More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0965 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0965  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  100 
 
 		 644 aa  1276    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4863  glycosyl transferase family protein  45.12 
 
 		 461 aa  331  2e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907872  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0070  glycosyl transferase family 2  35.41 
 
 		 431 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1872  glycosyl transferase family protein  31.28 
 
 		 604 aa  120  6e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0522  general secretion pathway protein E  31.28 
 
 		 636 aa  120  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.450126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0659  general secretion pathway protein E  32.81 
 
 		 628 aa  112  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.814938  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  30.49 
 
 		 420 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0496  glycosyl transferase family protein  29.77 
 
 		 537 aa  109  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.741629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2295  glycosyl transferase family protein  31.76 
 
 		 509 aa  107  6e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0980  glycosyl transferase family 2  29.29 
 
 		 512 aa  103  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2166  general secretion pathway protein E  30.67 
 
 		 698 aa  103  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1245  glycosyl transferase family protein  31.52 
 
 		 654 aa  101  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.620003 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  28.99 
 
 		 395 aa  99.8  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1949  General secretory system II protein E domain protein  29.89 
 
 		 612 aa  95.9  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0984  glycosyl transferase family 2  27.76 
 
 		 393 aa  95.5  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00499556  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4110  glycosyl transferase family protein  28.25 
 
 		 626 aa  95.1  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656691  normal  0.773085 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0014  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.76 
 
 		 656 aa  94.7  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1292  glycosyl transferase family protein  27.58 
 
 		 642 aa  95.1  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0379  glycosyl transferase family protein  26.28 
 
 		 626 aa  93.6  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1627  cell wall biogenesis glycosyltransferase  29.37 
 
 		 656 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0402312  normal  0.167793 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2931  glycosyl transferase family 2  27.4 
 
 		 664 aa  91.3  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2855  glycosyl transferase family 2  26.54 
 
 		 624 aa  90.5  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.875286 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0207  hypothetical protein  26.13 
 
 		 475 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2388  glycosyl transferase  27.45 
 
 		 635 aa  90.1  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.445397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2382  glycosyl transferase family protein  29.9 
 
 		 678 aa  89  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3225  glycosyl transferase family protein  29.73 
 
 		 596 aa  89  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0693647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  23.33 
 
 		 475 aa  85.5  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  23.33 
 
 		 475 aa  85.5  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3549  glycosyl transferase family protein  30.16 
 
 		 614 aa  84.7  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.877744 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2964  glycosyl transferase family 2  27.89 
 
 		 476 aa  84.3  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0324251  hitchhiker  0.00721921 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0886  glycosyl transferases  28.12 
 
 		 673 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2888  glycosyl transferase family 2  31.1 
 
 		 615 aa  83.2  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233699 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2861  glycosyl transferase family protein  29.5 
 
 		 678 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.623061  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.82 
 
 		 573 aa  81.6  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3420  glycosyl transferase family 2  28.72 
 
 		 616 aa  81.6  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0998  glycosyl transferase family protein  26.93 
 
 		 686 aa  80.9  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.759416  normal  0.641778 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3092  hypothetical protein  26.91 
 
 		 492 aa  80.5  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 399 aa  80.5  0.00000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0424  glycosyl transferase family protein  25.81 
 
 		 652 aa  79.7  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.32532  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0296  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.57 
 
 		 630 aa  80.1  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0525  hypothetical protein  24.51 
 
 		 464 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0547  hypothetical protein  24.51 
 
 		 464 aa  79  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4425  glycosyl transferase family 2  23.67 
 
 		 476 aa  78.2  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0535  hypothetical protein  24.51 
 
 		 417 aa  78.2  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0431  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.07 
 
 		 532 aa  76.6  0.000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.802283  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4949  glycosyl transferase family protein  25.22 
 
 		 446 aa  76.6  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816666  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1562  glycosyl transferase family protein  26.35 
 
 		 435 aa  76.6  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1064  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 650 aa  75.9  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.132947 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3200  glycosyl transferase family protein  23.72 
 
 		 848 aa  76.3  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0721  general secretion pathway protein E  26.34 
 
 		 606 aa  74.7  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.831257  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1210  glycosyl transferase family 2  23.7 
 
 		 444 aa  73.9  0.000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.47071  normal  0.038027 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5356  glycosyl transferase domain-containing protein  23.91 
 
 		 433 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4918  glycosyl transferase  23.91 
 
 		 433 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0768338  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5327  glycosyl transferase, group 2 family  23.91 
 
 		 433 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76631e-28 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  23.91 
 
 		 433 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4933  N-acetylglucosaminyltransferase  23.85 
 
 		 433 aa  71.6  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.443938  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  26.52 
 
 		 662 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3771  glycosyl transferase family protein  23.32 
 
 		 433 aa  71.2  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  27.88 
 
 		 520 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5030  glycosyl transferase family protein  23.62 
 
 		 433 aa  70.5  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0835  glycosyl transferase family 2  22.84 
 
 		 435 aa  69.7  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.445477  hitchhiker  0.00049802 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  23.44 
 
 		 1115 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1831  glycosyltransferase  27.18 
 
 		 473 aa  70.1  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0577  glycosyltransferase  26.7 
 
 		 664 aa  70.1  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3769  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 		 632 aa  69.7  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997629  normal  0.300264 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  26.16 
 
 		 505 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0081  glycosyltransferase  23.73 
 
 		 435 aa  68.6  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000323026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5361  N-acetylglucosaminyltransferase  23.32 
 
 		 433 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.190593  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0560  glycosyl transferase family protein  24.92 
 
 		 917 aa  68.6  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0370  glycosyl transferase family 2  23.84 
 
 		 438 aa  67.8  0.0000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0460104  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2334  glycosyl transferase family 2  27.3 
 
 		 417 aa  67.4  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.876722  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  23.57 
 
 		 872 aa  67  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0992  cellulose synthase (UDP-forming)  21.86 
 
 		 501 aa  67.4  0.0000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.832352 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  28.06 
 
 		 633 aa  67  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1675  glycosyl transferase family 2  25.4 
 
 		 415 aa  66.2  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5168  glycosyl transferase family 2  27.09 
 
 		 683 aa  66.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0714  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 501 aa  66.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0487319  decreased coverage  0.00470024 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2016  glycosyl transferase family protein  25.88 
 
 		 402 aa  65.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.323936  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  23.19 
 
 		 927 aa  64.7  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2904  glycosyl transferase family protein  23.36 
 
 		 546 aa  64.3  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  23.19 
 
 		 1115 aa  64.3  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  22.94 
 
 		 1115 aa  64.3  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  22.94 
 
 		 1115 aa  63.9  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  23.19 
 
 		 1119 aa  63.9  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  26.95 
 
 		 509 aa  63.9  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2749  glycosyl transferase family protein  24.34 
 
 		 502 aa  63.5  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924892  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  26.6 
 
 		 509 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3597  glycosyltransferase  23.88 
 
 		 741 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  26.15 
 
 		 752 aa  62.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0430  glycosyl transferase family 2  23.66 
 
 		 473 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.912379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0177  glycosyl transferase family 2  25.24 
 
 		 425 aa  62.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00145418  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1088  glycosyl transferase family 2  22.84 
 
 		 458 aa  62.4  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0057  putative glycosyltransferase  24.91 
 
 		 443 aa  62  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0925  glycosyl transferase family 2  25.94 
 
 		 586 aa  62  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  26.46 
 
 		 422 aa  62  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6543  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  24.05 
 
 		 514 aa  61.6  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000751744 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0060  putative glycosyltransferase  24.93 
 
 		 439 aa  61.6  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1398  cellulose synthase (UDP-forming)  24.15 
 
 		 740 aa  61.2  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00289904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2308  glycosyl transferase family 2  23.58 
 
 		 610 aa  61.6  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0847563  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2627  glycosyl transferase family protein  27.39 
 
 		 425 aa  61.2  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.528621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>