More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2964 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2964  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
476 aa  967    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0324251  hitchhiker  0.00721921 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0721  general secretion pathway protein E  46.14 
 
 
606 aa  395  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.831257  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1292  glycosyl transferase family protein  46.15 
 
 
642 aa  390  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2855  glycosyl transferase family 2  42.3 
 
 
624 aa  352  7e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.875286 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4110  glycosyl transferase family protein  45.12 
 
 
626 aa  352  7e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656691  normal  0.773085 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0424  glycosyl transferase family protein  49.74 
 
 
652 aa  341  2e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.32532  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1949  General secretory system II protein E domain protein  46.97 
 
 
612 aa  336  5.999999999999999e-91  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0980  glycosyl transferase family 2  46.81 
 
 
512 aa  321  1.9999999999999998e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0207  hypothetical protein  42.96 
 
 
475 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2931  glycosyl transferase family 2  42.11 
 
 
664 aa  299  9e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0998  glycosyl transferase family protein  43.75 
 
 
686 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.759416  normal  0.641778 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0535  hypothetical protein  45 
 
 
417 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0525  hypothetical protein  45.26 
 
 
464 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0547  hypothetical protein  45 
 
 
464 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41908  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3200  glycosyl transferase family protein  36.73 
 
 
848 aa  297  4e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0886  glycosyl transferases  42.89 
 
 
673 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0659  general secretion pathway protein E  44.14 
 
 
628 aa  289  6e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.814938  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3420  glycosyl transferase family 2  42.05 
 
 
616 aa  288  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1872  glycosyl transferase family protein  42.78 
 
 
604 aa  287  4e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0522  general secretion pathway protein E  42.78 
 
 
636 aa  286  5e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.450126  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2861  glycosyl transferase family protein  43.98 
 
 
678 aa  286  8e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.623061  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3225  glycosyl transferase family protein  44.88 
 
 
596 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0693647  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2166  general secretion pathway protein E  43.57 
 
 
698 aa  283  4.0000000000000003e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0496  glycosyl transferase family protein  44.77 
 
 
537 aa  282  1e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.741629  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3549  glycosyl transferase family protein  45.14 
 
 
614 aa  281  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.877744 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2382  glycosyl transferase family protein  45.29 
 
 
678 aa  278  1e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1064  glycosyl transferase family protein  40.47 
 
 
650 aa  275  1.0000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.132947 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2888  glycosyl transferase family 2  39.6 
 
 
615 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233699 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.74 
 
 
573 aa  273  5.000000000000001e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5168  glycosyl transferase family 2  44.53 
 
 
683 aa  273  6e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0296  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.32 
 
 
630 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3769  glycosyl transferase family protein  41.49 
 
 
632 aa  269  8e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997629  normal  0.300264 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1627  cell wall biogenesis glycosyltransferase  46.28 
 
 
656 aa  268  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0402312  normal  0.167793 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0379  glycosyl transferase family protein  42.59 
 
 
626 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0431  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.5 
 
 
532 aa  267  4e-70  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.802283  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2295  glycosyl transferase family protein  43.24 
 
 
509 aa  266  5e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0577  glycosyltransferase  39.08 
 
 
664 aa  258  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0014  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.57 
 
 
656 aa  251  3e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3092  hypothetical protein  50.59 
 
 
492 aa  249  9e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2388  glycosyl transferase  39.78 
 
 
635 aa  248  2e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.445397  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1245  glycosyl transferase family protein  38.11 
 
 
654 aa  244  3e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.620003 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0149  glycosyl transferase family protein  46.24 
 
 
450 aa  162  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.975549 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0203  glycosyl transferase family protein  41.9 
 
 
465 aa  160  6e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.678813  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0209  putative glycosyl transferase  40.09 
 
 
219 aa  151  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0145  glycosyl transferase  39.52 
 
 
216 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.51395  normal  0.856095 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4863  glycosyl transferase family protein  31.3 
 
 
461 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907872  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0635  glycosyl transferase family protein  33.09 
 
 
471 aa  105  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00269925  normal  0.0269839 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5030  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
433 aa  104  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  29.83 
 
 
433 aa  105  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3771  glycosyl transferase family protein  29.36 
 
 
433 aa  103  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5327  glycosyl transferase, group 2 family  29.83 
 
 
433 aa  103  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76631e-28 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4918  glycosyl transferase  29.83 
 
 
433 aa  103  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0768338  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5361  N-acetylglucosaminyltransferase  29.83 
 
 
433 aa  103  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.190593  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5356  glycosyl transferase domain-containing protein  29.41 
 
 
433 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4933  N-acetylglucosaminyltransferase  29.83 
 
 
433 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.443938  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
420 aa  102  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0070  glycosyl transferase family 2  34.14 
 
 
431 aa  102  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0705  glycosyl transferase family 2  30.31 
 
 
501 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0704  glycosyl transferase family 2  30.31 
 
 
501 aa  100  8e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.441471  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0670  glycosyl transferase family protein  29.97 
 
 
501 aa  99.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0714  glycosyl transferase family protein  30.99 
 
 
501 aa  97.8  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0487319  decreased coverage  0.00470024 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1567  glycosyl transferase family protein  28.72 
 
 
492 aa  97.1  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1766  glycosyl transferase family 2  29.78 
 
 
505 aa  96.7  9e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.214339  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4704  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
483 aa  95.9  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0279225  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
509 aa  94.4  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  26.77 
 
 
549 aa  94.4  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2904  glycosyl transferase family protein  30.17 
 
 
546 aa  94.4  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  25.37 
 
 
395 aa  94  5e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0984  glycosyl transferase family 2  26.51 
 
 
393 aa  92.8  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00499556  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0285  glycosyl transferase family protein  28.8 
 
 
443 aa  90.1  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6620  glycosyl transferase family 2  31.06 
 
 
508 aa  89  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 
399 aa  89  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  24.81 
 
 
475 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  24.81 
 
 
475 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1562  glycosyl transferase family protein  25.51 
 
 
435 aa  86.3  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1478  glycosyl transferase family 2  28.28 
 
 
533 aa  85.9  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0965  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.39 
 
 
644 aa  84.7  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1219  glycosyl transferase family 2  26.97 
 
 
439 aa  84  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0212289 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0095  glycosyl transferase family 2  27.43 
 
 
494 aa  83.6  0.000000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.176574  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0332  response regulator receiver protein  28.3 
 
 
806 aa  83.6  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112355  normal  0.937153 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05410  glycosyltransferase  26.35 
 
 
490 aa  82.4  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1083  glycosyltransferase  28.24 
 
 
458 aa  80.1  0.00000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014105 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2839  glycosyl transferase family 2  27.67 
 
 
523 aa  80.1  0.00000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  29.48 
 
 
1101 aa  79.3  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2749  glycosyl transferase family protein  28.03 
 
 
502 aa  79.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924892  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0081  glycosyltransferase  26.25 
 
 
435 aa  79.7  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000323026  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  30.34 
 
 
752 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  28.99 
 
 
1118 aa  77.4  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0057  putative glycosyltransferase  30.71 
 
 
443 aa  75.9  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0444  glycosyl transferase family protein  25.7 
 
 
688 aa  75.9  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000329644 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  28.98 
 
 
410 aa  75.5  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1831  glycosyltransferase  26.77 
 
 
473 aa  75.1  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115115  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0383  glycosyl transferase family protein  33.99 
 
 
443 aa  74.3  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.138846  normal  0.0930893 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  27.45 
 
 
422 aa  74.7  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  29.1 
 
 
633 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1518  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.74 
 
 
767 aa  74.3  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0706082  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  25.66 
 
 
476 aa  73.9  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0852  glycosyl transferase family protein  28.87 
 
 
520 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4660  glycosyl transferase family 2  28.82 
 
 
488 aa  73.9  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116626  normal  0.331734 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1333  glycosyl transferase family protein  28.87 
 
 
520 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>