76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0209 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0209  putative glycosyl transferase  100 
 
 		 219 aa  442  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0145  glycosyl transferase  81.74 
 
 		 216 aa  356  1.9999999999999998e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.51395  normal  0.856095 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0998  glycosyl transferase family protein  56.34 
 
 		 686 aa  232  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.759416  normal  0.641778 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5168  glycosyl transferase family 2  56.28 
 
 		 683 aa  222  4e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0886  glycosyl transferases  52.47 
 
 		 673 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0424  glycosyl transferase family protein  46.11 
 
 		 652 aa  164  8e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.32532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2964  glycosyl transferase family 2  40.09 
 
 		 476 aa  151  8e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0324251  hitchhiker  0.00721921 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1292  glycosyl transferase family protein  42.35 
 
 		 642 aa  151  8e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0207  hypothetical protein  40.78 
 
 		 475 aa  148  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4110  glycosyl transferase family protein  42.57 
 
 		 626 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656691  normal  0.773085 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2382  glycosyl transferase family protein  39.59 
 
 		 678 aa  143  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0721  general secretion pathway protein E  39.9 
 
 		 606 aa  141  6e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.831257  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2855  glycosyl transferase family 2  41.24 
 
 		 624 aa  141  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.875286 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0525  hypothetical protein  42.64 
 
 		 464 aa  141  9e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0547  hypothetical protein  42.64 
 
 		 464 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0535  hypothetical protein  42.86 
 
 		 417 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0014  glycosyl transferase, group 2 family protein  43.15 
 
 		 656 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0379  glycosyl transferase family protein  40.1 
 
 		 626 aa  138  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0577  glycosyltransferase  36.27 
 
 		 664 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0980  glycosyl transferase family 2  40.41 
 
 		 512 aa  137  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3200  glycosyl transferase family protein  37.63 
 
 		 848 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0496  glycosyl transferase family protein  41.15 
 
 		 537 aa  135  4e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.741629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1627  cell wall biogenesis glycosyltransferase  41.97 
 
 		 656 aa  135  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0402312  normal  0.167793 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3420  glycosyl transferase family 2  40.83 
 
 		 616 aa  135  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3225  glycosyl transferase family protein  41.4 
 
 		 596 aa  135  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0693647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.62 
 
 		 573 aa  135  6.0000000000000005e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0296  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.62 
 
 		 630 aa  135  6.0000000000000005e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3549  glycosyl transferase family protein  40.93 
 
 		 614 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.877744 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3769  glycosyl transferase family protein  41.88 
 
 		 632 aa  132  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997629  normal  0.300264 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2166  general secretion pathway protein E  37.5 
 
 		 698 aa  132  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2388  glycosyl transferase  40 
 
 		 635 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.445397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1949  General secretory system II protein E domain protein  40.51 
 
 		 612 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2888  glycosyl transferase family 2  42.79 
 
 		 615 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233699 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1064  glycosyl transferase family protein  45.24 
 
 		 650 aa  125  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.132947 
 
 
-
 
NC_002978  WD0431  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.68 
 
 		 532 aa  123  2e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.802283  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0659  general secretion pathway protein E  36.99 
 
 		 628 aa  123  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.814938  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1872  glycosyl transferase family protein  37.95 
 
 		 604 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2861  glycosyl transferase family protein  39.9 
 
 		 678 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.623061  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0522  general secretion pathway protein E  37.95 
 
 		 636 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.450126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2931  glycosyl transferase family 2  36.89 
 
 		 664 aa  119  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2295  glycosyl transferase family protein  37.24 
 
 		 509 aa  118  9e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1245  glycosyl transferase family protein  37.11 
 
 		 654 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.620003 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3092  hypothetical protein  34.74 
 
 		 492 aa  90.9  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0965  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.81 
 
 		 644 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  27.6 
 
 		 411 aa  54.7  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0635  glycosyl transferase family protein  30.41 
 
 		 471 aa  52.4  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00269925  normal  0.0269839 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0925  glycosyl transferase family 2  42.42 
 
 		 586 aa  51.6  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4863  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 		 461 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907872  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  36.73 
 
 		 1154 aa  48.5  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0070  glycosyl transferase family 2  34.29 
 
 		 431 aa  48.1  0.00009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2627  glycosyl transferase family protein  28 
 
 		 425 aa  47  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.528621  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4704  glycosyl transferase family 2  27.36 
 
 		 483 aa  47.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0279225  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0383  glycosyl transferase family protein  38.33 
 
 		 443 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.138846  normal  0.0930893 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3771  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 		 433 aa  45.4  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 549 aa  45.4  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5030  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 		 433 aa  45.1  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5361  N-acetylglucosaminyltransferase  36.36 
 
 		 433 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.190593  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4918  glycosyl transferase  36.36 
 
 		 433 aa  45.1  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0768338  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5327  glycosyl transferase, group 2 family  36.36 
 
 		 433 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76631e-28 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4933  N-acetylglucosaminyltransferase  36.36 
 
 		 433 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.443938  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5356  glycosyl transferase domain-containing protein  36.36 
 
 		 433 aa  45.1  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  36.36 
 
 		 433 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0464  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 631 aa  44.3  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.219414  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0560  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 		 917 aa  43.5  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0081  glycosyltransferase  35.59 
 
 		 435 aa  44.3  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000323026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1372  glycosyl transferase family protein  29.57 
 
 		 859 aa  43.1  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0188568  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0984  glycosyl transferase family 2  29.85 
 
 		 393 aa  43.5  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00499556  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  24.88 
 
 		 476 aa  42.7  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  35.21 
 
 		 1120 aa  42.7  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3921  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 		 477 aa  42  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  33.94 
 
 		 1099 aa  42  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  32.38 
 
 		 1124 aa  42  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  32.31 
 
 		 420 aa  42  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4104  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 		 512 aa  42  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1562  glycosyl transferase family protein  33.9 
 
 		 435 aa  41.6  0.009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0285  glycosyl transferase family protein  28.11 
 
 		 443 aa  41.6  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>