261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0997 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0997  cell wall biogenesis glycosyltransferase  100 
 
 
450 aa  887    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59468  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27610  glycosyl transferase  44.42 
 
 
629 aa  295  8e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.862401  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0515  glycosyl transferase family protein  37.12 
 
 
437 aa  186  6e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.60232  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0383  glycosyl transferase family protein  36.54 
 
 
443 aa  186  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.138846  normal  0.0930893 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0311  glycosyl transferase family protein  33.88 
 
 
434 aa  155  1e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000001773  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2627  glycosyl transferase family protein  34.38 
 
 
425 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.528621  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  31.44 
 
 
475 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  31.44 
 
 
475 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  30.86 
 
 
1099 aa  84.3  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2749  glycosyl transferase family protein  29.43 
 
 
502 aa  83.6  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924892  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0218  glycosyl transferase family protein  22.88 
 
 
379 aa  80.9  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  25.17 
 
 
1115 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  31.62 
 
 
1101 aa  79.7  0.00000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  29.6 
 
 
1124 aa  79.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  33.7 
 
 
495 aa  79  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  31.4 
 
 
428 aa  78.6  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4425  glycosyl transferase family 2  27.38 
 
 
476 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
420 aa  77  0.0000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  23.3 
 
 
927 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  23.3 
 
 
1115 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  23.3 
 
 
1119 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1083  glycosyltransferase  29.26 
 
 
458 aa  75.9  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014105 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  35.66 
 
 
637 aa  75.5  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  23.11 
 
 
872 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  25.17 
 
 
1115 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  30.16 
 
 
476 aa  74.3  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2217  glycosyl transferase family protein  30.48 
 
 
468 aa  74.3  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368513  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0430  glycosyl transferase family 2  28.81 
 
 
473 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.912379  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2904  glycosyl transferase family protein  24.07 
 
 
546 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3301  family 2 glycosyl transferase  29.1 
 
 
469 aa  70.9  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144563  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2154  glycosyl transferase family protein  27.9 
 
 
466 aa  70.1  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.119958 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4704  glycosyl transferase family 2  28.9 
 
 
483 aa  68.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0279225  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  23.66 
 
 
1115 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1788  glycosyl transferase family protein  22.32 
 
 
418 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  29.61 
 
 
1120 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  27.91 
 
 
410 aa  67.8  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0057  putative glycosyltransferase  29.53 
 
 
443 aa  67.4  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22610  glycosyl transferase  28.41 
 
 
497 aa  66.6  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.634128  normal  0.441487 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0060  putative glycosyltransferase  27.94 
 
 
439 aa  66.6  0.0000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1398  cellulose synthase (UDP-forming)  23.57 
 
 
740 aa  66.6  0.0000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00289904  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1738  glycosyl transferase family protein  28.67 
 
 
658 aa  66.6  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0016739  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  25.5 
 
 
403 aa  65.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0635  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 
471 aa  66.2  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00269925  normal  0.0269839 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1272  glycosyl transferase family 2  28.15 
 
 
494 aa  65.9  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102707  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  28.22 
 
 
422 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  29.23 
 
 
752 aa  64.3  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  29.72 
 
 
1118 aa  63.5  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0463  glycosyl transferase family 2  24.13 
 
 
1184 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  24.51 
 
 
433 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0452  glycosyl transferase family 2  23.71 
 
 
464 aa  62.4  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  25.22 
 
 
789 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  25.22 
 
 
789 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4863  glycosyl transferase family protein  30.29 
 
 
461 aa  62  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907872  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  25.22 
 
 
789 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  25.18 
 
 
395 aa  61.2  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0847  glycosyl transferase family 2  24.37 
 
 
429 aa  61.2  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0179  N-glycosyltransferase  27.35 
 
 
451 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574055  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0704  polyprenyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.43 
 
 
285 aa  60.8  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1411  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 
424 aa  61.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.584249 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0808  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.43 
 
 
279 aa  60.8  0.00000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3597  glycosyltransferase  28.1 
 
 
741 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1593  glycosyl transferase family protein  23.29 
 
 
425 aa  60.8  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.901855  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4949  glycosyl transferase family protein  25.74 
 
 
446 aa  60.5  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816666  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5030  glycosyl transferase family protein  23.65 
 
 
433 aa  60.5  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1675  glycosyl transferase family 2  22.68 
 
 
415 aa  60.1  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  27.04 
 
 
509 aa  60.1  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4933  N-acetylglucosaminyltransferase  24.3 
 
 
433 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.443938  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5356  glycosyl transferase domain-containing protein  24.69 
 
 
433 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4918  glycosyl transferase  24.3 
 
 
433 aa  59.7  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0768338  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2189  glycosyl transferase family 2  27.17 
 
 
470 aa  59.3  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2151  cellulose synthase (UDP-forming)  25.47 
 
 
737 aa  59.3  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.242321 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5327  glycosyl transferase, group 2 family  24.3 
 
 
433 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76631e-28 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3771  glycosyl transferase family protein  25.09 
 
 
433 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00631  glycosyl transferase family protein  26.13 
 
 
443 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1099  glycosyl transferase family protein  23.53 
 
 
437 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0201328  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5361  N-acetylglucosaminyltransferase  24.08 
 
 
433 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.190593  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  24.75 
 
 
461 aa  57.4  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2328  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.25 
 
 
466 aa  57.4  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.417791  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2239  N-glycosyltransferase  27.17 
 
 
444 aa  57.4  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.423629  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2129  N-glycosyltransferase  27.17 
 
 
444 aa  57.4  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.772993  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1930  glycosyl transferase family 2  36.29 
 
 
246 aa  57.4  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000462816 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2143  N-glycosyltransferase  27.17 
 
 
444 aa  57.4  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.382592  normal  0.0135691 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2042  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.25 
 
 
466 aa  57  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1009  glycosyl transferase family protein  28.86 
 
 
410 aa  57  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.411292  normal  0.902987 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21281  glycosyl transferase family protein  24.1 
 
 
438 aa  57  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.133481  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2190  glycosyl transferase family 2  24.58 
 
 
450 aa  56.6  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3947  glycosyl transferase family 2  24.93 
 
 
445 aa  56.6  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0288  N-glycosyltransferase  25.68 
 
 
424 aa  55.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393224  normal  0.0606217 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1257  glycosyl transferase family protein  25.25 
 
 
438 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1378  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.56 
 
 
396 aa  55.5  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.80225 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2253  glycosyl transferase family 2  23.76 
 
 
498 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1852  glycosyl transferase family 2  25.17 
 
 
397 aa  55.1  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1988  glycosyl transferase family 2  25.08 
 
 
445 aa  55.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0161  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 
475 aa  55.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2362  glycosyl transferase family 2  26.41 
 
 
469 aa  55.1  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  25.18 
 
 
399 aa  54.7  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1932  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
1140 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273416  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4777  glycosyl transferase family 2  25.33 
 
 
393 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.340207 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0487  glycosyl transferase family 2  34 
 
 
284 aa  54.7  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0984  glycosyl transferase family 2  21.88 
 
 
393 aa  54.3  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00499556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>