More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1064 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1064  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
650 aa  1289    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.132947 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2888  glycosyl transferase family 2  51.69 
 
 
615 aa  515  1e-144  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233699 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3769  glycosyl transferase family protein  43.47 
 
 
632 aa  381  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997629  normal  0.300264 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2861  glycosyl transferase family protein  41.69 
 
 
678 aa  373  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.623061  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3420  glycosyl transferase family 2  40.83 
 
 
616 aa  353  5e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0998  glycosyl transferase family protein  40.3 
 
 
686 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.759416  normal  0.641778 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0577  glycosyltransferase  36.35 
 
 
664 aa  333  6e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3549  glycosyl transferase family protein  40.16 
 
 
614 aa  332  1e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.877744 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0886  glycosyl transferases  47.1 
 
 
673 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3225  glycosyl transferase family protein  47.96 
 
 
596 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0693647  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2382  glycosyl transferase family protein  39.87 
 
 
678 aa  321  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0424  glycosyl transferase family protein  42.49 
 
 
652 aa  308  2.0000000000000002e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.32532  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1627  cell wall biogenesis glycosyltransferase  39.05 
 
 
656 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0402312  normal  0.167793 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0014  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.91 
 
 
656 aa  304  3.0000000000000004e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5168  glycosyl transferase family 2  38.62 
 
 
683 aa  303  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0496  glycosyl transferase family protein  45.15 
 
 
537 aa  302  1e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.741629  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4110  glycosyl transferase family protein  34.54 
 
 
626 aa  301  3e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656691  normal  0.773085 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0379  glycosyl transferase family protein  35.58 
 
 
626 aa  295  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2855  glycosyl transferase family 2  36.07 
 
 
624 aa  293  5e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.875286 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1292  glycosyl transferase family protein  41.42 
 
 
642 aa  288  2e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2964  glycosyl transferase family 2  40.55 
 
 
476 aa  287  4e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0324251  hitchhiker  0.00721921 
 
 
-
 
NC_002978  WD0431  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.19 
 
 
532 aa  285  2.0000000000000002e-75  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.802283  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2931  glycosyl transferase family 2  40.92 
 
 
664 aa  278  3e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0721  general secretion pathway protein E  41.41 
 
 
606 aa  276  6e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.831257  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1245  glycosyl transferase family protein  42.59 
 
 
654 aa  275  2.0000000000000002e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.620003 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.7 
 
 
573 aa  270  8e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1949  General secretory system II protein E domain protein  39.09 
 
 
612 aa  269  1e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0659  general secretion pathway protein E  37.61 
 
 
628 aa  267  5e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.814938  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_004310  BR0296  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.5 
 
 
630 aa  265  1e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2166  general secretion pathway protein E  34.88 
 
 
698 aa  265  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1872  glycosyl transferase family protein  42.22 
 
 
604 aa  265  3e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0522  general secretion pathway protein E  42.57 
 
 
636 aa  264  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.450126  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2388  glycosyl transferase  39.95 
 
 
635 aa  264  4e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.445397  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0980  glycosyl transferase family 2  40 
 
 
512 aa  259  9e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0207  hypothetical protein  40 
 
 
475 aa  249  8e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3092  hypothetical protein  39.11 
 
 
492 aa  248  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3200  glycosyl transferase family protein  36.27 
 
 
848 aa  249  2e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0525  hypothetical protein  41.45 
 
 
464 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0535  hypothetical protein  40.86 
 
 
417 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0547  hypothetical protein  41.45 
 
 
464 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41908  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2295  glycosyl transferase family protein  35.67 
 
 
509 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0203  glycosyl transferase family protein  37.8 
 
 
465 aa  200  7e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.678813  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0149  glycosyl transferase family protein  54.29 
 
 
450 aa  188  3e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.975549 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0209  putative glycosyl transferase  45.24 
 
 
219 aa  144  6e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0145  glycosyl transferase  45.03 
 
 
216 aa  139  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.51395  normal  0.856095 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4863  glycosyl transferase family protein  35.32 
 
 
461 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907872  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  30.89 
 
 
420 aa  114  8.000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  27.4 
 
 
399 aa  106  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5030  glycosyl transferase family protein  31 
 
 
433 aa  106  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5361  N-acetylglucosaminyltransferase  30.26 
 
 
433 aa  105  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.190593  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5327  glycosyl transferase, group 2 family  30.63 
 
 
433 aa  104  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76631e-28 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4918  glycosyl transferase  30.63 
 
 
433 aa  104  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0768338  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4933  N-acetylglucosaminyltransferase  30.63 
 
 
433 aa  104  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.443938  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  31 
 
 
433 aa  103  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5356  glycosyl transferase domain-containing protein  31 
 
 
433 aa  103  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0984  glycosyl transferase family 2  24.8 
 
 
393 aa  102  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00499556  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0635  glycosyl transferase family protein  32.67 
 
 
471 aa  102  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00269925  normal  0.0269839 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  30.13 
 
 
395 aa  101  4e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0332  response regulator receiver protein  29.15 
 
 
806 aa  98.2  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112355  normal  0.937153 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3771  glycosyl transferase family protein  27.92 
 
 
433 aa  97.8  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  28.57 
 
 
662 aa  96.3  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  28.57 
 
 
520 aa  96.3  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  28.33 
 
 
505 aa  94  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  32.54 
 
 
509 aa  94  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1478  glycosyl transferase family 2  29.77 
 
 
533 aa  93.6  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  28.46 
 
 
633 aa  91.7  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  32.2 
 
 
509 aa  91.3  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0704  glycosyl transferase family 2  29.2 
 
 
501 aa  90.9  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.441471  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1518  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.5 
 
 
767 aa  90.5  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0706082  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4704  glycosyl transferase family 2  28.21 
 
 
483 aa  90.5  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0279225  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1562  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
435 aa  89.7  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0705  glycosyl transferase family 2  29.2 
 
 
501 aa  89  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0670  glycosyl transferase family protein  28.91 
 
 
501 aa  88.6  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0070  glycosyl transferase family 2  28.91 
 
 
431 aa  87.8  6e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1567  glycosyl transferase family protein  26.35 
 
 
492 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1766  glycosyl transferase family 2  25.3 
 
 
505 aa  85.9  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.214339  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  28.28 
 
 
475 aa  85.1  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  28.28 
 
 
475 aa  85.1  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0095  glycosyl transferase family 2  23.78 
 
 
494 aa  85.1  0.000000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.176574  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  25.65 
 
 
509 aa  84  0.000000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0015  glycosyl transferase family protein  26.21 
 
 
684 aa  84.3  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0714  glycosyl transferase family protein  28.15 
 
 
501 aa  84  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0487319  decreased coverage  0.00470024 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0081  glycosyltransferase  23.59 
 
 
435 aa  84  0.000000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000323026  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1788  glycosyl transferase family protein  24.24 
 
 
418 aa  84  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0852  glycosyl transferase family protein  29.67 
 
 
520 aa  84  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1333  glycosyl transferase family protein  29.67 
 
 
520 aa  84  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  27.98 
 
 
476 aa  83.6  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1315  glycosyl transferase family protein  29.67 
 
 
520 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375095  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2904  glycosyl transferase family protein  26.24 
 
 
546 aa  83.2  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0965  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.06 
 
 
644 aa  82  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3032  glycosyl transferase family 2  30.29 
 
 
627 aa  80.9  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.696996  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05410  glycosyltransferase  23.48 
 
 
490 aa  80.5  0.00000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  24.73 
 
 
549 aa  80.1  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0060  putative glycosyltransferase  30.12 
 
 
439 aa  79.3  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0430  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 
473 aa  79  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.912379  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1083  glycosyltransferase  29.46 
 
 
458 aa  78.2  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014105 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6620  glycosyl transferase family 2  28.91 
 
 
508 aa  77  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4949  glycosyl transferase family protein  26.52 
 
 
446 aa  75.1  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816666  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0649  glycosyl transferase family protein  29.51 
 
 
421 aa  75.5  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.113034 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5599  N-acetylglucosaminyltransferase  30.89 
 
 
262 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0041999  hitchhiker  0.0000000000128208 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>