193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2374 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2374  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 380 aa  706    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.222982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5289  glycosyl transferase family 2  36.41 
 
 		 403 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4777  glycosyl transferase family 2  38.87 
 
 		 393 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.340207 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2905  glycosyl transferase family protein  44.7 
 
 		 395 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3140  glycosyl transferase, group 2 family protein  44.41 
 
 		 395 aa  225  8e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.648773 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2574  glycosyl transferase family protein  44.13 
 
 		 395 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2715  glycosyl transferase family protein  43.54 
 
 		 395 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4794  glycosyl transferase family protein  41.5 
 
 		 406 aa  211  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1009  glycosyl transferase family protein  38.5 
 
 		 410 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.411292  normal  0.902987 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1811  glycosyl transferase family protein  33.52 
 
 		 401 aa  138  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1704  glycosyl transferase family 2  33.71 
 
 		 398 aa  135  8e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0837  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  38.76 
 
 		 411 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1378  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.67 
 
 		 396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.80225 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1852  glycosyl transferase family 2  31.72 
 
 		 397 aa  125  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1434  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.11 
 
 		 396 aa  124  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2079  glycosyl transferase family 2  29.97 
 
 		 401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.959735 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1411  glycosyl transferase family protein  36.93 
 
 		 424 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.584249 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2334  glycosyl transferase family 2  29.6 
 
 		 417 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.876722  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2042  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.22 
 
 		 466 aa  97.8  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2328  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.8 
 
 		 466 aa  96.3  8e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.417791  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1403  glycosyl transferase family 2  40.23 
 
 		 434 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0691788  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1099  glycosyl transferase family protein  24.32 
 
 		 437 aa  94  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0201328  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2456  glycosyl transferase family protein  40.42 
 
 		 432 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130133  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1675  glycosyl transferase family 2  27.37 
 
 		 415 aa  91.7  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1499  glycosyl transferase family 2  40.73 
 
 		 432 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0824671  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0333  glycosyl transferase family 2  26.07 
 
 		 420 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0177  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 		 425 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00145418  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0370  glycosyl transferase family 2  27.54 
 
 		 438 aa  79.3  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0460104  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1788  glycosyl transferase family protein  22.99 
 
 		 418 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1138  glycosyltransferase, group 2 family protein  23.76 
 
 		 411 aa  75.1  0.000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1842  cell wall membrane glycosyltransferase  24.84 
 
 		 407 aa  73.6  0.000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.606296  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0835  glycosyl transferase family 2  22.76 
 
 		 435 aa  71.6  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.445477  hitchhiker  0.00049802 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3658  glycosyl transferase family protein  40.54 
 
 		 349 aa  70.5  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  30.2 
 
 		 1099 aa  70.1  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1210  glycosyl transferase family 2  23.69 
 
 		 444 aa  69.7  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.47071  normal  0.038027 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3861  glycosyl transferase family 2  27.46 
 
 		 397 aa  67  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0793444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3708  glycosyl transferase family 2  26.09 
 
 		 403 aa  66.2  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal  0.144342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  26.12 
 
 		 752 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  28.94 
 
 		 420 aa  61.6  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0218  glycosyl transferase family protein  19.18 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4608  N-glycosyltransferase  27.6 
 
 		 442 aa  60.1  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0377  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 		 523 aa  59.7  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  22.18 
 
 		 1115 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  22.36 
 
 		 1002 aa  58.5  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 		 428 aa  58.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3771  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 433 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0383  glycosyl transferase family protein  30.68 
 
 		 443 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.138846  normal  0.0930893 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  26.61 
 
 		 789 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  26.61 
 
 		 789 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  26.61 
 
 		 789 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3853  glycosyl transferase family 2  26.69 
 
 		 396 aa  57.4  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  26.61 
 
 		 509 aa  57.4  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5030  glycosyl transferase family protein  24.68 
 
 		 433 aa  57  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4933  N-acetylglucosaminyltransferase  24.7 
 
 		 433 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.443938  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4918  glycosyl transferase  24.7 
 
 		 433 aa  56.6  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0768338  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5327  glycosyl transferase, group 2 family  24.7 
 
 		 433 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76631e-28 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  27.67 
 
 		 442 aa  56.2  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5356  glycosyl transferase domain-containing protein  24.49 
 
 		 433 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5361  N-acetylglucosaminyltransferase  25.11 
 
 		 433 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.190593  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  24.7 
 
 		 433 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1272  glycosyl transferase family 2  25.78 
 
 		 494 aa  55.1  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102707  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1562  glycosyl transferase family protein  37.11 
 
 		 435 aa  54.7  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1452  glycosyl transferase family protein  45 
 
 		 299 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.591361 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  20.28 
 
 		 403 aa  54.7  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1863  family 2 glycosyl transferase  37.96 
 
 		 330 aa  54.7  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1704  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 514 aa  54.7  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0161  glycosyl transferase family 2  32 
 
 		 475 aa  53.9  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3499  glycosyl transferase family 2  32.54 
 
 		 497 aa  53.9  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.802267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0081  glycosyltransferase  21.55 
 
 		 435 aa  53.1  0.000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000323026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1593  glycosyl transferase family protein  24.35 
 
 		 425 aa  53.5  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.901855  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2406  glycosyl transferase family protein  37.38 
 
 		 280 aa  53.1  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27610  glycosyl transferase  26.21 
 
 		 629 aa  53.1  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.862401  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  26.37 
 
 		 1120 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  21.03 
 
 		 872 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0515  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 		 437 aa  52.4  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.60232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0095  glycosyl transferase family 2  21.88 
 
 		 494 aa  52.4  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.176574  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2961  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  40.57 
 
 		 334 aa  52.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.720485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0584  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 		 481 aa  52.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0179  N-glycosyltransferase  25.91 
 
 		 451 aa  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  28.22 
 
 		 1124 aa  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  29.73 
 
 		 637 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4238  glycosyl transferase family protein  27.47 
 
 		 332 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.440412  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05405  putative glycosyltransferase  32.32 
 
 		 231 aa  51.2  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.507881  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2259  putative glycosyl transferase  38.04 
 
 		 313 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  21.07 
 
 		 927 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  21.07 
 
 		 1115 aa  50.4  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  21.19 
 
 		 1115 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1041  glycosyl transferase family protein  40 
 
 		 222 aa  50.8  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0213116 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2439  glycosyl transferase family protein  20.29 
 
 		 464 aa  50.8  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0861  glycosyl transferase family 2  41.18 
 
 		 357 aa  50.8  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4380  glycosyl transferase family 2  36 
 
 		 314 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4442  glycosyl transferase family 2  36 
 
 		 314 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.302046 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3553  glycosyl transferase family 2  30.45 
 
 		 456 aa  50.4  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  21.07 
 
 		 1119 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6271  glycosyl transferase family 2  26.2 
 
 		 658 aa  50.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.449119 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2940  glycosyl transferase family protein  36.17 
 
 		 318 aa  50.4  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3901  glycosyl transferase family protein  42.73 
 
 		 311 aa  50.4  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0146  glycosyl transferase family protein  35.11 
 
 		 336 aa  49.7  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2958  glycosyl transferase family 2  23.86 
 
 		 395 aa  50.1  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  35.58 
 
 		 305 aa  49.7  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>