More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2470 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1777  glycosyl transferase family 2  89.35 
 
 		 802 aa  1286    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2470  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 801 aa  1611    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2008  glycosyl transferase family protein  38.62 
 
 		 379 aa  259  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0186  glycosyl transferase family 2  36.75 
 
 		 390 aa  228  3e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0851797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3105  glycosyl transferase family protein  40.1 
 
 		 421 aa  227  7e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2016  glycosyl transferase family protein  40.11 
 
 		 402 aa  220  7e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.323936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3862  glycosyl transferase family 2  37.44 
 
 		 403 aa  219  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2373  glycosyl transferase family protein  39.53 
 
 		 411 aa  215  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1977  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.74 
 
 		 380 aa  211  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1811  glycosyl transferase family protein  40.17 
 
 		 402 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000206288  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1655  glycosyl transferase family protein  38.8 
 
 		 385 aa  209  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.645193  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2049  glycosyl transferase family 2  40.29 
 
 		 402 aa  207  5e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.695075  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2119  glycosyl transferase family 2  40.29 
 
 		 402 aa  207  5e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000829457  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3583  glycosyl transferase family protein  37.31 
 
 		 395 aa  206  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2214  glycosyl transferase family 2  36.34 
 
 		 371 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2031  glycosyl transferase family 2  34.14 
 
 		 393 aa  201  5e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000685673 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2330  glycosyl transferase family protein  35.09 
 
 		 376 aa  200  7e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000511851  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5020  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.21 
 
 		 390 aa  198  3e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971161  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3705  glycosyl transferase family 2  33.06 
 
 		 396 aa  197  8.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806401  normal  0.251051 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2368  glycosyl transferase family protein  41.78 
 
 		 378 aa  192  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0681  glycosyl transferase family 2  40.89 
 
 		 379 aa  190  8e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.923916 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0160  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.51 
 
 		 379 aa  189  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3399  glycosyl transferase, group 1  32.98 
 
 		 379 aa  182  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3075  glycosyl transferase family protein  32.35 
 
 		 374 aa  179  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3063  glycosyl transferase family protein  38.23 
 
 		 410 aa  177  6e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.198233  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0245  glycosyl transferase family 2  30.29 
 
 		 380 aa  175  2.9999999999999996e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0296  putative transmembrane glycosyl transferase  33.81 
 
 		 394 aa  170  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.617548  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3389  glycosyl transferase family protein  28.94 
 
 		 378 aa  165  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2341  glycosyl transferase family protein  29.27 
 
 		 388 aa  164  6e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02219  hypothetical protein  29.34 
 
 		 398 aa  159  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3877  glycosyl transferase family 2  31.59 
 
 		 393 aa  159  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.148656  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0096  glycosyl transferase family 2  35.42 
 
 		 382 aa  155  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.86731 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1844  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 		 387 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003542  putative intercellular adhesion protein A  28.65 
 
 		 395 aa  155  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1027  glycosyl transferase family 2  32.35 
 
 		 408 aa  147  8.000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3948  glycosyl transferase family protein  32.71 
 
 		 471 aa  141  4.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05330  Glycosyl transferase, family 2  31.62 
 
 		 383 aa  130  7.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0200039  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0785  glycosyl transferase family protein  30.93 
 
 		 402 aa  124  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.546497  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2016  glycosyl transferase family protein  30.55 
 
 		 378 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  30.32 
 
 		 1101 aa  119  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0472  glycosyl transferase family protein  31.1 
 
 		 365 aa  114  9e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2981  glycosyl transferase family 2  32.48 
 
 		 387 aa  105  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0930  glycosyl transferase family protein  28.41 
 
 		 351 aa  103  9e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.569667  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  29.02 
 
 		 1115 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4704  glycosyl transferase family 2  32.35 
 
 		 483 aa  102  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0279225  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  30.36 
 
 		 410 aa  102  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  32.52 
 
 		 752 aa  102  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  30.17 
 
 		 1099 aa  99.4  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  30.57 
 
 		 495 aa  99.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  28.8 
 
 		 872 aa  99  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0362  glycosyl transferase family protein  34.09 
 
 		 364 aa  98.6  4e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.279909  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  28.57 
 
 		 927 aa  98.2  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  28.57 
 
 		 1115 aa  98.2  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  28.57 
 
 		 1115 aa  97.4  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  28.39 
 
 		 1115 aa  96.7  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  30.93 
 
 		 1119 aa  96.7  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1351  glycosyl transferase family protein  29.32 
 
 		 362 aa  96.3  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  28.53 
 
 		 505 aa  95.1  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  28.53 
 
 		 520 aa  94.4  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  28.53 
 
 		 662 aa  93.6  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  27.87 
 
 		 461 aa  93.6  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  28.64 
 
 		 1124 aa  93.6  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  31.06 
 
 		 1002 aa  93.2  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  26.9 
 
 		 1118 aa  92.4  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0663  hypothetical protein  27.69 
 
 		 376 aa  92.4  3e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1457  glycosyl transferase family protein  31.73 
 
 		 356 aa  91.7  5e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.7433 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3947  glycosyl transferase family 2  24.48 
 
 		 445 aa  90.5  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  28.08 
 
 		 633 aa  90.1  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4840  hyaluronan synthase  31.44 
 
 		 478 aa  87.8  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55692  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1315  glycosyl transferase family protein  27.94 
 
 		 520 aa  87.4  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  29.05 
 
 		 1154 aa  87  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 		 509 aa  87.4  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  27.36 
 
 		 509 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2293  N-glycosyltransferase  26.37 
 
 		 412 aa  86.7  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00369291  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0852  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 		 520 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1333  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 		 520 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  27.62 
 
 		 549 aa  85.9  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  25.09 
 
 		 399 aa  85.5  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  25.09 
 
 		 399 aa  85.5  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  29.51 
 
 		 1120 aa  85.1  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 420 aa  85.1  0.000000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1375  glycosyl transferase family 2  29.39 
 
 		 433 aa  83.2  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2925  N-glycosyltransferase  28.45 
 
 		 421 aa  83.2  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3117  N-glycosyltransferase  28.45 
 
 		 421 aa  82.8  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3010  N-glycosyltransferase  28.45 
 
 		 421 aa  83.2  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4949  glycosyl transferase family protein  34.68 
 
 		 446 aa  82.4  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816666  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 509 aa  82  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  32.75 
 
 		 476 aa  82  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  33.52 
 
 		 399 aa  81.6  0.00000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0847  glycosyl transferase family 2  27.53 
 
 		 429 aa  81.3  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1272  glycosyl transferase family 2  37.41 
 
 		 494 aa  81.3  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102707  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  27.8 
 
 		 422 aa  81.3  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22610  glycosyl transferase  26.87 
 
 		 497 aa  80.9  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.634128  normal  0.441487 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2212  glycosyl transferase family protein  27.37 
 
 		 648 aa  80.1  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1083  glycosyltransferase  26.35 
 
 		 458 aa  79.3  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014105 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  26.64 
 
 		 694 aa  78.6  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  25.63 
 
 		 789 aa  77.4  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  25.63 
 
 		 789 aa  77.4  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  25.63 
 
 		 789 aa  77.4  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  30.36 
 
 		 637 aa  77.4  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>