268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1009 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_1009  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
410 aa  810    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.411292  normal  0.902987 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3140  glycosyl transferase, group 2 family protein  50.57 
 
 
395 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.648773 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2905  glycosyl transferase family protein  48.44 
 
 
395 aa  292  7e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2574  glycosyl transferase family protein  49.72 
 
 
395 aa  292  9e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2715  glycosyl transferase family protein  50.14 
 
 
395 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5289  glycosyl transferase family 2  40.8 
 
 
403 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4794  glycosyl transferase family protein  44.51 
 
 
406 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4777  glycosyl transferase family 2  38.4 
 
 
393 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.340207 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2079  glycosyl transferase family 2  33.08 
 
 
401 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.959735 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1434  glycosyl transferase, group 2 family protein  40 
 
 
396 aa  139  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1811  glycosyl transferase family protein  33.87 
 
 
401 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1378  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.02 
 
 
396 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.80225 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1704  glycosyl transferase family 2  32.77 
 
 
398 aa  125  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2374  glycosyl transferase family protein  44 
 
 
380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.222982  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1852  glycosyl transferase family 2  30.85 
 
 
397 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0837  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  33.85 
 
 
411 aa  114  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2042  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.18 
 
 
466 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2334  glycosyl transferase family 2  30.8 
 
 
417 aa  109  7.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.876722  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2328  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.93 
 
 
466 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.417791  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1675  glycosyl transferase family 2  31.03 
 
 
415 aa  109  9.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1099  glycosyl transferase family protein  24.91 
 
 
437 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0201328  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1788  glycosyl transferase family protein  27.36 
 
 
418 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0177  glycosyl transferase family 2  28 
 
 
425 aa  100  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00145418  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1842  cell wall membrane glycosyltransferase  29.15 
 
 
407 aa  99.8  7e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.606296  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0370  glycosyl transferase family 2  28.32 
 
 
438 aa  99  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0460104  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1411  glycosyl transferase family protein  31.45 
 
 
424 aa  94.4  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.584249 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0333  glycosyl transferase family 2  27.01 
 
 
420 aa  90.1  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0835  glycosyl transferase family 2  25.55 
 
 
435 aa  89.4  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.445477  hitchhiker  0.00049802 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1403  glycosyl transferase family 2  34.01 
 
 
434 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0691788  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1499  glycosyl transferase family 2  33.79 
 
 
432 aa  86.7  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0824671  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2456  glycosyl transferase family protein  34.35 
 
 
432 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130133  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1138  glycosyltransferase, group 2 family protein  25.88 
 
 
411 aa  83.2  0.000000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3658  glycosyl transferase family protein  31.98 
 
 
349 aa  79.3  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1210  glycosyl transferase family 2  24.37 
 
 
444 aa  73.6  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.47071  normal  0.038027 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0377  glycosyl transferase family 2  32.26 
 
 
523 aa  72.8  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4608  N-glycosyltransferase  26.25 
 
 
442 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  25.37 
 
 
442 aa  70.5  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2239  N-glycosyltransferase  28.72 
 
 
444 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.423629  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2143  N-glycosyltransferase  28.72 
 
 
444 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.382592  normal  0.0135691 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2129  N-glycosyltransferase  28.72 
 
 
444 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.772993  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2627  glycosyl transferase family protein  32.93 
 
 
425 aa  68.2  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.528621  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  27.35 
 
 
752 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04326  N-glycosyltransferase  25.96 
 
 
417 aa  63.2  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.780445  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  27.94 
 
 
495 aa  62.4  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0161  glycosyl transferase family 2  24.9 
 
 
475 aa  62.4  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0452  putative glycosyl transferase  23.11 
 
 
332 aa  62  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  26.47 
 
 
1002 aa  60.8  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4562  glycosyl transferase family protein  28.27 
 
 
651 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.829181  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4650  glycosyl transferase family protein  28.27 
 
 
651 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.492865  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4945  glycosyl transferase family protein  28.27 
 
 
651 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.420909  normal  0.200608 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  27.31 
 
 
1099 aa  60.8  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3499  glycosyl transferase family 2  25.71 
 
 
497 aa  60.5  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.802267  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8187  glycosyl transferase family 2  40.43 
 
 
233 aa  60.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  29.29 
 
 
1120 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3861  glycosyl transferase family 2  26.43 
 
 
397 aa  60.5  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0793444  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1549  glycosyl transferase family protein  35.48 
 
 
228 aa  59.3  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1272  glycosyl transferase family 2  26.71 
 
 
494 aa  58.9  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102707  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0752  N-glycosyltransferase  24.47 
 
 
433 aa  59.7  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22610  glycosyl transferase  27.34 
 
 
497 aa  59.3  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.634128  normal  0.441487 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1457  glycosyl transferase family protein  39.64 
 
 
356 aa  58.5  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.7433 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1305  glycosyl transferase family protein  38.1 
 
 
229 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  25.71 
 
 
422 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1338  glycosyl transferase family protein  26.02 
 
 
772 aa  57.8  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0396  glycosyl transferase family protein  38.14 
 
 
229 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.54121  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1088  glycosyl transferase family 2  22.37 
 
 
458 aa  57.4  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1366  glycosyl transferase family protein  39.18 
 
 
228 aa  57.8  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000927738 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0649  glycosyl transferase family protein  25.21 
 
 
421 aa  57.4  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.113034 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0383  glycosyl transferase family protein  27.34 
 
 
443 aa  57.4  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.138846  normal  0.0930893 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0581  glycosyl transferase family protein  39.18 
 
 
228 aa  57  0.0000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.529493  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3853  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
396 aa  56.6  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  34.04 
 
 
355 aa  56.2  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2718  N-glycosyltransferase  28.81 
 
 
418 aa  56.2  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0523  glycosyl transferase family protein  39.64 
 
 
356 aa  55.8  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.343071 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2790  N-glycosyltransferase  25.7 
 
 
418 aa  55.8  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.347496  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0335  glycosyl transferase family protein  24.93 
 
 
459 aa  56.2  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  29.37 
 
 
1124 aa  55.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3010  N-glycosyltransferase  27.4 
 
 
421 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  23.74 
 
 
412 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2958  glycosyl transferase family 2  25.99 
 
 
395 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  22.08 
 
 
399 aa  55.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  22.08 
 
 
399 aa  55.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3117  N-glycosyltransferase  27.24 
 
 
421 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2044  glycosyl transferase family 2  38.46 
 
 
230 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.462866  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0179  N-glycosyltransferase  26.22 
 
 
451 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574055  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2925  N-glycosyltransferase  27.85 
 
 
421 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0218  glycosyl transferase family protein  20.31 
 
 
379 aa  53.9  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2961  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  39.66 
 
 
334 aa  54.3  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.720485  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  24.01 
 
 
412 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  23.85 
 
 
694 aa  53.9  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05405  putative glycosyltransferase  30.84 
 
 
231 aa  53.9  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.507881  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3178  glycosyl transferase family protein  25.21 
 
 
329 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  27.63 
 
 
1118 aa  53.9  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2293  N-glycosyltransferase  21.75 
 
 
412 aa  53.5  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00369291  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1105  glycosyl transferase family protein  36 
 
 
632 aa  53.5  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.293938  normal  0.766721 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1577  glycosyl transferase family 2  36.04 
 
 
238 aa  53.5  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.469655 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  24.01 
 
 
441 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  24.01 
 
 
441 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  24.01 
 
 
441 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  24.01 
 
 
441 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  24.01 
 
 
441 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>