More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_5168 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_5168  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
683 aa  1354    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0886  glycosyl transferases  55.19 
 
 
673 aa  659    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0998  glycosyl transferase family protein  61.11 
 
 
686 aa  758    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.759416  normal  0.641778 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0203  glycosyl transferase family protein  56.08 
 
 
465 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.678813  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0149  glycosyl transferase family protein  54.19 
 
 
450 aa  396  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.975549 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2382  glycosyl transferase family protein  43.48 
 
 
678 aa  354  2.9999999999999997e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2888  glycosyl transferase family 2  40 
 
 
615 aa  340  5e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233699 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0424  glycosyl transferase family protein  47.35 
 
 
652 aa  337  5.999999999999999e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.32532  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1292  glycosyl transferase family protein  44.07 
 
 
642 aa  325  1e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0577  glycosyltransferase  40.15 
 
 
664 aa  324  4e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2861  glycosyl transferase family protein  39.52 
 
 
678 aa  317  4e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.623061  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2855  glycosyl transferase family 2  36.58 
 
 
624 aa  313  6.999999999999999e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.875286 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0379  glycosyl transferase family protein  37.24 
 
 
626 aa  313  9e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3769  glycosyl transferase family protein  39.81 
 
 
632 aa  312  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997629  normal  0.300264 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1064  glycosyl transferase family protein  38.62 
 
 
650 aa  309  9e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.132947 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1949  General secretory system II protein E domain protein  46.84 
 
 
612 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0014  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.03 
 
 
656 aa  301  3e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2931  glycosyl transferase family 2  43 
 
 
664 aa  297  4e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0721  general secretion pathway protein E  42.55 
 
 
606 aa  293  8e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.831257  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4110  glycosyl transferase family protein  41.79 
 
 
626 aa  292  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656691  normal  0.773085 
 
 
-
 
NC_002978  WD0431  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.84 
 
 
532 aa  292  2e-77  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.802283  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2964  glycosyl transferase family 2  44.53 
 
 
476 aa  291  3e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0324251  hitchhiker  0.00721921 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1627  cell wall biogenesis glycosyltransferase  46.86 
 
 
656 aa  290  9e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0402312  normal  0.167793 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.22 
 
 
573 aa  287  5e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0296  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.03 
 
 
630 aa  285  2.0000000000000002e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1245  glycosyl transferase family protein  34.3 
 
 
654 aa  283  1e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.620003 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3420  glycosyl transferase family 2  36.83 
 
 
616 aa  280  6e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3549  glycosyl transferase family protein  44.28 
 
 
614 aa  280  6e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.877744 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3225  glycosyl transferase family protein  44.28 
 
 
596 aa  280  9e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0693647  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0980  glycosyl transferase family 2  41.01 
 
 
512 aa  279  1e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0207  hypothetical protein  41.04 
 
 
475 aa  274  3e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3200  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 
848 aa  272  2e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0496  glycosyl transferase family protein  41.61 
 
 
537 aa  271  2e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.741629  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0659  general secretion pathway protein E  41.39 
 
 
628 aa  271  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.814938  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2388  glycosyl transferase  41.36 
 
 
635 aa  270  5.9999999999999995e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.445397  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1872  glycosyl transferase family protein  42.59 
 
 
604 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0522  general secretion pathway protein E  42.59 
 
 
636 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.450126  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3092  hypothetical protein  42.35 
 
 
492 aa  262  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2166  general secretion pathway protein E  34.77 
 
 
698 aa  259  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0525  hypothetical protein  41.03 
 
 
464 aa  254  3e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0535  hypothetical protein  41.03 
 
 
417 aa  254  3e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0547  hypothetical protein  41.03 
 
 
464 aa  254  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41908  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2295  glycosyl transferase family protein  38.3 
 
 
509 aa  241  2e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0728  putative glycosyl transferases  48.72 
 
 
320 aa  232  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0145  glycosyl transferase  55.84 
 
 
216 aa  223  8e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.51395  normal  0.856095 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0209  putative glycosyl transferase  56.28 
 
 
219 aa  221  3e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  29.4 
 
 
420 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4704  glycosyl transferase family 2  31.36 
 
 
483 aa  110  8.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0279225  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4863  glycosyl transferase family protein  34.8 
 
 
461 aa  107  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907872  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0635  glycosyl transferase family protein  33.46 
 
 
471 aa  105  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00269925  normal  0.0269839 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  26.53 
 
 
395 aa  102  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2904  glycosyl transferase family protein  26.36 
 
 
546 aa  101  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1766  glycosyl transferase family 2  28.42 
 
 
505 aa  100  7e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.214339  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0332  response regulator receiver protein  30.3 
 
 
806 aa  99.4  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112355  normal  0.937153 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  27.1 
 
 
475 aa  98.2  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  27.1 
 
 
475 aa  98.2  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0984  glycosyl transferase family 2  25.15 
 
 
393 aa  97.8  6e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00499556  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0070  glycosyl transferase family 2  30.1 
 
 
431 aa  97.8  6e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0670  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 
501 aa  97.8  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1518  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.81 
 
 
767 aa  97.1  9e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0706082  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0704  glycosyl transferase family 2  30.36 
 
 
501 aa  97.4  9e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.441471  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
399 aa  96.7  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  27.97 
 
 
433 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3771  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 
433 aa  95.9  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5356  glycosyl transferase domain-containing protein  27.51 
 
 
433 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0705  glycosyl transferase family 2  30.36 
 
 
501 aa  95.5  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4933  N-acetylglucosaminyltransferase  27.2 
 
 
433 aa  95.1  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.443938  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5327  glycosyl transferase, group 2 family  27.2 
 
 
433 aa  94.7  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76631e-28 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4918  glycosyl transferase  27.2 
 
 
433 aa  94.7  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0768338  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  28.16 
 
 
549 aa  94.4  6e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5030  glycosyl transferase family protein  27.87 
 
 
433 aa  94  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3032  glycosyl transferase family 2  32.43 
 
 
627 aa  93.6  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.696996  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1567  glycosyl transferase family protein  30.11 
 
 
492 aa  92.4  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  28.8 
 
 
633 aa  90.9  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5361  N-acetylglucosaminyltransferase  26.47 
 
 
433 aa  91.3  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.190593  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  31.62 
 
 
505 aa  89.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  31.62 
 
 
662 aa  89.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  31.62 
 
 
520 aa  89.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0714  glycosyl transferase family protein  28.92 
 
 
501 aa  87.8  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0487319  decreased coverage  0.00470024 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  26.26 
 
 
476 aa  87.4  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3301  family 2 glycosyl transferase  25.52 
 
 
469 aa  86.7  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144563  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  29.73 
 
 
509 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0081  glycosyltransferase  24.34 
 
 
435 aa  86.7  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000323026  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  25.7 
 
 
509 aa  86.3  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  26.32 
 
 
461 aa  85.5  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1315  glycosyl transferase family protein  30.56 
 
 
520 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375095  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
509 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0852  glycosyl transferase family protein  30.56 
 
 
520 aa  84  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1333  glycosyl transferase family protein  30.56 
 
 
520 aa  84  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1411  glycosyl transferase family protein  31.71 
 
 
424 aa  83.2  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.584249 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0015  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 
684 aa  83.2  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6620  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
508 aa  82.4  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1478  glycosyl transferase family 2  26.52 
 
 
533 aa  82.4  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  26.99 
 
 
422 aa  82  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2217  glycosyl transferase family protein  27 
 
 
468 aa  82  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368513  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2749  glycosyl transferase family protein  26.5 
 
 
502 aa  81.3  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924892  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1083  glycosyltransferase  30.12 
 
 
458 aa  80.9  0.00000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014105 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0095  glycosyl transferase family 2  26.69 
 
 
494 aa  80.9  0.00000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.176574  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0735  glycosyl transferase family 2  26.19 
 
 
441 aa  80.1  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0383  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
443 aa  79  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.138846  normal  0.0930893 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>