More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0383 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0383  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
443 aa  879    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.138846  normal  0.0930893 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2627  glycosyl transferase family protein  43.78 
 
 
425 aa  249  9e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.528621  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0997  cell wall biogenesis glycosyltransferase  36.91 
 
 
450 aa  193  6e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59468  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27610  glycosyl transferase  31.62 
 
 
629 aa  160  4e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.862401  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0515  glycosyl transferase family protein  34.57 
 
 
437 aa  153  5.9999999999999996e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.60232  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0311  glycosyl transferase family protein  32.41 
 
 
434 aa  139  8.999999999999999e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000001773  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0430  glycosyl transferase family 2  31.68 
 
 
473 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.912379  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2749  glycosyl transferase family protein  34.51 
 
 
502 aa  115  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924892  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  35.77 
 
 
1099 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  33.81 
 
 
1124 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4425  glycosyl transferase family 2  30.45 
 
 
476 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  32.84 
 
 
1120 aa  108  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  34.34 
 
 
1101 aa  107  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  34.07 
 
 
475 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  34.07 
 
 
475 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  29.13 
 
 
1118 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  27.7 
 
 
1002 aa  104  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  33.22 
 
 
420 aa  100  4e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2217  glycosyl transferase family protein  30.12 
 
 
468 aa  99  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368513  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  31.53 
 
 
422 aa  94.7  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  27.55 
 
 
1154 aa  93.2  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0984  glycosyl transferase family 2  30.57 
 
 
393 aa  92.4  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00499556  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3301  family 2 glycosyl transferase  27.94 
 
 
469 aa  91.3  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144563  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  31.2 
 
 
752 aa  90.9  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0057  putative glycosyltransferase  33.07 
 
 
443 aa  90.1  7e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4704  glycosyl transferase family 2  34.58 
 
 
483 aa  88.6  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0279225  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1083  glycosyltransferase  33.05 
 
 
458 aa  87.8  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014105 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0847  glycosyl transferase family 2  27.79 
 
 
429 aa  85.9  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1315  glycosyl transferase family protein  32.25 
 
 
520 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375095  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0852  glycosyl transferase family protein  32.25 
 
 
520 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1333  glycosyl transferase family protein  32.25 
 
 
520 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4660  glycosyl transferase family 2  32.33 
 
 
488 aa  85.5  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116626  normal  0.331734 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1272  glycosyl transferase family 2  31.8 
 
 
494 aa  85.5  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102707  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1675  glycosyl transferase family 2  28.32 
 
 
415 aa  84.7  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  28.31 
 
 
549 aa  84.7  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  33.47 
 
 
509 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  33.89 
 
 
509 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  30.22 
 
 
495 aa  84.7  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  34.3 
 
 
520 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  27.46 
 
 
461 aa  83.6  0.000000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0704  glycosyl transferase family 2  28.22 
 
 
501 aa  83.6  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.441471  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  34.31 
 
 
505 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0635  glycosyl transferase family protein  33.88 
 
 
471 aa  83.6  0.000000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00269925  normal  0.0269839 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  34.3 
 
 
662 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17851  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 
437 aa  82.8  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  29.7 
 
 
395 aa  82.4  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1949  General secretory system II protein E domain protein  29.39 
 
 
612 aa  82.4  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0705  glycosyl transferase family 2  28.22 
 
 
501 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2295  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 
509 aa  82.4  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  27.02 
 
 
1115 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3771  glycosyl transferase family protein  27.08 
 
 
433 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  25.63 
 
 
927 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2388  glycosyl transferase  29.1 
 
 
635 aa  81.6  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.445397  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5168  glycosyl transferase family 2  31.49 
 
 
683 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  25.63 
 
 
1119 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0060  putative glycosyltransferase  33.2 
 
 
439 aa  80.9  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1593  glycosyl transferase family protein  26.33 
 
 
425 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.901855  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  32.42 
 
 
428 aa  80.5  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  33.89 
 
 
633 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0218  glycosyl transferase family protein  22.92 
 
 
379 aa  80.1  0.00000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  25.38 
 
 
1115 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0949  glycosyltransferase  24.31 
 
 
442 aa  79.7  0.00000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.157522  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1292  glycosyl transferase family protein  26.77 
 
 
642 aa  79  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  25.38 
 
 
1115 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6620  glycosyl transferase family 2  32.38 
 
 
508 aa  79.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5030  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
433 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2166  general secretion pathway protein E  28.21 
 
 
698 aa  79.3  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  25.38 
 
 
872 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5361  N-acetylglucosaminyltransferase  26.28 
 
 
433 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.190593  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0670  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 
501 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  27.45 
 
 
509 aa  79  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0177  glycosyl transferase family 2  26.4 
 
 
425 aa  79  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00145418  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5356  glycosyl transferase domain-containing protein  27.46 
 
 
433 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4933  N-acetylglucosaminyltransferase  28.22 
 
 
433 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.443938  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  23.96 
 
 
399 aa  77.4  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0998  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 
686 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.759416  normal  0.641778 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  23.96 
 
 
399 aa  77.4  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4608  N-glycosyltransferase  29.17 
 
 
442 aa  77.4  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4918  glycosyl transferase  28.22 
 
 
433 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0768338  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5327  glycosyl transferase, group 2 family  28.22 
 
 
433 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76631e-28 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3583  glycosyl transferase family protein  27.52 
 
 
395 aa  76.3  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2190  glycosyl transferase family 2  28.94 
 
 
450 aa  75.9  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21281  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 
438 aa  75.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.133481  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2964  glycosyl transferase family 2  30.51 
 
 
476 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0324251  hitchhiker  0.00721921 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1372  glycosyl transferase family protein  25.3 
 
 
859 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0188568  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  25.47 
 
 
1115 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  26.74 
 
 
433 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  29.01 
 
 
410 aa  75.1  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00631  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 
443 aa  74.7  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  29.05 
 
 
476 aa  74.3  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4484  N-glycosyltransferase  27.94 
 
 
423 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.230285  normal  0.930554 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0496  glycosyl transferase family protein  26.71 
 
 
537 aa  73.9  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.741629  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2790  N-glycosyltransferase  26.25 
 
 
418 aa  73.9  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.347496  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3769  glycosyl transferase family protein  28.86 
 
 
632 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997629  normal  0.300264 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1257  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 
438 aa  73.2  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1064  glycosyl transferase family protein  31.34 
 
 
650 aa  73.2  0.000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.132947 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  30.16 
 
 
442 aa  73.2  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  28.47 
 
 
412 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1375  glycosyl transferase family 2  26.87 
 
 
433 aa  72.4  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3399  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 
379 aa  72.8  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>