120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0149 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0149  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
450 aa  890    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.975549 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0203  glycosyl transferase family protein  81.06 
 
 
465 aa  667    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.678813  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0998  glycosyl transferase family protein  56.65 
 
 
686 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.759416  normal  0.641778 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0886  glycosyl transferases  55.27 
 
 
673 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5168  glycosyl transferase family 2  53.26 
 
 
683 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0728  putative glycosyl transferases  49.64 
 
 
320 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2888  glycosyl transferase family 2  40.35 
 
 
615 aa  207  3e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233699 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2382  glycosyl transferase family protein  41.04 
 
 
678 aa  203  5e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2861  glycosyl transferase family protein  38.54 
 
 
678 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.623061  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1064  glycosyl transferase family protein  51.21 
 
 
650 aa  194  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.132947 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3769  glycosyl transferase family protein  38.32 
 
 
632 aa  190  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997629  normal  0.300264 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2931  glycosyl transferase family 2  42.13 
 
 
664 aa  181  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1292  glycosyl transferase family protein  50.29 
 
 
642 aa  179  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0379  glycosyl transferase family protein  34.38 
 
 
626 aa  177  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.91 
 
 
573 aa  176  7e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0424  glycosyl transferase family protein  49.71 
 
 
652 aa  174  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.32532  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0296  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.58 
 
 
630 aa  173  5e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2855  glycosyl transferase family 2  45.71 
 
 
624 aa  173  6.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.875286 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0577  glycosyltransferase  51.18 
 
 
664 aa  172  9e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0014  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.71 
 
 
656 aa  171  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1949  General secretory system II protein E domain protein  48.57 
 
 
612 aa  170  4e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4110  glycosyl transferase family protein  48 
 
 
626 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656691  normal  0.773085 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3549  glycosyl transferase family protein  51.67 
 
 
614 aa  168  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.877744 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3420  glycosyl transferase family 2  35.55 
 
 
616 aa  167  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3225  glycosyl transferase family protein  50.56 
 
 
596 aa  166  9e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0693647  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3092  hypothetical protein  43.7 
 
 
492 aa  164  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0496  glycosyl transferase family protein  43.72 
 
 
537 aa  162  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.741629  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2964  glycosyl transferase family 2  45.71 
 
 
476 aa  161  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0324251  hitchhiker  0.00721921 
 
 
-
 
NC_002978  WD0431  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.55 
 
 
532 aa  160  4e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.802283  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1627  cell wall biogenesis glycosyltransferase  53.14 
 
 
656 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0402312  normal  0.167793 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0721  general secretion pathway protein E  35.52 
 
 
606 aa  156  6e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.831257  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0659  general secretion pathway protein E  34.07 
 
 
628 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.814938  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0980  glycosyl transferase family 2  43.75 
 
 
512 aa  147  5e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1872  glycosyl transferase family protein  41.76 
 
 
604 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0522  general secretion pathway protein E  41.76 
 
 
636 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.450126  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0535  hypothetical protein  40.5 
 
 
417 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0547  hypothetical protein  40.3 
 
 
464 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41908  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0525  hypothetical protein  40.3 
 
 
464 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1245  glycosyl transferase family protein  30.63 
 
 
654 aa  141  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.620003 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0207  hypothetical protein  40.11 
 
 
475 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3200  glycosyl transferase family protein  36.92 
 
 
848 aa  139  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2388  glycosyl transferase  36.11 
 
 
635 aa  136  7.000000000000001e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.445397  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2295  glycosyl transferase family protein  36.96 
 
 
509 aa  126  6e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2166  general secretion pathway protein E  32.6 
 
 
698 aa  126  8.000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  36.21 
 
 
420 aa  87.4  4e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0332  response regulator receiver protein  32.07 
 
 
806 aa  68.9  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112355  normal  0.937153 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1518  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.63 
 
 
767 aa  68.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0706082  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4863  glycosyl transferase family protein  34.84 
 
 
461 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907872  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  28 
 
 
399 aa  62  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0635  glycosyl transferase family protein  30.54 
 
 
471 aa  60.8  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00269925  normal  0.0269839 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1315  glycosyl transferase family protein  30.06 
 
 
520 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375095  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0852  glycosyl transferase family protein  30.06 
 
 
520 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1333  glycosyl transferase family protein  30.06 
 
 
520 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  28.11 
 
 
509 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  29.19 
 
 
662 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1567  glycosyl transferase family protein  33.57 
 
 
492 aa  60.1  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  29.19 
 
 
505 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5087  N-acetylglucosaminyltransferase, N-terminus (glycosyl transferase)  23.96 
 
 
218 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3032  glycosyl transferase family 2  31.52 
 
 
627 aa  58.9  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.696996  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3301  family 2 glycosyl transferase  28.5 
 
 
469 aa  58.9  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144563  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  27.57 
 
 
509 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  29.19 
 
 
520 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5599  N-acetylglucosaminyltransferase  23.44 
 
 
262 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0041999  hitchhiker  0.0000000000128208 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0015  glycosyl transferase family protein  30.46 
 
 
684 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1083  glycosyltransferase  28.4 
 
 
458 aa  57.8  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014105 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3771  glycosyl transferase family protein  24 
 
 
433 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5030  glycosyl transferase family protein  24.49 
 
 
433 aa  55.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  26.83 
 
 
475 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1766  glycosyl transferase family 2  25.71 
 
 
505 aa  54.7  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.214339  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  26.83 
 
 
475 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2217  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 
468 aa  53.9  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368513  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  29.55 
 
 
633 aa  54.3  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05410  glycosyltransferase  27.15 
 
 
490 aa  53.9  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3583  glycosyl transferase family protein  29.23 
 
 
395 aa  53.5  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0704  glycosyl transferase family 2  31.14 
 
 
501 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.441471  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4933  N-acetylglucosaminyltransferase  25 
 
 
433 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.443938  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1751  glycosyl transferase family protein  26.82 
 
 
433 aa  53.1  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.121941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4918  glycosyl transferase  25 
 
 
433 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0768338  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0095  glycosyl transferase family 2  28.41 
 
 
494 aa  53.1  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.176574  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18491  glycosyl transferase family protein  26.62 
 
 
433 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.249822  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1478  glycosyl transferase family 2  29.22 
 
 
533 aa  53.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  25 
 
 
433 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4425  glycosyl transferase family 2  26.98 
 
 
476 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5327  glycosyl transferase, group 2 family  25 
 
 
433 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76631e-28 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1375  glycosyl transferase family 2  27.72 
 
 
433 aa  52.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0670  glycosyl transferase family protein  30.54 
 
 
501 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0705  glycosyl transferase family 2  30.54 
 
 
501 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5361  N-acetylglucosaminyltransferase  23.21 
 
 
433 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.190593  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5356  glycosyl transferase domain-containing protein  24.4 
 
 
433 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18681  glycosyl transferase family protein  25.23 
 
 
433 aa  50.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  25.5 
 
 
549 aa  50.8  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  26.85 
 
 
841 aa  50.4  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2904  glycosyl transferase family protein  26.11 
 
 
546 aa  50.1  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2839  glycosyl transferase family 2  27.66 
 
 
523 aa  49.3  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0714  glycosyl transferase family protein  30.95 
 
 
501 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0487319  decreased coverage  0.00470024 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4704  glycosyl transferase family 2  29.71 
 
 
483 aa  49.7  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0279225  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6620  glycosyl transferase family 2  28.65 
 
 
508 aa  48.5  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2214  glycosyl transferase family 2  27.67 
 
 
371 aa  48.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18491  glycosyl transferase family protein  24.77 
 
 
433 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.468741  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0472  glycosyl transferase family protein  34.74 
 
 
365 aa  46.6  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>