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0837  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  38.15 
 
 
411 aa  154  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1675  glycosyl transferase family 2  29.5 
 
 
415 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1099  glycosyl transferase family protein  30.12 
 
 
437 aa  149  7e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0201328  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1788  glycosyl transferase family protein  26.15 
 
 
418 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2328  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.97 
 
 
466 aa  144  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.417791  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2042  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.97 
 
 
466 aa  144  4e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2334  glycosyl transferase family 2  29.32 
 
 
417 aa  143  6e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.876722  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4777  glycosyl transferase family 2  31.3 
 
 
393 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.340207 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0333  glycosyl transferase family 2  25.13 
 
 
420 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0370  glycosyl transferase family 2  26.44 
 
 
438 aa  139  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0460104  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4794  glycosyl transferase family protein  32.6 
 
 
406 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1434  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.01 
 
 
396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1411  glycosyl transferase family protein  32.1 
 
 
424 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.584249 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0835  glycosyl transferase family 2  25.96 
 
 
435 aa  123  5e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.445477  hitchhiker  0.00049802 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1009  glycosyl transferase family protein  32.41 
 
 
410 aa  123  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.411292  normal  0.902987 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3140  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.83 
 
 
395 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.648773 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2574  glycosyl transferase family protein  30.56 
 
 
395 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2715  glycosyl transferase family protein  29.7 
 
 
395 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1210  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
444 aa  118  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.47071  normal  0.038027 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2905  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
395 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1138  glycosyltransferase, group 2 family protein  27.93 
 
 
411 aa  110  4.0000000000000004e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1842  cell wall membrane glycosyltransferase  27.16 
 
 
407 aa  109  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.606296  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  24.74 
 
 
509 aa  101  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2456  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
432 aa  93.6  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130133  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  25.65 
 
 
475 aa  93.2  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1403  glycosyl transferase family 2  29.21 
 
 
434 aa  93.2  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0691788  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  25.65 
 
 
475 aa  93.2  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1499  glycosyl transferase family 2  26.8 
 
 
432 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0824671  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0430  glycosyl transferase family 2  26.1 
 
 
473 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.912379  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3708  glycosyl transferase family 2  26.92 
 
 
403 aa  87.4  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal  0.144342 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2749  glycosyl transferase family protein  29.3 
 
 
502 aa  84  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924892  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2217  glycosyl transferase family protein  25.31 
 
 
468 aa  82.8  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368513  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0166  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  24.43 
 
 
391 aa  82.8  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5356  glycosyl transferase domain-containing protein  25.58 
 
 
433 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5030  glycosyl transferase family protein  25.48 
 
 
433 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4918  glycosyl transferase  25.19 
 
 
433 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0768338  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5327  glycosyl transferase, group 2 family  25.19 
 
 
433 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76631e-28 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3853  glycosyl transferase family 2  26.47 
 
 
396 aa  80.9  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  25.58 
 
 
433 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5361  N-acetylglucosaminyltransferase  25.97 
 
 
433 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.190593  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3771  glycosyl transferase family protein  26.02 
 
 
433 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3583  glycosyl transferase family protein  23.48 
 
 
395 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4933  N-acetylglucosaminyltransferase  24.81 
 
 
433 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.443938  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0218  glycosyl transferase family protein  27.89 
 
 
379 aa  78.6  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1562  glycosyl transferase family protein  23.19 
 
 
435 aa  77.8  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4425  glycosyl transferase family 2  23.97 
 
 
476 aa  76.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  25.8 
 
 
461 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2627  glycosyl transferase family protein  25.6 
 
 
425 aa  75.9  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.528621  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1083  glycosyltransferase  25.27 
 
 
458 aa  75.1  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014105 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1811  glycosyl transferase family protein  23.92 
 
 
402 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000206288  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  25.1 
 
 
420 aa  74.7  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  25.32 
 
 
495 aa  74.3  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1988  glycosyl transferase family 2  30.08 
 
 
445 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0166  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  25.82 
 
 
513 aa  73.2  0.000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.873802  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0081  glycosyltransferase  25.31 
 
 
435 aa  72.8  0.000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000323026  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3301  family 2 glycosyl transferase  29.75 
 
 
469 aa  71.6  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144563  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4704  glycosyl transferase family 2  26.24 
 
 
483 aa  70.9  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0279225  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3861  glycosyl transferase family 2  27.43 
 
 
397 aa  71.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0793444  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1135  glycosyl transferase family protein  23.22 
 
 
862 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.67659 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0383  glycosyl transferase family protein  23.99 
 
 
443 aa  70.1  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.138846  normal  0.0930893 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2119  glycosyl transferase family 2  23.66 
 
 
402 aa  70.1  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000829457  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  29.1 
 
 
1154 aa  69.7  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2049  glycosyl transferase family 2  23.39 
 
 
402 aa  69.7  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.695075  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1526  beta-(1-3)-glucosyl transferase, putative  22.85 
 
 
863 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.166405 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0377  glycosyl transferase family 2  26.53 
 
 
523 aa  69.3  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4198  glycosyl transferase family protein  22.85 
 
 
863 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80228  normal  0.702129 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  26.07 
 
 
422 aa  67.4  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  22.26 
 
 
395 aa  66.6  0.0000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4093  glycosyl transferase family protein  22.85 
 
 
863 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.363982  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5398  glycosyl transferase family 2  24.29 
 
 
507 aa  66.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.298595  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5020  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.79 
 
 
390 aa  65.9  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971161  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0057  putative glycosyltransferase  25.9 
 
 
443 aa  66.2  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1964  cell wall biogenesis glycosyltransferase  23.97 
 
 
395 aa  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000036966 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2190  glycosyl transferase family 2  26.28 
 
 
450 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0984  glycosyl transferase family 2  21.62 
 
 
393 aa  64.7  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00499556  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  23.24 
 
 
476 aa  64.7  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02219  hypothetical protein  23.49 
 
 
398 aa  63.9  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2958  glycosyl transferase family 2  25.29 
 
 
395 aa  64.3  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21281  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 
438 aa  63.5  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.133481  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  26.37 
 
 
403 aa  63.5  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0635  glycosyl transferase family protein  25.21 
 
 
471 aa  63.5  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00269925  normal  0.0269839 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18491  glycosyl transferase family protein  24.35 
 
 
433 aa  63.5  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.249822  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  24.24 
 
 
1099 aa  62.4  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0060  putative glycosyltransferase  24.79 
 
 
439 aa  62.8  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1657  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 
732 aa  62.4  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0588308  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003542  putative intercellular adhesion protein A  23.49 
 
 
395 aa  62.4  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1257  glycosyl transferase family protein  26.83 
 
 
438 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1751  glycosyl transferase family protein  25.22 
 
 
433 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.121941  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0161  glycosyl transferase family 2  27.64 
 
 
475 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1292  glycosyl transferase family protein  23.19 
 
 
642 aa  61.6  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  24.88 
 
 
411 aa  62  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  23.48 
 
 
549 aa  62  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  25.4 
 
 
752 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>