More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0721 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0721  general secretion pathway protein E  100 
 
 
606 aa  1251    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.831257  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2855  glycosyl transferase family 2  40.5 
 
 
624 aa  439  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.875286 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1292  glycosyl transferase family protein  45.03 
 
 
642 aa  438  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4110  glycosyl transferase family protein  39.69 
 
 
626 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656691  normal  0.773085 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2964  glycosyl transferase family 2  46.14 
 
 
476 aa  395  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0324251  hitchhiker  0.00721921 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0207  hypothetical protein  44.93 
 
 
475 aa  384  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0980  glycosyl transferase family 2  47.37 
 
 
512 aa  383  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3200  glycosyl transferase family protein  35.78 
 
 
848 aa  379  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2931  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 
664 aa  370  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0424  glycosyl transferase family protein  37.42 
 
 
652 aa  364  3e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.32532  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0525  hypothetical protein  46.57 
 
 
464 aa  359  9e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0547  hypothetical protein  46.57 
 
 
464 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41908  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0535  hypothetical protein  46.88 
 
 
417 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1949  General secretory system II protein E domain protein  37.4 
 
 
612 aa  337  5e-91  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0431  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.38 
 
 
532 aa  316  6e-85  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.802283  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0577  glycosyltransferase  37.18 
 
 
664 aa  308  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1245  glycosyl transferase family protein  32.84 
 
 
654 aa  305  2.0000000000000002e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.620003 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.35 
 
 
573 aa  301  2e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0296  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.14 
 
 
630 aa  299  9e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2166  general secretion pathway protein E  32.96 
 
 
698 aa  296  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0998  glycosyl transferase family protein  42.32 
 
 
686 aa  288  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.759416  normal  0.641778 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2888  glycosyl transferase family 2  37.76 
 
 
615 aa  286  5e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233699 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0379  glycosyl transferase family protein  37.68 
 
 
626 aa  286  5.999999999999999e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0014  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.15 
 
 
656 aa  281  3e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0886  glycosyl transferases  43.28 
 
 
673 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3420  glycosyl transferase family 2  36.63 
 
 
616 aa  280  6e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2382  glycosyl transferase family protein  43.42 
 
 
678 aa  276  6e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1872  glycosyl transferase family protein  40.7 
 
 
604 aa  272  2e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0522  general secretion pathway protein E  40.7 
 
 
636 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.450126  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2295  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 
509 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3549  glycosyl transferase family protein  40.62 
 
 
614 aa  270  4e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.877744 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5168  glycosyl transferase family 2  42.67 
 
 
683 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3225  glycosyl transferase family protein  40.31 
 
 
596 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0693647  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0659  general secretion pathway protein E  31.86 
 
 
628 aa  264  4e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.814938  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0496  glycosyl transferase family protein  40.38 
 
 
537 aa  264  4e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.741629  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1064  glycosyl transferase family protein  41.51 
 
 
650 aa  262  2e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.132947 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3769  glycosyl transferase family protein  38.01 
 
 
632 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997629  normal  0.300264 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2861  glycosyl transferase family protein  39.73 
 
 
678 aa  259  8e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.623061  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1627  cell wall biogenesis glycosyltransferase  40.05 
 
 
656 aa  254  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0402312  normal  0.167793 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2388  glycosyl transferase  38.11 
 
 
635 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.445397  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3092  hypothetical protein  35.86 
 
 
492 aa  240  6.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0149  glycosyl transferase family protein  35.52 
 
 
450 aa  159  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.975549 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0203  glycosyl transferase family protein  40.69 
 
 
465 aa  150  7e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.678813  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0209  putative glycosyl transferase  39.9 
 
 
219 aa  141  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0145  glycosyl transferase  41.54 
 
 
216 aa  140  7.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.51395  normal  0.856095 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0095  glycosyl transferase family 2  27.84 
 
 
494 aa  120  4.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.176574  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5030  glycosyl transferase family protein  27.9 
 
 
433 aa  114  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4933  N-acetylglucosaminyltransferase  28.14 
 
 
433 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.443938  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5356  glycosyl transferase domain-containing protein  28.33 
 
 
433 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4918  glycosyl transferase  28.14 
 
 
433 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0768338  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5327  glycosyl transferase, group 2 family  28.14 
 
 
433 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76631e-28 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  28.33 
 
 
433 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3771  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 
433 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5361  N-acetylglucosaminyltransferase  27.04 
 
 
433 aa  109  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.190593  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05410  glycosyltransferase  25.33 
 
 
490 aa  107  7e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1766  glycosyl transferase family 2  28.45 
 
 
505 aa  105  3e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.214339  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  28.07 
 
 
420 aa  102  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0635  glycosyl transferase family protein  29.89 
 
 
471 aa  102  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00269925  normal  0.0269839 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1478  glycosyl transferase family 2  27.86 
 
 
533 aa  99.8  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0670  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
501 aa  97.8  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6620  glycosyl transferase family 2  27.86 
 
 
508 aa  96.7  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0704  glycosyl transferase family 2  27.13 
 
 
501 aa  96.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.441471  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0714  glycosyl transferase family protein  26.91 
 
 
501 aa  96.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0487319  decreased coverage  0.00470024 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0705  glycosyl transferase family 2  26.81 
 
 
501 aa  95.9  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4863  glycosyl transferase family protein  28.75 
 
 
461 aa  95.1  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907872  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2904  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 
546 aa  95.5  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4704  glycosyl transferase family 2  25.77 
 
 
483 aa  92.8  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0279225  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  26.23 
 
 
549 aa  90.5  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0984  glycosyl transferase family 2  22.7 
 
 
393 aa  87  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00499556  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2839  glycosyl transferase family 2  26.19 
 
 
523 aa  86.3  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0070  glycosyl transferase family 2  27.82 
 
 
431 aa  85.9  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1567  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 
492 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  23.57 
 
 
475 aa  84.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  23.57 
 
 
475 aa  84.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1562  glycosyl transferase family protein  24.1 
 
 
435 aa  81.6  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0081  glycosyltransferase  22.49 
 
 
435 aa  82  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000323026  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18489  predicted protein  23.5 
 
 
514 aa  80.5  0.00000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0623702  normal  0.762192 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1831  glycosyltransferase  23.95 
 
 
473 aa  79.7  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115115  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0649  glycosyl transferase family protein  26.03 
 
 
421 aa  79.7  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.113034 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00631  glycosyl transferase family protein  24.32 
 
 
443 aa  79  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3509  cellulose synthase (UDP-forming)  26.23 
 
 
666 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.901561  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0374  cellulose synthase (UDP-forming)  25.99 
 
 
661 aa  78.2  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0797  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.69 
 
 
845 aa  78.2  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.429971  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  22.66 
 
 
509 aa  77.4  0.0000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0444  glycosyl transferase family protein  25.52 
 
 
688 aa  77  0.0000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000329644 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  26.57 
 
 
520 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  25.26 
 
 
1154 aa  76.6  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  26.57 
 
 
505 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  27.51 
 
 
509 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1099  glycosyl transferase family protein  24.3 
 
 
437 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0201328  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1245  Cellulose synthase (UDP-forming)  25.82 
 
 
672 aa  74.7  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.731886  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  26.57 
 
 
662 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  25.98 
 
 
633 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  24.65 
 
 
399 aa  74.7  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  27.79 
 
 
509 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1411  glycosyl transferase family protein  28.85 
 
 
424 aa  74.3  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.584249 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2627  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
425 aa  74.7  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.528621  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  25.96 
 
 
395 aa  74.7  0.000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5087  N-acetylglucosaminyltransferase, N-terminus (glycosyl transferase)  26.63 
 
 
218 aa  73.9  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2749  glycosyl transferase family protein  25.85 
 
 
502 aa  73.9  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924892  normal  0.61972 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>