More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0424 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0424  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 652 aa  1319    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.32532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4110  glycosyl transferase family protein  42.72 
 
 		 626 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656691  normal  0.773085 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2855  glycosyl transferase family 2  42.29 
 
 		 624 aa  461  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.875286 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1292  glycosyl transferase family protein  44.21 
 
 		 642 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2931  glycosyl transferase family 2  39.75 
 
 		 664 aa  384  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0721  general secretion pathway protein E  37.42 
 
 		 606 aa  370  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.831257  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1949  General secretory system II protein E domain protein  40.32 
 
 		 612 aa  368  1e-100  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2964  glycosyl transferase family 2  44.4 
 
 		 476 aa  342  1e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0324251  hitchhiker  0.00721921 
 
 
-
 
NC_002978  WD0431  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.62 
 
 		 532 aa  340  4e-92  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.802283  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0998  glycosyl transferase family protein  38.41 
 
 		 686 aa  339  9e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.759416  normal  0.641778 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2166  general secretion pathway protein E  37.1 
 
 		 698 aa  337  2.9999999999999997e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0980  glycosyl transferase family 2  39.01 
 
 		 512 aa  334  2e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2388  glycosyl transferase  38.78 
 
 		 635 aa  332  1e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.445397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3200  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 		 848 aa  332  1e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0496  glycosyl transferase family protein  45.71 
 
 		 537 aa  331  3e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.741629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0379  glycosyl transferase family protein  42.76 
 
 		 626 aa  324  4e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0525  hypothetical protein  43.96 
 
 		 464 aa  323  4e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0547  hypothetical protein  43.96 
 
 		 464 aa  323  5e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0659  general secretion pathway protein E  36.19 
 
 		 628 aa  323  6e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.814938  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0535  hypothetical protein  43.96 
 
 		 417 aa  323  7e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.56 
 
 		 573 aa  319  9e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0577  glycosyltransferase  36.84 
 
 		 664 aa  317  6e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0296  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.11 
 
 		 630 aa  316  9.999999999999999e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3420  glycosyl transferase family 2  40.7 
 
 		 616 aa  316  9.999999999999999e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3225  glycosyl transferase family protein  46.63 
 
 		 596 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0693647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3549  glycosyl transferase family protein  46.9 
 
 		 614 aa  311  2e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.877744 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5168  glycosyl transferase family 2  47.35 
 
 		 683 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2888  glycosyl transferase family 2  40.25 
 
 		 615 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233699 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3769  glycosyl transferase family protein  40.04 
 
 		 632 aa  307  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997629  normal  0.300264 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1872  glycosyl transferase family protein  45.04 
 
 		 604 aa  306  7e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0522  general secretion pathway protein E  45.04 
 
 		 636 aa  306  7e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.450126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0886  glycosyl transferases  44.24 
 
 		 673 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2382  glycosyl transferase family protein  46.98 
 
 		 678 aa  301  4e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2861  glycosyl transferase family protein  36.76 
 
 		 678 aa  300  6e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.623061  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0014  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.51 
 
 		 656 aa  299  1e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0207  hypothetical protein  37.14 
 
 		 475 aa  296  7e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1245  glycosyl transferase family protein  33.44 
 
 		 654 aa  293  6e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.620003 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3092  hypothetical protein  45.9 
 
 		 492 aa  288  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2295  glycosyl transferase family protein  38.28 
 
 		 509 aa  288  2e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1064  glycosyl transferase family protein  42.49 
 
 		 650 aa  286  1.0000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.132947 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1627  cell wall biogenesis glycosyltransferase  40.95 
 
 		 656 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0402312  normal  0.167793 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0149  glycosyl transferase family protein  49.71 
 
 		 450 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.975549 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0203  glycosyl transferase family protein  38.57 
 
 		 465 aa  170  9e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.678813  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0209  putative glycosyl transferase  46.11 
 
 		 219 aa  164  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0145  glycosyl transferase  42.11 
 
 		 216 aa  162  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.51395  normal  0.856095 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4863  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 		 461 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907872  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0635  glycosyl transferase family protein  35 
 
 		 471 aa  109  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00269925  normal  0.0269839 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5030  glycosyl transferase family protein  30.3 
 
 		 433 aa  108  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3771  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 		 433 aa  108  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  30.3 
 
 		 433 aa  107  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5356  glycosyl transferase domain-containing protein  29.54 
 
 		 433 aa  107  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4918  glycosyl transferase  30.3 
 
 		 433 aa  107  9e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0768338  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5327  glycosyl transferase, group 2 family  30.3 
 
 		 433 aa  107  9e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76631e-28 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4933  N-acetylglucosaminyltransferase  30.3 
 
 		 433 aa  106  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.443938  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0070  glycosyl transferase family 2  34.11 
 
 		 431 aa  105  3e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5361  N-acetylglucosaminyltransferase  30.74 
 
 		 433 aa  104  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.190593  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1766  glycosyl transferase family 2  30.42 
 
 		 505 aa  102  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.214339  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0984  glycosyl transferase family 2  28.28 
 
 		 393 aa  98.6  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00499556  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  27.74 
 
 		 399 aa  96.3  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2904  glycosyl transferase family protein  27.69 
 
 		 546 aa  94  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0670  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 		 501 aa  92  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0704  glycosyl transferase family 2  28.35 
 
 		 501 aa  90.9  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.441471  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0714  glycosyl transferase family protein  28.05 
 
 		 501 aa  89.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0487319  decreased coverage  0.00470024 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0705  glycosyl transferase family 2  28.35 
 
 		 501 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 		 549 aa  89  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  26.25 
 
 		 509 aa  87.4  8e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4704  glycosyl transferase family 2  28.67 
 
 		 483 aa  87.4  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0279225  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  27.53 
 
 		 395 aa  87  9e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  25.32 
 
 		 420 aa  87  9e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0095  glycosyl transferase family 2  27.87 
 
 		 494 aa  84.7  0.000000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.176574  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1567  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 		 492 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  25.28 
 
 		 475 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  25.28 
 
 		 475 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6620  glycosyl transferase family 2  28.94 
 
 		 508 aa  83.2  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05410  glycosyltransferase  25 
 
 		 490 aa  82  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1518  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28 
 
 		 767 aa  81.6  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0706082  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0332  response regulator receiver protein  27.81 
 
 		 806 aa  81.3  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112355  normal  0.937153 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0965  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  25.05 
 
 		 644 aa  80.9  0.00000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  28.05 
 
 		 633 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3032  glycosyl transferase family 2  27.32 
 
 		 627 aa  79  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.696996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0852  glycosyl transferase family protein  27.96 
 
 		 520 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1333  glycosyl transferase family protein  27.96 
 
 		 520 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3301  family 2 glycosyl transferase  26.45 
 
 		 469 aa  77.8  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144563  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2217  glycosyl transferase family protein  25.6 
 
 		 468 aa  77.4  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  29.53 
 
 		 505 aa  77  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0285  glycosyl transferase family protein  25.25 
 
 		 443 aa  76.6  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  29.53 
 
 		 662 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  29.53 
 
 		 520 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0015  glycosyl transferase family protein  27.52 
 
 		 684 aa  76.6  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2749  glycosyl transferase family protein  25.43 
 
 		 502 aa  76.3  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924892  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1315  glycosyl transferase family protein  27.99 
 
 		 520 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0430  glycosyl transferase family 2  25.1 
 
 		 473 aa  76.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.912379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5599  N-acetylglucosaminyltransferase  28.49 
 
 		 262 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0041999  hitchhiker  0.0000000000128208 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1478  glycosyl transferase family 2  26.72 
 
 		 533 aa  75.9  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0081  glycosyltransferase  26.19 
 
 		 435 aa  75.5  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000323026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1083  glycosyltransferase  29.17 
 
 		 458 aa  75.1  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014105 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  29.35 
 
 		 509 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2839  glycosyl transferase family 2  25.66 
 
 		 523 aa  75.1  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  28.99 
 
 		 509 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1562  glycosyl transferase family protein  25.59 
 
 		 435 aa  73.6  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>