More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_5020 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_5020  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 
390 aa  801    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971161  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1811  glycosyl transferase family protein  37.31 
 
 
402 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000206288  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2016  glycosyl transferase family protein  37.82 
 
 
402 aa  306  6e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.323936  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2119  glycosyl transferase family 2  37.06 
 
 
402 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000829457  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2049  glycosyl transferase family 2  37.06 
 
 
402 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.695075  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2031  glycosyl transferase family 2  35.07 
 
 
393 aa  245  9e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000685673 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0186  glycosyl transferase family 2  32.25 
 
 
390 aa  240  4e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0851797  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3389  glycosyl transferase family protein  38.06 
 
 
378 aa  238  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3705  glycosyl transferase family 2  35.59 
 
 
396 aa  231  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806401  normal  0.251051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3862  glycosyl transferase family 2  32.33 
 
 
403 aa  230  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245073  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3075  glycosyl transferase family protein  31.04 
 
 
374 aa  218  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2373  glycosyl transferase family protein  31.37 
 
 
411 aa  216  7e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3105  glycosyl transferase family protein  31.6 
 
 
421 aa  206  8e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359614  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02219  hypothetical protein  32.33 
 
 
398 aa  204  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2008  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 
379 aa  204  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0296  putative transmembrane glycosyl transferase  32.91 
 
 
394 aa  203  4e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.617548  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3583  glycosyl transferase family protein  32.27 
 
 
395 aa  203  5e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3399  glycosyl transferase, group 1  29.47 
 
 
379 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1777  glycosyl transferase family 2  40.54 
 
 
802 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2470  glycosyl transferase family 2  34.77 
 
 
801 aa  187  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003542  putative intercellular adhesion protein A  30.1 
 
 
395 aa  186  8e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2368  glycosyl transferase family protein  31.2 
 
 
378 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3877  glycosyl transferase family 2  29.15 
 
 
393 aa  179  7e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.148656  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1027  glycosyl transferase family 2  30.26 
 
 
408 aa  176  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379945  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1655  glycosyl transferase family protein  31.39 
 
 
385 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.645193  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0160  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.14 
 
 
379 aa  171  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1977  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.28 
 
 
380 aa  169  8e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1844  glycosyl transferase family 2  29.18 
 
 
387 aa  168  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2214  glycosyl transferase family 2  30.63 
 
 
371 aa  167  4e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2330  glycosyl transferase family protein  28.72 
 
 
376 aa  162  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000511851  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0245  glycosyl transferase family 2  27.88 
 
 
380 aa  158  2e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0096  glycosyl transferase family 2  30.84 
 
 
382 aa  157  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.86731 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2341  glycosyl transferase family protein  29.3 
 
 
388 aa  151  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0681  glycosyl transferase family 2  29.97 
 
 
379 aa  150  5e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.923916 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2016  glycosyl transferase family protein  32.58 
 
 
378 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3948  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
471 aa  140  6e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05330  Glycosyl transferase, family 2  28.33 
 
 
383 aa  137  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0200039  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3063  glycosyl transferase family protein  26.77 
 
 
410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.198233  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0785  glycosyl transferase family protein  32.22 
 
 
402 aa  129  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.546497  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0930  glycosyl transferase family protein  31.16 
 
 
351 aa  127  4.0000000000000003e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.569667  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  26.71 
 
 
461 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  27.5 
 
 
1101 aa  112  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1608  glycosyl transferase family protein  28.66 
 
 
373 aa  106  8e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  28.9 
 
 
1115 aa  105  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  30.24 
 
 
752 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  28.32 
 
 
1115 aa  103  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  28.03 
 
 
927 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  28.06 
 
 
872 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  26.73 
 
 
789 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  26.73 
 
 
789 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  26.73 
 
 
789 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  27.33 
 
 
1115 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  28.99 
 
 
1115 aa  100  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0663  hypothetical protein  25.32 
 
 
376 aa  100  4e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  27.75 
 
 
1119 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0567  glycosyl transferase family 2  26.02 
 
 
374 aa  99.8  8e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  28.38 
 
 
637 aa  97.8  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  26.69 
 
 
1099 aa  97.8  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  26.07 
 
 
411 aa  95.1  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  27.1 
 
 
1124 aa  94  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  29.11 
 
 
1002 aa  93.6  6e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  27.21 
 
 
1118 aa  91.3  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  26.05 
 
 
399 aa  90.9  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  26.05 
 
 
399 aa  90.9  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1351  glycosyl transferase family protein  26.3 
 
 
362 aa  90.9  4e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0362  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 
364 aa  90.5  5e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.279909  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  28.84 
 
 
1154 aa  90.5  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4704  glycosyl transferase family 2  25.75 
 
 
483 aa  90.1  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0279225  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1375  glycosyl transferase family 2  27.37 
 
 
433 aa  89  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0635  glycosyl transferase family protein  28.27 
 
 
471 aa  89  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00269925  normal  0.0269839 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  26.06 
 
 
1120 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  23.84 
 
 
410 aa  88.6  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1257  glycosyl transferase family protein  25.55 
 
 
438 aa  87.4  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  26.34 
 
 
403 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  26.75 
 
 
428 aa  85.9  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0060  putative glycosyltransferase  25.81 
 
 
439 aa  85.1  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21281  glycosyl transferase family protein  24.92 
 
 
438 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.133481  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0847  glycosyl transferase family 2  25.53 
 
 
429 aa  82.8  0.000000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4484  N-glycosyltransferase  24.5 
 
 
423 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.230285  normal  0.930554 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  25.29 
 
 
694 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5030  glycosyl transferase family protein  23.6 
 
 
433 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0472  glycosyl transferase family protein  25.88 
 
 
365 aa  80.5  0.00000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  25.77 
 
 
475 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  25.77 
 
 
475 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2293  N-glycosyltransferase  24.51 
 
 
412 aa  79.7  0.00000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00369291  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4918  glycosyl transferase  23.6 
 
 
433 aa  79  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0768338  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4933  N-acetylglucosaminyltransferase  23.6 
 
 
433 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.443938  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2981  glycosyl transferase family 2  23.26 
 
 
387 aa  79.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5327  glycosyl transferase, group 2 family  23.6 
 
 
433 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76631e-28 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5361  N-acetylglucosaminyltransferase  23.84 
 
 
433 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.190593  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 
549 aa  78.6  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  23.8 
 
 
433 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  24.52 
 
 
399 aa  77.4  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5356  glycosyl transferase domain-containing protein  23.84 
 
 
433 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  24.47 
 
 
422 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1083  glycosyltransferase  28.43 
 
 
458 aa  75.5  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014105 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0484  glycosyl transferase family protein  31.9 
 
 
301 aa  74.3  0.000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0081  glycosyltransferase  24.23 
 
 
435 aa  73.9  0.000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000323026  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0288  N-glycosyltransferase  22.68 
 
 
424 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393224  normal  0.0606217 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3513  N-glycosyltransferase  22.62 
 
 
423 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>