245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3708 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3708  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 403 aa  820    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal  0.144342 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3853  glycosyl transferase family 2  43.12 
 
 		 396 aa  273  4.0000000000000004e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3861  glycosyl transferase family 2  38.13 
 
 		 397 aa  254  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0793444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0166  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  28.12 
 
 		 391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1964  cell wall biogenesis glycosyltransferase  28.11 
 
 		 395 aa  110  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000036966 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1099  glycosyl transferase family protein  24.27 
 
 		 437 aa  104  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0201328  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0177  glycosyl transferase family 2  25.06 
 
 		 425 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00145418  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0370  glycosyl transferase family 2  27.17 
 
 		 438 aa  102  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0460104  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2328  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.33 
 
 		 466 aa  101  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.417791  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2042  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.33 
 
 		 466 aa  101  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1811  glycosyl transferase family protein  29.01 
 
 		 401 aa  97.8  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0333  glycosyl transferase family 2  26.02 
 
 		 420 aa  96.7  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1788  glycosyl transferase family protein  23.76 
 
 		 418 aa  95.9  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2334  glycosyl transferase family 2  28.48 
 
 		 417 aa  95.9  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.876722  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1675  glycosyl transferase family 2  27.9 
 
 		 415 aa  92  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1411  glycosyl transferase family protein  26.71 
 
 		 424 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.584249 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1852  glycosyl transferase family 2  27.7 
 
 		 397 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0835  glycosyl transferase family 2  24.85 
 
 		 435 aa  80.5  0.00000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.445477  hitchhiker  0.00049802 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0837  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  26.67 
 
 		 411 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2079  glycosyl transferase family 2  23.08 
 
 		 401 aa  77.8  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.959735 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4777  glycosyl transferase family 2  24.93 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.340207 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1378  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.01 
 
 		 396 aa  76.3  0.0000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.80225 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1499  glycosyl transferase family 2  25.55 
 
 		 432 aa  73.2  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0824671  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1403  glycosyl transferase family 2  24.94 
 
 		 434 aa  70.5  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0691788  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1210  glycosyl transferase family 2  25.28 
 
 		 444 aa  70.1  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.47071  normal  0.038027 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1842  cell wall membrane glycosyltransferase  25.72 
 
 		 407 aa  68.9  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.606296  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1704  glycosyl transferase family 2  24.91 
 
 		 398 aa  68.2  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2456  glycosyl transferase family protein  27 
 
 		 432 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130133  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4110  glycosyl transferase family protein  27.18 
 
 		 626 aa  67  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656691  normal  0.773085 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  22.79 
 
 		 461 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2031  glycosyl transferase family protein  26 
 
 		 1140 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5208  cellulose synthase (UDP-forming)  26.45 
 
 		 726 aa  64.3  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.823689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1847  glycosyl transferase family 2  25.68 
 
 		 1140 aa  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1245  Cellulose synthase (UDP-forming)  26.94 
 
 		 672 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.731886  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1272  glycosyl transferase family 2  25.28 
 
 		 494 aa  63.2  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102707  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1932  glycosyl transferase family 2  25.42 
 
 		 1140 aa  63.2  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273416  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0057  putative glycosyltransferase  27.01 
 
 		 443 aa  63.2  0.000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0962  cellulose synthase (UDP-forming)  27.24 
 
 		 788 aa  63.2  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373289 
 
 
-
 
NC_002978  WD0431  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.94 
 
 		 532 aa  62.8  0.00000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.802283  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1279  Cellulose synthase (UDP-forming)  26.56 
 
 		 672 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.14202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1133  cellulose synthase (UDP-forming)  26.95 
 
 		 672 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0362124  normal  0.973174 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5535  cellulose synthase  26.57 
 
 		 729 aa  62.4  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1138  glycosyltransferase, group 2 family protein  22.56 
 
 		 411 aa  62.4  0.00000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  22.6 
 
 		 420 aa  62.4  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0569  cellulose synthase (UDP-forming)  22.66 
 
 		 758 aa  62.4  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  26.19 
 
 		 475 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0374  cellulose synthase (UDP-forming)  26.96 
 
 		 661 aa  62  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  26.19 
 
 		 475 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0797  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.58 
 
 		 845 aa  62  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.429971  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00787  cellulose synthase catalytic subunit  26.5 
 
 		 707 aa  62  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4704  glycosyl transferase family 2  26.43 
 
 		 483 aa  62.4  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0279225  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4645  Cellulose synthase (UDP-forming)  25.89 
 
 		 664 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.998424 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21281  glycosyl transferase family protein  24.76 
 
 		 438 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.133481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2074  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  25.76 
 
 		 851 aa  60.8  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117209 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3398  Cellulose synthase (UDP-forming)  29.2 
 
 		 768 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.874799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1379  glycosyl transferase family protein  24.9 
 
 		 367 aa  60.8  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.500878  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3509  cellulose synthase (UDP-forming)  26.77 
 
 		 666 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.901561  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1083  glycosyltransferase  25 
 
 		 458 aa  60.5  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014105 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2256  glycosyl transferase family protein  27.07 
 
 		 857 aa  60.5  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.548829 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2964  glycosyl transferase family 2  26.14 
 
 		 476 aa  60.5  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0324251  hitchhiker  0.00721921 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2749  glycosyl transferase family protein  25.87 
 
 		 502 aa  60.5  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924892  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18681  glycosyl transferase family protein  27.79 
 
 		 433 aa  60.5  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1204  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  25.48 
 
 		 730 aa  60.1  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1978  cellulose synthase (UDP-forming)  26.64 
 
 		 788 aa  60.1  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.693808 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0333  cellulose synthase  26.64 
 
 		 788 aa  60.1  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.963251  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1921  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  24.08 
 
 		 846 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.18381 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1585  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.51 
 
 		 848 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.161966  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0626  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.51 
 
 		 846 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0631818  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  25.1 
 
 		 1154 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1293  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  25.71 
 
 		 730 aa  59.7  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2013  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.51 
 
 		 848 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.508961  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2226  cellulose synthase, catalytic subunit (UDP-forming)  25.51 
 
 		 846 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.467064  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2140  cellulose synthase, catalytic subunit (UDP-forming)  25.51 
 
 		 848 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.659899  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0691  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.51 
 
 		 848 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.227734  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0060  putative glycosyltransferase  24.62 
 
 		 439 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2904  glycosyl transferase family protein  22.34 
 
 		 546 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3726  cellulose synthase (UDP-forming)  24.48 
 
 		 664 aa  58.9  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4805  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  23.95 
 
 		 804 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.254969  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1434  glycosyl transferase, group 2 family protein  25 
 
 		 396 aa  58.2  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22610  glycosyl transferase  24.7 
 
 		 497 aa  57.8  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.634128  normal  0.441487 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1257  glycosyl transferase family protein  25.53 
 
 		 438 aa  57.4  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 509 aa  57.4  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0379  glycosyl transferase family protein  22.99 
 
 		 626 aa  57  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1751  glycosyl transferase family protein  27.16 
 
 		 433 aa  57  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.121941  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3741  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  24.16 
 
 		 810 aa  57  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1778  glycosyl transferase family protein  25.68 
 
 		 1129 aa  56.6  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.073121 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3947  glycosyl transferase family 2  23.79 
 
 		 445 aa  56.2  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0984  glycosyl transferase family 2  26.07 
 
 		 393 aa  56.2  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00499556  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0794  cellulose synthase (UDP-forming)  24.94 
 
 		 683 aa  55.8  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.298349  normal  0.0356093 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18491  glycosyl transferase family protein  26.54 
 
 		 433 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.468741  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1949  General secretory system II protein E domain protein  25.42 
 
 		 612 aa  56.2  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0107  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  23.08 
 
 		 811 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.885965 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05090  Cellulose synthase subunit AB  26.26 
 
 		 1455 aa  55.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2439  glycosyl transferase family protein  22.68 
 
 		 464 aa  55.1  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3256  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  25.3 
 
 		 743 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.843653 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2382  glycosyl transferase family protein  25.81 
 
 		 678 aa  55.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4530  cellulose synthase (UDP-forming)  22.46 
 
 		 845 aa  54.7  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.365333 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0721  general secretion pathway protein E  28.03 
 
 		 606 aa  54.3  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.831257  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00631  glycosyl transferase family protein  25.71 
 
 		 443 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1312  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  23.28 
 
 		 822 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779544  normal  0.794607 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>