120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0203 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0149  glycosyl transferase family protein  82.42 
 
 		 450 aa  646    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.975549 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0203  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 465 aa  920    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.678813  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0998  glycosyl transferase family protein  55.97 
 
 		 686 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.759416  normal  0.641778 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0886  glycosyl transferases  56.44 
 
 		 673 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5168  glycosyl transferase family 2  56.08 
 
 		 683 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0728  putative glycosyl transferases  51.27 
 
 		 320 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2382  glycosyl transferase family protein  41.42 
 
 		 678 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2888  glycosyl transferase family 2  37.66 
 
 		 615 aa  209  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233699 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1064  glycosyl transferase family protein  37.8 
 
 		 650 aa  200  5e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.132947 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2861  glycosyl transferase family protein  38.1 
 
 		 678 aa  200  5e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.623061  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0014  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.57 
 
 		 656 aa  186  6e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3769  glycosyl transferase family protein  38.36 
 
 		 632 aa  186  9e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997629  normal  0.300264 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0379  glycosyl transferase family protein  35.23 
 
 		 626 aa  178  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2931  glycosyl transferase family 2  40.76 
 
 		 664 aa  177  4e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0496  glycosyl transferase family protein  43.78 
 
 		 537 aa  174  3.9999999999999995e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.741629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.94 
 
 		 573 aa  173  5e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1292  glycosyl transferase family protein  48.07 
 
 		 642 aa  172  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0296  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.64 
 
 		 630 aa  171  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1949  General secretory system II protein E domain protein  48.55 
 
 		 612 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0424  glycosyl transferase family protein  36.9 
 
 		 652 aa  167  5e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.32532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3420  glycosyl transferase family 2  34.61 
 
 		 616 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3092  hypothetical protein  42.06 
 
 		 492 aa  163  6e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2855  glycosyl transferase family 2  36.56 
 
 		 624 aa  162  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.875286 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3549  glycosyl transferase family protein  36.83 
 
 		 614 aa  162  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.877744 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3225  glycosyl transferase family protein  49.73 
 
 		 596 aa  160  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0693647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0577  glycosyltransferase  49.41 
 
 		 664 aa  160  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2964  glycosyl transferase family 2  41.9 
 
 		 476 aa  160  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0324251  hitchhiker  0.00721921 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4110  glycosyl transferase family protein  45.66 
 
 		 626 aa  156  6e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656691  normal  0.773085 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1627  cell wall biogenesis glycosyltransferase  52.94 
 
 		 656 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0402312  normal  0.167793 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0721  general secretion pathway protein E  40.69 
 
 		 606 aa  150  5e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.831257  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0431  glycosyl transferase, group 2 family protein  40 
 
 		 532 aa  150  6e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.802283  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0659  general secretion pathway protein E  43.37 
 
 		 628 aa  144  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.814938  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1872  glycosyl transferase family protein  42.35 
 
 		 604 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0522  general secretion pathway protein E  42.35 
 
 		 636 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.450126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0980  glycosyl transferase family 2  43.18 
 
 		 512 aa  142  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0207  hypothetical protein  40.68 
 
 		 475 aa  140  6e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1245  glycosyl transferase family protein  30.2 
 
 		 654 aa  139  8.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.620003 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0547  hypothetical protein  38.36 
 
 		 464 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0525  hypothetical protein  38.36 
 
 		 464 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0535  hypothetical protein  40 
 
 		 417 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2388  glycosyl transferase  42.69 
 
 		 635 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.445397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3200  glycosyl transferase family protein  35.94 
 
 		 848 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2295  glycosyl transferase family protein  36.23 
 
 		 509 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2166  general secretion pathway protein E  43.35 
 
 		 698 aa  123  7e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  34.48 
 
 		 420 aa  80.1  0.00000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1518  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.78 
 
 		 767 aa  70.9  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0706082  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0332  response regulator receiver protein  31.35 
 
 		 806 aa  67.4  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112355  normal  0.937153 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4863  glycosyl transferase family protein  32.54 
 
 		 461 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907872  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0670  glycosyl transferase family protein  33.15 
 
 		 501 aa  60.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1567  glycosyl transferase family protein  32.86 
 
 		 492 aa  60.5  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  27.84 
 
 		 509 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0704  glycosyl transferase family 2  32.78 
 
 		 501 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.441471  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 		 509 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  26.64 
 
 		 662 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  26.55 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0705  glycosyl transferase family 2  32.22 
 
 		 501 aa  57.4  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0015  glycosyl transferase family protein  29.07 
 
 		 684 aa  56.6  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18491  glycosyl transferase family protein  27.37 
 
 		 433 aa  56.6  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.249822  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0852  glycosyl transferase family protein  29.14 
 
 		 520 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1333  glycosyl transferase family protein  29.14 
 
 		 520 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  26.54 
 
 		 505 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  26.54 
 
 		 520 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3301  family 2 glycosyl transferase  26.09 
 
 		 469 aa  56.2  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144563  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1315  glycosyl transferase family protein  29.14 
 
 		 520 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3032  glycosyl transferase family 2  27.15 
 
 		 627 aa  55.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.696996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1375  glycosyl transferase family 2  28.42 
 
 		 433 aa  55.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2217  glycosyl transferase family protein  26.87 
 
 		 468 aa  55.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1083  glycosyltransferase  28.66 
 
 		 458 aa  55.1  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014105 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0635  glycosyl transferase family protein  29.61 
 
 		 471 aa  54.3  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00269925  normal  0.0269839 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  28.82 
 
 		 633 aa  53.9  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1766  glycosyl transferase family 2  24.29 
 
 		 505 aa  53.1  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.214339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0430  glycosyl transferase family 2  28.06 
 
 		 473 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.912379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  26.17 
 
 		 475 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1478  glycosyl transferase family 2  29.58 
 
 		 533 aa  51.6  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  26.17 
 
 		 475 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2904  glycosyl transferase family protein  24.87 
 
 		 546 aa  51.2  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0714  glycosyl transferase family protein  28.89 
 
 		 501 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0487319  decreased coverage  0.00470024 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3583  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 395 aa  51.2  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4425  glycosyl transferase family 2  27.19 
 
 		 476 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0095  glycosyl transferase family 2  26.55 
 
 		 494 aa  50.4  0.00006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.176574  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4704  glycosyl transferase family 2  27.36 
 
 		 483 aa  50.4  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0279225  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  27.54 
 
 		 461 aa  50.4  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6620  glycosyl transferase family 2  28.41 
 
 		 508 aa  50.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2749  glycosyl transferase family protein  26 
 
 		 502 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924892  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  27.45 
 
 		 549 aa  49.7  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05410  glycosyltransferase  27.5 
 
 		 490 aa  48.5  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  25.4 
 
 		 841 aa  47.8  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0070  glycosyl transferase family 2  28.9 
 
 		 431 aa  47.8  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5599  N-acetylglucosaminyltransferase  23 
 
 		 262 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0041999  hitchhiker  0.0000000000128208 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1751  glycosyl transferase family protein  28 
 
 		 433 aa  47.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.121941  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1562  glycosyl transferase family protein  29.73 
 
 		 435 aa  47.4  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0081  glycosyltransferase  26.14 
 
 		 435 aa  47.4  0.0006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000323026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1777  glycosyl transferase family 2  28.68 
 
 		 802 aa  47.4  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5087  N-acetylglucosaminyltransferase, N-terminus (glycosyl transferase)  22.37 
 
 		 218 aa  47  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0472  glycosyl transferase family protein  34.34 
 
 		 365 aa  47  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18491  glycosyl transferase family protein  30.39 
 
 		 433 aa  47  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.468741  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2470  glycosyl transferase family 2  31.01 
 
 		 801 aa  47  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18681  glycosyl transferase family protein  27.33 
 
 		 433 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2214  glycosyl transferase family 2  26.17 
 
 		 371 aa  45.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3771  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 		 433 aa  45.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>