284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1138 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1138  glycosyltransferase, group 2 family protein  100 
 
 		 411 aa  855    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1842  cell wall membrane glycosyltransferase  69.04 
 
 		 407 aa  620  1e-176  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.606296  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1210  glycosyl transferase family 2  42.48 
 
 		 444 aa  344  2e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.47071  normal  0.038027 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0835  glycosyl transferase family 2  38.63 
 
 		 435 aa  297  2e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.445477  hitchhiker  0.00049802 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2328  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.54 
 
 		 466 aa  231  2e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.417791  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2042  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.54 
 
 		 466 aa  231  2e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1675  glycosyl transferase family 2  34.19 
 
 		 415 aa  219  8.999999999999998e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1788  glycosyl transferase family protein  31.63 
 
 		 418 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0177  glycosyl transferase family 2  32.52 
 
 		 425 aa  208  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00145418  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0333  glycosyl transferase family 2  31.81 
 
 		 420 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2334  glycosyl transferase family 2  32.03 
 
 		 417 aa  199  5e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.876722  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1099  glycosyl transferase family protein  31 
 
 		 437 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0201328  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0370  glycosyl transferase family 2  32.14 
 
 		 438 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0460104  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2079  glycosyl transferase family 2  30.34 
 
 		 401 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.959735 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1411  glycosyl transferase family protein  27.14 
 
 		 424 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.584249 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1499  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 		 432 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0824671  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1403  glycosyl transferase family 2  32.17 
 
 		 434 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0691788  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2456  glycosyl transferase family protein  32.55 
 
 		 432 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130133  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0837  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.96 
 
 		 411 aa  117  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1378  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.79 
 
 		 396 aa  113  6e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.80225 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1704  glycosyl transferase family 2  27.37 
 
 		 398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1852  glycosyl transferase family 2  29.1 
 
 		 397 aa  106  8e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1811  glycosyl transferase family protein  24.36 
 
 		 401 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4794  glycosyl transferase family protein  29.07 
 
 		 406 aa  94.4  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0060  putative glycosyltransferase  22.41 
 
 		 439 aa  90.1  6e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5289  glycosyl transferase family 2  25.67 
 
 		 403 aa  90.1  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  25.95 
 
 		 495 aa  89.7  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 		 475 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 		 475 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4777  glycosyl transferase family 2  24.05 
 
 		 393 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.340207 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2749  glycosyl transferase family protein  23.4 
 
 		 502 aa  85.9  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924892  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1272  glycosyl transferase family 2  24.39 
 
 		 494 aa  84.7  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102707  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22610  glycosyl transferase  27.37 
 
 		 497 aa  84  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.634128  normal  0.441487 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21281  glycosyl transferase family protein  24.83 
 
 		 438 aa  82.8  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.133481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4425  glycosyl transferase family 2  24.66 
 
 		 476 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2574  glycosyl transferase family protein  25.71 
 
 		 395 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3140  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.64 
 
 		 395 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.648773 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2905  glycosyl transferase family protein  27.91 
 
 		 395 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0984  glycosyl transferase family 2  25.6 
 
 		 393 aa  79.7  0.00000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00499556  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2011  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 335 aa  79.7  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.814426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1009  glycosyl transferase family protein  26.86 
 
 		 410 aa  79  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.411292  normal  0.902987 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1257  glycosyl transferase family protein  24.36 
 
 		 438 aa  79.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0057  putative glycosyltransferase  23.62 
 
 		 443 aa  79.3  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3861  glycosyl transferase family 2  24.04 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0793444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4704  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 		 483 aa  78.2  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0279225  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2715  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 		 395 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1434  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.03 
 
 		 396 aa  77.4  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  25.76 
 
 		 399 aa  76.3  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3301  family 2 glycosyl transferase  21.87 
 
 		 469 aa  75.1  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144563  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0430  glycosyl transferase family 2  22.9 
 
 		 473 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.912379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  22.53 
 
 		 1099 aa  74.3  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  25.61 
 
 		 428 aa  73.9  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5398  glycosyl transferase family 2  26.77 
 
 		 507 aa  70.9  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.298595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2154  glycosyl transferase family protein  24.63 
 
 		 466 aa  70.1  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.119958 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  25.7 
 
 		 395 aa  69.7  0.00000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3853  glycosyl transferase family 2  26.01 
 
 		 396 aa  69.7  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3771  glycosyl transferase family protein  22.59 
 
 		 433 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  26.14 
 
 		 1120 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0081  glycosyltransferase  26.69 
 
 		 435 aa  69.3  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000323026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0980  glycosyl transferase family 2  24.81 
 
 		 512 aa  69.3  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5030  glycosyl transferase family protein  23.25 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4918  glycosyl transferase  22.59 
 
 		 433 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0768338  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4933  N-acetylglucosaminyltransferase  22.59 
 
 		 433 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.443938  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  24.91 
 
 		 520 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  22.22 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5327  glycosyl transferase, group 2 family  22.59 
 
 		 433 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76631e-28 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5356  glycosyl transferase domain-containing protein  22.22 
 
 		 433 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  24.91 
 
 		 505 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1083  glycosyltransferase  20.82 
 
 		 458 aa  67.8  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014105 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0166  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  25.19 
 
 		 391 aa  67.8  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0377  glycosyl transferase family 2  26.44 
 
 		 523 aa  67.4  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00631  glycosyl transferase family protein  22.91 
 
 		 443 aa  67  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  24.08 
 
 		 752 aa  67  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5361  N-acetylglucosaminyltransferase  22.59 
 
 		 433 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.190593  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0070  glycosyl transferase family 2  25.9 
 
 		 431 aa  65.5  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1988  glycosyl transferase family 2  22.13 
 
 		 445 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  24.91 
 
 		 662 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  26.1 
 
 		 633 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  24.14 
 
 		 411 aa  66.2  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3947  glycosyl transferase family 2  23.28 
 
 		 445 aa  65.1  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2217  glycosyl transferase family protein  21.23 
 
 		 468 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  25.27 
 
 		 1154 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3658  glycosyl transferase family protein  23.62 
 
 		 349 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1657  glycosyl transferase family 2  23.5 
 
 		 732 aa  64.7  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0588308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1791  b-glycosyltransferase  21.91 
 
 		 344 aa  64.3  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4949  glycosyl transferase family protein  26.33 
 
 		 446 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816666  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5168  glycosyl transferase family 2  24.43 
 
 		 683 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3708  glycosyl transferase family 2  22.56 
 
 		 403 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal  0.144342 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  23.58 
 
 		 422 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  25.85 
 
 		 549 aa  62.8  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2627  glycosyl transferase family protein  24.92 
 
 		 425 aa  62.4  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.528621  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17851  glycosyl transferase family protein  24.58 
 
 		 437 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2904  glycosyl transferase family protein  23.43 
 
 		 546 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0714  glycosyl transferase family protein  24.46 
 
 		 501 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0487319  decreased coverage  0.00470024 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  25.18 
 
 		 509 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  24.83 
 
 		 420 aa  62  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1964  cell wall biogenesis glycosyltransferase  23.66 
 
 		 395 aa  61.2  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000036966 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1562  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 435 aa  61.2  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  25.18 
 
 		 509 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3032  glycosyl transferase family 2  25.11 
 
 		 627 aa  60.8  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.696996  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>