More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0577 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0577  glycosyltransferase  100 
 
 		 664 aa  1345    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0014  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.78 
 
 		 656 aa  412  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0379  glycosyl transferase family protein  41.04 
 
 		 626 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0296  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.56 
 
 		 630 aa  389  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.16 
 
 		 573 aa  379  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2382  glycosyl transferase family protein  38.42 
 
 		 678 aa  318  2e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0424  glycosyl transferase family protein  37.05 
 
 		 652 aa  317  4e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.32532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0886  glycosyl transferases  36.75 
 
 		 673 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0721  general secretion pathway protein E  37.18 
 
 		 606 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.831257  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1292  glycosyl transferase family protein  37.14 
 
 		 642 aa  306  6e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2855  glycosyl transferase family 2  33.22 
 
 		 624 aa  305  1.0000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.875286 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5168  glycosyl transferase family 2  40.87 
 
 		 683 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2861  glycosyl transferase family protein  38.16 
 
 		 678 aa  304  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.623061  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0998  glycosyl transferase family protein  35.76 
 
 		 686 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.759416  normal  0.641778 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2888  glycosyl transferase family 2  35.28 
 
 		 615 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233699 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4110  glycosyl transferase family protein  34.25 
 
 		 626 aa  302  1e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656691  normal  0.773085 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3769  glycosyl transferase family protein  37.4 
 
 		 632 aa  301  3e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997629  normal  0.300264 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1064  glycosyl transferase family protein  35.89 
 
 		 650 aa  301  3e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.132947 
 
 
-
 
NC_002978  WD0431  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.21 
 
 		 532 aa  283  9e-75  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.802283  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1245  glycosyl transferase family protein  40.05 
 
 		 654 aa  278  3e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.620003 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3549  glycosyl transferase family protein  37.23 
 
 		 614 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.877744 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0496  glycosyl transferase family protein  41.64 
 
 		 537 aa  266  8.999999999999999e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.741629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3092  hypothetical protein  40 
 
 		 492 aa  265  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3420  glycosyl transferase family 2  35.6 
 
 		 616 aa  265  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1627  cell wall biogenesis glycosyltransferase  42.89 
 
 		 656 aa  265  3e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0402312  normal  0.167793 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3225  glycosyl transferase family protein  42.49 
 
 		 596 aa  263  6e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0693647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1949  General secretory system II protein E domain protein  36.84 
 
 		 612 aa  263  6e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2964  glycosyl transferase family 2  39.81 
 
 		 476 aa  262  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0324251  hitchhiker  0.00721921 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2931  glycosyl transferase family 2  31.87 
 
 		 664 aa  261  3e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0659  general secretion pathway protein E  34.32 
 
 		 628 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.814938  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0207  hypothetical protein  37.04 
 
 		 475 aa  253  7e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1872  glycosyl transferase family protein  40.25 
 
 		 604 aa  252  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0522  general secretion pathway protein E  40.25 
 
 		 636 aa  251  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.450126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0547  hypothetical protein  39.25 
 
 		 464 aa  249  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0535  hypothetical protein  39.25 
 
 		 417 aa  249  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0525  hypothetical protein  39.25 
 
 		 464 aa  249  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0980  glycosyl transferase family 2  36.73 
 
 		 512 aa  244  3e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2166  general secretion pathway protein E  38.92 
 
 		 698 aa  243  7e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3200  glycosyl transferase family protein  33.25 
 
 		 848 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2388  glycosyl transferase  36.38 
 
 		 635 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.445397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2295  glycosyl transferase family protein  36.17 
 
 		 509 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0149  glycosyl transferase family protein  51.18 
 
 		 450 aa  174  5e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.975549 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0203  glycosyl transferase family protein  44.84 
 
 		 465 aa  164  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.678813  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0145  glycosyl transferase  37.82 
 
 		 216 aa  137  9e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.51395  normal  0.856095 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0209  putative glycosyl transferase  36.27 
 
 		 219 aa  136  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4863  glycosyl transferase family protein  29.62 
 
 		 461 aa  103  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907872  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0635  glycosyl transferase family protein  34 
 
 		 471 aa  102  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00269925  normal  0.0269839 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0070  glycosyl transferase family 2  33.61 
 
 		 431 aa  100  6e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4704  glycosyl transferase family 2  25.92 
 
 		 483 aa  98.2  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0279225  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  25.59 
 
 		 420 aa  97.4  7e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5030  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 		 433 aa  96.3  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  27.12 
 
 		 433 aa  96.3  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4933  N-acetylglucosaminyltransferase  26.92 
 
 		 433 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.443938  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5356  glycosyl transferase domain-containing protein  26.92 
 
 		 433 aa  94.4  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4918  glycosyl transferase  26.92 
 
 		 433 aa  94.4  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0768338  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5327  glycosyl transferase, group 2 family  26.92 
 
 		 433 aa  94.4  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76631e-28 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3771  glycosyl transferase family protein  25.62 
 
 		 433 aa  93.6  9e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5361  N-acetylglucosaminyltransferase  26.92 
 
 		 433 aa  93.6  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.190593  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0984  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 		 393 aa  92.8  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00499556  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1567  glycosyl transferase family protein  28.82 
 
 		 492 aa  92.4  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  23.99 
 
 		 399 aa  89  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  28.62 
 
 		 633 aa  87.8  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  27.44 
 
 		 662 aa  87.4  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  29.45 
 
 		 520 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  29.45 
 
 		 505 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  26.54 
 
 		 509 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0852  glycosyl transferase family protein  29.08 
 
 		 520 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  25.39 
 
 		 509 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1333  glycosyl transferase family protein  29.08 
 
 		 520 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1315  glycosyl transferase family protein  29.08 
 
 		 520 aa  84.3  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  28.03 
 
 		 395 aa  83.6  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6620  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 		 508 aa  82.8  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  28.36 
 
 		 549 aa  82.4  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  24.12 
 
 		 476 aa  82.4  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0095  glycosyl transferase family 2  26.16 
 
 		 494 aa  80.5  0.00000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.176574  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2904  glycosyl transferase family protein  25.29 
 
 		 546 aa  80.1  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  26.72 
 
 		 509 aa  79.3  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1518  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  25.38 
 
 		 767 aa  75.1  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0706082  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0332  response regulator receiver protein  26.51 
 
 		 806 aa  73.9  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112355  normal  0.937153 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4660  glycosyl transferase family 2  30.29 
 
 		 488 aa  72.8  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116626  normal  0.331734 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0670  glycosyl transferase family protein  26.55 
 
 		 501 aa  71.6  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  27.03 
 
 		 475 aa  71.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0649  glycosyl transferase family protein  28.45 
 
 		 421 aa  71.2  0.00000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.113034 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  27.03 
 
 		 475 aa  71.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4949  glycosyl transferase family protein  22.66 
 
 		 446 aa  70.5  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816666  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0704  glycosyl transferase family 2  26.55 
 
 		 501 aa  70.1  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.441471  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0370  glycosyl transferase family 2  24.6 
 
 		 438 aa  69.7  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0460104  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0965  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  26.56 
 
 		 644 aa  69.7  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2749  glycosyl transferase family protein  24.69 
 
 		 502 aa  69.3  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924892  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1411  glycosyl transferase family protein  27.68 
 
 		 424 aa  68.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.584249 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0714  glycosyl transferase family protein  26.5 
 
 		 501 aa  68.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0487319  decreased coverage  0.00470024 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0705  glycosyl transferase family 2  26.55 
 
 		 501 aa  68.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05410  glycosyltransferase  23.21 
 
 		 490 aa  67.8  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1099  glycosyl transferase family protein  24.18 
 
 		 437 aa  67.4  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0201328  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1766  glycosyl transferase family 2  26.21 
 
 		 505 aa  67.4  0.0000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.214339  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3301  family 2 glycosyl transferase  24.79 
 
 		 469 aa  66.6  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144563  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0015  glycosyl transferase family protein  28.99 
 
 		 684 aa  66.6  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1478  glycosyl transferase family 2  24.48 
 
 		 533 aa  66.6  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0087  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 		 374 aa  66.2  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2154  glycosyl transferase family protein  24.32 
 
 		 466 aa  65.1  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.119958 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>