More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0980 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0980  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 512 aa  1028    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0207  hypothetical protein  47.61 
 
 		 475 aa  421  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0525  hypothetical protein  49.4 
 
 		 464 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0535  hypothetical protein  49.28 
 
 		 417 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0547  hypothetical protein  49.16 
 
 		 464 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1292  glycosyl transferase family protein  44.22 
 
 		 642 aa  395  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0721  general secretion pathway protein E  45.21 
 
 		 606 aa  392  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.831257  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4110  glycosyl transferase family protein  44.52 
 
 		 626 aa  392  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656691  normal  0.773085 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2855  glycosyl transferase family 2  42.37 
 
 		 624 aa  381  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.875286 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1949  General secretory system II protein E domain protein  46.84 
 
 		 612 aa  339  5.9999999999999996e-92  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0424  glycosyl transferase family protein  39.01 
 
 		 652 aa  333  4e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.32532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2964  glycosyl transferase family 2  41.67 
 
 		 476 aa  325  2e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0324251  hitchhiker  0.00721921 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3200  glycosyl transferase family protein  38.71 
 
 		 848 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2931  glycosyl transferase family 2  43.56 
 
 		 664 aa  315  9.999999999999999e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0998  glycosyl transferase family protein  43.11 
 
 		 686 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.759416  normal  0.641778 
 
 
-
 
NC_002978  WD0431  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.67 
 
 		 532 aa  295  1e-78  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.802283  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1872  glycosyl transferase family protein  41.69 
 
 		 604 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0522  general secretion pathway protein E  41.98 
 
 		 636 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.450126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0014  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.59 
 
 		 656 aa  282  8.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2295  glycosyl transferase family protein  40.65 
 
 		 509 aa  277  4e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0659  general secretion pathway protein E  41.6 
 
 		 628 aa  276  5e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.814938  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_004310  BR0296  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.21 
 
 		 630 aa  275  2.0000000000000002e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.21 
 
 		 573 aa  275  2.0000000000000002e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1245  glycosyl transferase family protein  36.44 
 
 		 654 aa  273  5.000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.620003 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0379  glycosyl transferase family protein  39.6 
 
 		 626 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0886  glycosyl transferases  39.53 
 
 		 673 aa  262  8.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0496  glycosyl transferase family protein  39.2 
 
 		 537 aa  261  3e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.741629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2388  glycosyl transferase  35.53 
 
 		 635 aa  258  2e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.445397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2166  general secretion pathway protein E  33.12 
 
 		 698 aa  258  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5168  glycosyl transferase family 2  41.01 
 
 		 683 aa  256  7e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0577  glycosyltransferase  36.73 
 
 		 664 aa  245  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1064  glycosyl transferase family protein  38.8 
 
 		 650 aa  244  3.9999999999999997e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.132947 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2382  glycosyl transferase family protein  40.68 
 
 		 678 aa  242  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2888  glycosyl transferase family 2  36.45 
 
 		 615 aa  239  8e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233699 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3092  hypothetical protein  38.36 
 
 		 492 aa  237  4e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3420  glycosyl transferase family 2  37.7 
 
 		 616 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3769  glycosyl transferase family protein  39.52 
 
 		 632 aa  234  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997629  normal  0.300264 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3549  glycosyl transferase family protein  39.84 
 
 		 614 aa  233  5e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.877744 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3225  glycosyl transferase family protein  39.84 
 
 		 596 aa  233  5e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0693647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2861  glycosyl transferase family protein  39.63 
 
 		 678 aa  229  9e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.623061  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1627  cell wall biogenesis glycosyltransferase  39.31 
 
 		 656 aa  225  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0402312  normal  0.167793 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0149  glycosyl transferase family protein  43.68 
 
 		 450 aa  145  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.975549 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0203  glycosyl transferase family protein  43.18 
 
 		 465 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.678813  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0209  putative glycosyl transferase  40.41 
 
 		 219 aa  136  7.000000000000001e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  28.15 
 
 		 420 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0145  glycosyl transferase  38.02 
 
 		 216 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.51395  normal  0.856095 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5356  glycosyl transferase domain-containing protein  28.62 
 
 		 433 aa  123  9e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4918  glycosyl transferase  28.95 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0768338  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5327  glycosyl transferase, group 2 family  28.95 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76631e-28 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5030  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 		 433 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4933  N-acetylglucosaminyltransferase  28.95 
 
 		 433 aa  121  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.443938  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  28.29 
 
 		 433 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5361  N-acetylglucosaminyltransferase  27.96 
 
 		 433 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.190593  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3771  glycosyl transferase family protein  26.57 
 
 		 433 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4863  glycosyl transferase family protein  29.79 
 
 		 461 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907872  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  27.64 
 
 		 395 aa  105  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4704  glycosyl transferase family 2  29.46 
 
 		 483 aa  105  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0279225  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0965  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.06 
 
 		 644 aa  103  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  30.24 
 
 		 549 aa  102  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0984  glycosyl transferase family 2  24.73 
 
 		 393 aa  98.2  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00499556  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0070  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 		 431 aa  97.8  4e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0635  glycosyl transferase family protein  30.59 
 
 		 471 aa  97.8  5e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00269925  normal  0.0269839 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  29.53 
 
 		 509 aa  95.1  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1766  glycosyl transferase family 2  30.42 
 
 		 505 aa  95.1  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.214339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0670  glycosyl transferase family protein  32.27 
 
 		 501 aa  93.6  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0714  glycosyl transferase family protein  31.71 
 
 		 501 aa  92.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0487319  decreased coverage  0.00470024 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0704  glycosyl transferase family 2  31.87 
 
 		 501 aa  91.7  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.441471  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0705  glycosyl transferase family 2  32.27 
 
 		 501 aa  91.7  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6620  glycosyl transferase family 2  29.72 
 
 		 508 aa  90.9  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1478  glycosyl transferase family 2  26.23 
 
 		 533 aa  89  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1245  Cellulose synthase (UDP-forming)  30.28 
 
 		 672 aa  86.7  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.731886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1133  cellulose synthase (UDP-forming)  29.88 
 
 		 672 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0362124  normal  0.973174 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  27.59 
 
 		 633 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2904  glycosyl transferase family protein  27.42 
 
 		 546 aa  86.3  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  26.22 
 
 		 475 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  26.22 
 
 		 475 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05410  glycosyltransferase  27.73 
 
 		 490 aa  84  0.000000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2627  glycosyl transferase family protein  27.41 
 
 		 425 aa  84  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.528621  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1279  Cellulose synthase (UDP-forming)  29.48 
 
 		 672 aa  83.2  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.14202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0095  glycosyl transferase family 2  28.27 
 
 		 494 aa  82.8  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.176574  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 		 509 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3301  family 2 glycosyl transferase  27.53 
 
 		 469 aa  82  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144563  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0852  glycosyl transferase family protein  26.87 
 
 		 520 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1333  glycosyl transferase family protein  26.87 
 
 		 520 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1567  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 492 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1315  glycosyl transferase family protein  26.97 
 
 		 520 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  25.17 
 
 		 1154 aa  81.3  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  27.44 
 
 		 520 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  27.84 
 
 		 509 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3509  cellulose synthase (UDP-forming)  29.44 
 
 		 666 aa  80.1  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.901561  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  27.25 
 
 		 505 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0374  cellulose synthase (UDP-forming)  29.32 
 
 		 661 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  27.93 
 
 		 662 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1105  glycosyl transferase family protein  28.07 
 
 		 632 aa  79.3  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.293938  normal  0.766721 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  24.7 
 
 		 399 aa  78.6  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2839  glycosyl transferase family 2  25.86 
 
 		 523 aa  78.6  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4425  glycosyl transferase family 2  26.58 
 
 		 476 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4645  Cellulose synthase (UDP-forming)  27.25 
 
 		 664 aa  77.8  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.998424 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1562  glycosyl transferase family protein  23.85 
 
 		 435 aa  76.3  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5599  N-acetylglucosaminyltransferase  28 
 
 		 262 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0041999  hitchhiker  0.0000000000128208 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>