78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0145 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0145  glycosyl transferase  100 
 
 
216 aa  436  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.51395  normal  0.856095 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0209  putative glycosyl transferase  82.65 
 
 
219 aa  367  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0998  glycosyl transferase family protein  59.8 
 
 
686 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.759416  normal  0.641778 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5168  glycosyl transferase family 2  56.35 
 
 
683 aa  229  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0886  glycosyl transferases  56.99 
 
 
673 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0424  glycosyl transferase family protein  42.58 
 
 
652 aa  167  9e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.32532  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1292  glycosyl transferase family protein  43.63 
 
 
642 aa  159  3e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2855  glycosyl transferase family 2  43.16 
 
 
624 aa  152  5e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.875286 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0207  hypothetical protein  42.86 
 
 
475 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4110  glycosyl transferase family protein  44.06 
 
 
626 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656691  normal  0.773085 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2382  glycosyl transferase family protein  44.62 
 
 
678 aa  144  9e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2964  glycosyl transferase family 2  40.48 
 
 
476 aa  144  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0324251  hitchhiker  0.00721921 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3200  glycosyl transferase family protein  38.12 
 
 
848 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0535  hypothetical protein  42.35 
 
 
417 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0525  hypothetical protein  43.43 
 
 
464 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1627  cell wall biogenesis glycosyltransferase  42.49 
 
 
656 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0402312  normal  0.167793 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0379  glycosyl transferase family protein  39.15 
 
 
626 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0547  hypothetical protein  42.35 
 
 
464 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41908  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0721  general secretion pathway protein E  40.62 
 
 
606 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.831257  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0577  glycosyltransferase  38.86 
 
 
664 aa  139  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3769  glycosyl transferase family protein  42.93 
 
 
632 aa  138  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997629  normal  0.300264 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2388  glycosyl transferase  40.1 
 
 
635 aa  138  7.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.445397  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2166  general secretion pathway protein E  38.46 
 
 
698 aa  137  8.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3225  glycosyl transferase family protein  40.2 
 
 
596 aa  137  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0693647  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.75 
 
 
573 aa  135  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0296  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.75 
 
 
630 aa  135  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0014  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.75 
 
 
656 aa  135  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3549  glycosyl transferase family protein  39.71 
 
 
614 aa  135  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.877744 
 
 
-
 
NC_002978  WD0431  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.76 
 
 
532 aa  135  5e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.802283  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3420  glycosyl transferase family 2  40.91 
 
 
616 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1949  General secretory system II protein E domain protein  39.51 
 
 
612 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2888  glycosyl transferase family 2  43.94 
 
 
615 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233699 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0980  glycosyl transferase family 2  38.02 
 
 
512 aa  132  3.9999999999999996e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0496  glycosyl transferase family protein  40.2 
 
 
537 aa  125  4.0000000000000003e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.741629  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1064  glycosyl transferase family protein  46.15 
 
 
650 aa  125  5e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.132947 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2861  glycosyl transferase family protein  41.43 
 
 
678 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.623061  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0522  general secretion pathway protein E  38.46 
 
 
636 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.450126  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1872  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 
604 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1245  glycosyl transferase family protein  38.66 
 
 
654 aa  122  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.620003 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2295  glycosyl transferase family protein  36.79 
 
 
509 aa  122  5e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2931  glycosyl transferase family 2  38.19 
 
 
664 aa  122  5e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0659  general secretion pathway protein E  37.62 
 
 
628 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.814938  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3092  hypothetical protein  32.32 
 
 
492 aa  89.7  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0965  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.08 
 
 
644 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0635  glycosyl transferase family protein  27.41 
 
 
471 aa  51.2  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00269925  normal  0.0269839 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0925  glycosyl transferase family 2  38.46 
 
 
586 aa  50.1  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4704  glycosyl transferase family 2  28.92 
 
 
483 aa  49.7  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0279225  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2627  glycosyl transferase family protein  31.21 
 
 
425 aa  49.7  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.528621  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  35.14 
 
 
1154 aa  49.3  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  28.21 
 
 
411 aa  48.5  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0070  glycosyl transferase family 2  40.98 
 
 
431 aa  48.1  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0383  glycosyl transferase family protein  39.06 
 
 
443 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.138846  normal  0.0930893 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3771  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 
433 aa  46.6  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4863  glycosyl transferase family protein  27.64 
 
 
461 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907872  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4933  N-acetylglucosaminyltransferase  36.36 
 
 
433 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.443938  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4918  glycosyl transferase  36.36 
 
 
433 aa  46.2  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0768338  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5030  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 
433 aa  46.2  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5356  glycosyl transferase domain-containing protein  36.36 
 
 
433 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  36.36 
 
 
433 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5361  N-acetylglucosaminyltransferase  36.36 
 
 
433 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.190593  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5327  glycosyl transferase, group 2 family  36.36 
 
 
433 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76631e-28 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  38.1 
 
 
549 aa  45.8  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0984  glycosyl transferase family 2  29.85 
 
 
393 aa  45.4  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00499556  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  36.11 
 
 
1120 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0081  glycosyltransferase  30.67 
 
 
435 aa  45.1  0.0009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000323026  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  30.17 
 
 
1124 aa  43.9  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  26.47 
 
 
633 aa  43.5  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  23.81 
 
 
395 aa  43.5  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4104  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 
512 aa  42.7  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
420 aa  42.7  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2377  cellulose synthase (UDP-forming)  37.5 
 
 
716 aa  42.4  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77594  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1088  glycosyl transferase family 2  23.76 
 
 
458 aa  42.4  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  27.36 
 
 
476 aa  42  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0560  glycosyl transferase family protein  35.94 
 
 
917 aa  42  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922438  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1562  glycosyl transferase family protein  28 
 
 
435 aa  42  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3921  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 
477 aa  42  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
1002 aa  41.6  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0464  glycosyl transferase family 2  32.39 
 
 
631 aa  41.6  0.01  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.219414  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>