More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0835 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0835  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 435 aa  905    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.445477  hitchhiker  0.00049802 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1210  glycosyl transferase family 2  47.06 
 
 		 444 aa  390  1e-107  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.47071  normal  0.038027 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1138  glycosyltransferase, group 2 family protein  38.63 
 
 		 411 aa  297  2e-79  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1842  cell wall membrane glycosyltransferase  37.62 
 
 		 407 aa  294  2e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.606296  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1675  glycosyl transferase family 2  33.02 
 
 		 415 aa  219  6e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2328  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.81 
 
 		 466 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.417791  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2042  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.81 
 
 		 466 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1788  glycosyl transferase family protein  31.71 
 
 		 418 aa  206  7e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0177  glycosyl transferase family 2  31.12 
 
 		 425 aa  201  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00145418  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2334  glycosyl transferase family 2  32.11 
 
 		 417 aa  196  6e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.876722  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0333  glycosyl transferase family 2  31.09 
 
 		 420 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1099  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 		 437 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0201328  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0370  glycosyl transferase family 2  30.07 
 
 		 438 aa  170  5e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0460104  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1411  glycosyl transferase family protein  26.93 
 
 		 424 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.584249 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2079  glycosyl transferase family 2  24.52 
 
 		 401 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.959735 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1499  glycosyl transferase family 2  26.73 
 
 		 432 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0824671  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1403  glycosyl transferase family 2  26.48 
 
 		 434 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0691788  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2456  glycosyl transferase family protein  25.77 
 
 		 432 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130133  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0837  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  26.72 
 
 		 411 aa  114  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1704  glycosyl transferase family 2  29.92 
 
 		 398 aa  114  5e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1852  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 		 397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1811  glycosyl transferase family protein  24.67 
 
 		 401 aa  103  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1378  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.3 
 
 		 396 aa  103  6e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.80225 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  27.3 
 
 		 495 aa  99  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4777  glycosyl transferase family 2  25.69 
 
 		 393 aa  94.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.340207 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5289  glycosyl transferase family 2  25.25 
 
 		 403 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  26.43 
 
 		 475 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  26.43 
 
 		 475 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22610  glycosyl transferase  27.23 
 
 		 497 aa  87.4  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.634128  normal  0.441487 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0060  putative glycosyltransferase  23.24 
 
 		 439 aa  87  6e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1272  glycosyl transferase family 2  27.08 
 
 		 494 aa  83.2  0.000000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102707  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3708  glycosyl transferase family 2  24.85 
 
 		 403 aa  80.5  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal  0.144342 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0081  glycosyltransferase  25.3 
 
 		 435 aa  79.7  0.00000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000323026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2749  glycosyl transferase family protein  24.41 
 
 		 502 aa  78.2  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924892  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  24.79 
 
 		 505 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1562  glycosyl transferase family protein  25.32 
 
 		 435 aa  78.2  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21281  glycosyl transferase family protein  25.52 
 
 		 438 aa  78.2  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.133481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  24.79 
 
 		 520 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2217  glycosyl transferase family protein  24.87 
 
 		 468 aa  77  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1009  glycosyl transferase family protein  25.35 
 
 		 410 aa  76.6  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.411292  normal  0.902987 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  24.79 
 
 		 662 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  24.02 
 
 		 395 aa  75.9  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3549  glycosyl transferase family protein  23.27 
 
 		 614 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.877744 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3225  glycosyl transferase family protein  23.27 
 
 		 596 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0693647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1257  glycosyl transferase family protein  25.1 
 
 		 438 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  24.52 
 
 		 633 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3853  glycosyl transferase family 2  24.63 
 
 		 396 aa  74.7  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  24.09 
 
 		 1154 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0430  glycosyl transferase family 2  22.2 
 
 		 473 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.912379  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3301  family 2 glycosyl transferase  25.75 
 
 		 469 aa  73.6  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144563  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0057  putative glycosyltransferase  22.68 
 
 		 443 aa  73.6  0.000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1083  glycosyltransferase  22.22 
 
 		 458 aa  73.6  0.000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014105 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1627  cell wall biogenesis glycosyltransferase  23.1 
 
 		 656 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0402312  normal  0.167793 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2574  glycosyl transferase family protein  25.1 
 
 		 395 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3140  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.5 
 
 		 395 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.648773 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4794  glycosyl transferase family protein  28.46 
 
 		 406 aa  72  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1434  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.63 
 
 		 396 aa  71.2  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  25.38 
 
 		 1115 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  26.2 
 
 		 1115 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  26.2 
 
 		 1115 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2905  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 		 395 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  25.6 
 
 		 927 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  25.9 
 
 		 1115 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4704  glycosyl transferase family 2  25.91 
 
 		 483 aa  70.9  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0279225  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  25.15 
 
 		 872 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  22.99 
 
 		 509 aa  70.5  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4425  glycosyl transferase family 2  25.46 
 
 		 476 aa  70.1  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  25.9 
 
 		 1119 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2715  glycosyl transferase family protein  25.7 
 
 		 395 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0431  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.25 
 
 		 532 aa  68.2  0.0000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.802283  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3771  glycosyl transferase family protein  22.22 
 
 		 433 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1949  General secretory system II protein E domain protein  21.87 
 
 		 612 aa  67.8  0.0000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  23.59 
 
 		 509 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2861  glycosyl transferase family protein  23.79 
 
 		 678 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.623061  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3420  glycosyl transferase family 2  23.36 
 
 		 616 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18491  glycosyl transferase family protein  22.82 
 
 		 433 aa  67  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.249822  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2958  glycosyl transferase family 2  24.21 
 
 		 395 aa  66.2  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0852  glycosyl transferase family protein  24.05 
 
 		 520 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1333  glycosyl transferase family protein  24.05 
 
 		 520 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0984  glycosyl transferase family 2  23.17 
 
 		 393 aa  65.9  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00499556  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1315  glycosyl transferase family protein  24.05 
 
 		 520 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3861  glycosyl transferase family 2  24.15 
 
 		 397 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0793444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0965  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  22.36 
 
 		 644 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0998  glycosyl transferase family protein  26.87 
 
 		 686 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.759416  normal  0.641778 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5361  N-acetylglucosaminyltransferase  23.38 
 
 		 433 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.190593  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5398  glycosyl transferase family 2  24.9 
 
 		 507 aa  66.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.298595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  25.81 
 
 		 789 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0166  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  23.47 
 
 		 391 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  25.81 
 
 		 789 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  23.38 
 
 		 433 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0332  response regulator receiver protein  28.06 
 
 		 806 aa  65.9  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112355  normal  0.937153 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5030  glycosyl transferase family protein  23.38 
 
 		 433 aa  65.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  25.81 
 
 		 789 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4933  N-acetylglucosaminyltransferase  23.38 
 
 		 433 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.443938  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  23.84 
 
 		 422 aa  65.1  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1064  glycosyl transferase family protein  23.18 
 
 		 650 aa  64.7  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.132947 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  25.62 
 
 		 476 aa  64.7  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5356  glycosyl transferase domain-containing protein  23.38 
 
 		 433 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  24.14 
 
 		 549 aa  64.3  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1988  glycosyl transferase family 2  23.48 
 
 		 445 aa  64.3  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>