More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2861 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3769  glycosyl transferase family protein  69.14 
 
 		 632 aa  744    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997629  normal  0.300264 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2861  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 678 aa  1311    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.623061  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3420  glycosyl transferase family 2  55.14 
 
 		 616 aa  530  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3549  glycosyl transferase family protein  56.93 
 
 		 614 aa  523  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.877744 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1627  cell wall biogenesis glycosyltransferase  55.78 
 
 		 656 aa  498  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0402312  normal  0.167793 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3225  glycosyl transferase family protein  57.97 
 
 		 596 aa  479  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0693647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2888  glycosyl transferase family 2  44.91 
 
 		 615 aa  379  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233699 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1064  glycosyl transferase family protein  42.02 
 
 		 650 aa  357  3.9999999999999996e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.132947 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0998  glycosyl transferase family protein  39.53 
 
 		 686 aa  326  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.759416  normal  0.641778 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1292  glycosyl transferase family protein  39.77 
 
 		 642 aa  323  7e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4110  glycosyl transferase family protein  37.07 
 
 		 626 aa  313  9e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656691  normal  0.773085 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0577  glycosyltransferase  38.06 
 
 		 664 aa  310  5e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1949  General secretory system II protein E domain protein  46.29 
 
 		 612 aa  309  9e-83  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0424  glycosyl transferase family protein  42.02 
 
 		 652 aa  308  2.0000000000000002e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.32532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5168  glycosyl transferase family 2  40.19 
 
 		 683 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0886  glycosyl transferases  39.74 
 
 		 673 aa  306  8.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0379  glycosyl transferase family protein  34.53 
 
 		 626 aa  295  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2855  glycosyl transferase family 2  41.15 
 
 		 624 aa  292  1e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.875286 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2964  glycosyl transferase family 2  42.25 
 
 		 476 aa  291  3e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0324251  hitchhiker  0.00721921 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2382  glycosyl transferase family protein  45.31 
 
 		 678 aa  288  2.9999999999999996e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0431  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.71 
 
 		 532 aa  282  1e-74  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.802283  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0496  glycosyl transferase family protein  44.31 
 
 		 537 aa  279  1e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.741629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0014  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.34 
 
 		 656 aa  277  5e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2931  glycosyl transferase family 2  39.55 
 
 		 664 aa  275  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0296  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.95 
 
 		 630 aa  272  2e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0721  general secretion pathway protein E  38.11 
 
 		 606 aa  271  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.831257  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.33 
 
 		 573 aa  270  5e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3092  hypothetical protein  42.26 
 
 		 492 aa  266  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1872  glycosyl transferase family protein  42.93 
 
 		 604 aa  259  1e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2166  general secretion pathway protein E  36.05 
 
 		 698 aa  258  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0522  general secretion pathway protein E  42.93 
 
 		 636 aa  258  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.450126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2388  glycosyl transferase  43.28 
 
 		 635 aa  251  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.445397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0659  general secretion pathway protein E  40.11 
 
 		 628 aa  249  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.814938  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1245  glycosyl transferase family protein  39.79 
 
 		 654 aa  246  8e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.620003 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0207  hypothetical protein  38.58 
 
 		 475 aa  244  3e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2295  glycosyl transferase family protein  37.68 
 
 		 509 aa  244  3e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0535  hypothetical protein  40.39 
 
 		 417 aa  239  9e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0525  hypothetical protein  40.39 
 
 		 464 aa  239  9e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0547  hypothetical protein  40.39 
 
 		 464 aa  239  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3200  glycosyl transferase family protein  35.35 
 
 		 848 aa  238  3e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0980  glycosyl transferase family 2  40.32 
 
 		 512 aa  237  6e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0203  glycosyl transferase family protein  38.85 
 
 		 465 aa  204  5e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.678813  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0149  glycosyl transferase family protein  39.35 
 
 		 450 aa  192  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.975549 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0145  glycosyl transferase  40.87 
 
 		 216 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.51395  normal  0.856095 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0209  putative glycosyl transferase  39.9 
 
 		 219 aa  127  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4863  glycosyl transferase family protein  32.19 
 
 		 461 aa  122  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907872  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5030  glycosyl transferase family protein  32.91 
 
 		 433 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4933  N-acetylglucosaminyltransferase  33.33 
 
 		 433 aa  111  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.443938  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0635  glycosyl transferase family protein  32.69 
 
 		 471 aa  111  6e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00269925  normal  0.0269839 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5356  glycosyl transferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 433 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4918  glycosyl transferase  33.33 
 
 		 433 aa  110  9.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0768338  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5327  glycosyl transferase, group 2 family  33.33 
 
 		 433 aa  110  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76631e-28 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  33.33 
 
 		 433 aa  110  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5361  N-acetylglucosaminyltransferase  32.48 
 
 		 433 aa  108  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.190593  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3771  glycosyl transferase family protein  29.97 
 
 		 433 aa  107  7e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  30.03 
 
 		 420 aa  105  4e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  30.52 
 
 		 399 aa  103  8e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0070  glycosyl transferase family 2  33.94 
 
 		 431 aa  100  7e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4704  glycosyl transferase family 2  36.78 
 
 		 483 aa  99.8  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0279225  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  30.31 
 
 		 395 aa  96.3  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0984  glycosyl transferase family 2  25.51 
 
 		 393 aa  95.1  4e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00499556  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0081  glycosyltransferase  23.85 
 
 		 435 aa  94.7  5e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000323026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  32.66 
 
 		 476 aa  92.8  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0670  glycosyl transferase family protein  30.16 
 
 		 501 aa  92  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0704  glycosyl transferase family 2  29.44 
 
 		 501 aa  91.7  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.441471  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0705  glycosyl transferase family 2  29.44 
 
 		 501 aa  89.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1518  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.38 
 
 		 767 aa  87.8  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0706082  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0965  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.91 
 
 		 644 aa  88.2  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0370  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 		 438 aa  88.2  5e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0460104  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  28.77 
 
 		 509 aa  87.8  6e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1562  glycosyl transferase family protein  26.49 
 
 		 435 aa  87.8  7e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1567  glycosyl transferase family protein  28.81 
 
 		 492 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  32.79 
 
 		 662 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  30.74 
 
 		 633 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0332  response regulator receiver protein  29.66 
 
 		 806 aa  85.1  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112355  normal  0.937153 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  32.4 
 
 		 505 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  32.4 
 
 		 520 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  29.8 
 
 		 549 aa  84.7  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1315  glycosyl transferase family protein  31.33 
 
 		 520 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0852  glycosyl transferase family protein  31.33 
 
 		 520 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1333  glycosyl transferase family protein  31.33 
 
 		 520 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0714  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 		 501 aa  82.4  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0487319  decreased coverage  0.00470024 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6620  glycosyl transferase family 2  31.49 
 
 		 508 aa  81.3  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 		 509 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 509 aa  81.3  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2328  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.54 
 
 		 466 aa  80.1  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.417791  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2042  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.54 
 
 		 466 aa  79.7  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1766  glycosyl transferase family 2  27.53 
 
 		 505 aa  79.7  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.214339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  26.37 
 
 		 475 aa  79  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  26.37 
 
 		 475 aa  79  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2904  glycosyl transferase family protein  27.05 
 
 		 546 aa  78.2  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4949  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 		 446 aa  77  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816666  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  26.88 
 
 		 752 aa  76.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3032  glycosyl transferase family 2  29 
 
 		 627 aa  77  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.696996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1083  glycosyltransferase  27.74 
 
 		 458 aa  75.5  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014105 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0649  glycosyl transferase family protein  31.08 
 
 		 421 aa  74.7  0.000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.113034 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1411  glycosyl transferase family protein  33.05 
 
 		 424 aa  73.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.584249 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5087  N-acetylglucosaminyltransferase, N-terminus (glycosyl transferase)  32.45 
 
 		 218 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0015  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 		 684 aa  73.2  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4425  glycosyl transferase family 2  26.09 
 
 		 476 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>