More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3225 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3549  glycosyl transferase family protein  94.79 
 
 		 614 aa  906    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.877744 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3420  glycosyl transferase family 2  85.66 
 
 		 616 aa  880    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3225  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 596 aa  1156    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0693647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2861  glycosyl transferase family protein  57.2 
 
 		 678 aa  488  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.623061  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1627  cell wall biogenesis glycosyltransferase  57.01 
 
 		 656 aa  451  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0402312  normal  0.167793 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3769  glycosyl transferase family protein  53.63 
 
 		 632 aa  445  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997629  normal  0.300264 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2888  glycosyl transferase family 2  43.74 
 
 		 615 aa  331  3e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233699 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4110  glycosyl transferase family protein  40.87 
 
 		 626 aa  329  7e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656691  normal  0.773085 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0424  glycosyl transferase family protein  44.69 
 
 		 652 aa  323  7e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.32532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1292  glycosyl transferase family protein  38.72 
 
 		 642 aa  318  2e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2855  glycosyl transferase family 2  39.2 
 
 		 624 aa  310  4e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.875286 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1064  glycosyl transferase family protein  42.65 
 
 		 650 aa  307  3e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.132947 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1949  General secretory system II protein E domain protein  47.07 
 
 		 612 aa  301  3e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2964  glycosyl transferase family 2  42.41 
 
 		 476 aa  298  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0324251  hitchhiker  0.00721921 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2382  glycosyl transferase family protein  41.7 
 
 		 678 aa  294  3e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0379  glycosyl transferase family protein  37.74 
 
 		 626 aa  293  7e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0721  general secretion pathway protein E  37.01 
 
 		 606 aa  288  2e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.831257  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.96 
 
 		 573 aa  285  1.0000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0014  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.59 
 
 		 656 aa  281  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0886  glycosyl transferases  40.62 
 
 		 673 aa  280  8e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0296  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.36 
 
 		 630 aa  278  3e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0431  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.98 
 
 		 532 aa  276  7e-73  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.802283  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0577  glycosyltransferase  38.75 
 
 		 664 aa  272  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2931  glycosyl transferase family 2  41.36 
 
 		 664 aa  272  1e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0998  glycosyl transferase family protein  43.93 
 
 		 686 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.759416  normal  0.641778 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5168  glycosyl transferase family 2  43.74 
 
 		 683 aa  266  7e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0496  glycosyl transferase family protein  43.72 
 
 		 537 aa  254  3e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.741629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1245  glycosyl transferase family protein  39.95 
 
 		 654 aa  250  4e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.620003 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0525  hypothetical protein  40 
 
 		 464 aa  248  3e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0547  hypothetical protein  40 
 
 		 464 aa  248  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0535  hypothetical protein  40 
 
 		 417 aa  247  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0207  hypothetical protein  38.36 
 
 		 475 aa  246  8e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0980  glycosyl transferase family 2  40.16 
 
 		 512 aa  245  1.9999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2166  general secretion pathway protein E  36.04 
 
 		 698 aa  243  7e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2388  glycosyl transferase  37.13 
 
 		 635 aa  242  1e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.445397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3092  hypothetical protein  42.29 
 
 		 492 aa  239  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3200  glycosyl transferase family protein  33.03 
 
 		 848 aa  233  7.000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2295  glycosyl transferase family protein  38.37 
 
 		 509 aa  231  3e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0659  general secretion pathway protein E  38.22 
 
 		 628 aa  229  8e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.814938  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0522  general secretion pathway protein E  40.43 
 
 		 636 aa  229  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.450126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1872  glycosyl transferase family protein  40.43 
 
 		 604 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0203  glycosyl transferase family protein  40.5 
 
 		 465 aa  176  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.678813  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0149  glycosyl transferase family protein  50.57 
 
 		 450 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.975549 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0209  putative glycosyl transferase  41.4 
 
 		 219 aa  145  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0145  glycosyl transferase  40.59 
 
 		 216 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.51395  normal  0.856095 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5030  glycosyl transferase family protein  27.15 
 
 		 433 aa  104  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3771  glycosyl transferase family protein  30.42 
 
 		 433 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4863  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 		 461 aa  103  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907872  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4918  glycosyl transferase  30.42 
 
 		 433 aa  102  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0768338  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4933  N-acetylglucosaminyltransferase  30.42 
 
 		 433 aa  102  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.443938  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5327  glycosyl transferase, group 2 family  30.42 
 
 		 433 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76631e-28 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5356  glycosyl transferase domain-containing protein  30.42 
 
 		 433 aa  101  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0965  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.78 
 
 		 644 aa  102  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5361  N-acetylglucosaminyltransferase  30.42 
 
 		 433 aa  102  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.190593  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  30.42 
 
 		 433 aa  101  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0635  glycosyl transferase family protein  32.18 
 
 		 471 aa  99.8  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00269925  normal  0.0269839 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4704  glycosyl transferase family 2  29.4 
 
 		 483 aa  99.4  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0279225  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0984  glycosyl transferase family 2  27.53 
 
 		 393 aa  92.4  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00499556  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0070  glycosyl transferase family 2  34.11 
 
 		 431 aa  91.7  4e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  27.65 
 
 		 399 aa  87.8  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0370  glycosyl transferase family 2  28.11 
 
 		 438 aa  87.4  6e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0460104  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 475 aa  87  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 475 aa  87  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 		 420 aa  86.3  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  25.82 
 
 		 395 aa  83.6  0.000000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0081  glycosyltransferase  27.78 
 
 		 435 aa  83.2  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000323026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  25.69 
 
 		 549 aa  80.9  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0430  glycosyl transferase family 2  25.91 
 
 		 473 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.912379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  30.38 
 
 		 410 aa  78.6  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 		 509 aa  78.2  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4949  glycosyl transferase family protein  29.27 
 
 		 446 aa  77.4  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816666  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1099  glycosyl transferase family protein  26.17 
 
 		 437 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0201328  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0835  glycosyl transferase family 2  23.27 
 
 		 435 aa  76.6  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.445477  hitchhiker  0.00049802 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  31.28 
 
 		 633 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2328  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.69 
 
 		 466 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.417791  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2042  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.69 
 
 		 466 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0670  glycosyl transferase family protein  29.76 
 
 		 501 aa  75.1  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1766  glycosyl transferase family 2  28.97 
 
 		 505 aa  75.1  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.214339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  31.2 
 
 		 662 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0332  response regulator receiver protein  27.39 
 
 		 806 aa  74.3  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112355  normal  0.937153 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3032  glycosyl transferase family 2  31.49 
 
 		 627 aa  74.3  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.696996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0704  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 501 aa  73.9  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.441471  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2749  glycosyl transferase family protein  25.55 
 
 		 502 aa  73.9  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924892  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  31.2 
 
 		 505 aa  73.9  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  31.2 
 
 		 520 aa  73.9  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1518  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.23 
 
 		 767 aa  73.6  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0706082  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1567  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 		 492 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4425  glycosyl transferase family 2  27.24 
 
 		 476 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0705  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 501 aa  72  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0847  glycosyl transferase family 2  28.06 
 
 		 429 aa  71.6  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  25.1 
 
 		 461 aa  71.6  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0015  glycosyl transferase family protein  28.22 
 
 		 684 aa  71.6  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6620  glycosyl transferase family 2  30.61 
 
 		 508 aa  71.2  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2839  glycosyl transferase family 2  26.03 
 
 		 523 aa  71.2  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0649  glycosyl transferase family protein  31.71 
 
 		 421 aa  70.9  0.00000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.113034 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  31.02 
 
 		 509 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0714  glycosyl transferase family protein  27.87 
 
 		 501 aa  70.5  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0487319  decreased coverage  0.00470024 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1089  glycosyl transferase family protein  27.91 
 
 		 885 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1842  cell wall membrane glycosyltransferase  23.78 
 
 		 407 aa  70.1  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.606296  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  30.61 
 
 		 509 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>