More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1777 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1777  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 802 aa  1617    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2470  glycosyl transferase family 2  90.98 
 
 		 801 aa  1306    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2008  glycosyl transferase family protein  38.62 
 
 		 379 aa  251  3e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3105  glycosyl transferase family protein  39.33 
 
 		 421 aa  227  8e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359614  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1977  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.32 
 
 		 380 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2016  glycosyl transferase family protein  38.7 
 
 		 402 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.323936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0186  glycosyl transferase family 2  35.36 
 
 		 390 aa  218  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0851797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2373  glycosyl transferase family protein  38.5 
 
 		 411 aa  212  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3862  glycosyl transferase family 2  35.82 
 
 		 403 aa  211  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1655  glycosyl transferase family protein  37.96 
 
 		 385 aa  211  4e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.645193  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1811  glycosyl transferase family protein  37.28 
 
 		 402 aa  206  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000206288  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2214  glycosyl transferase family 2  35.9 
 
 		 371 aa  204  4e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2031  glycosyl transferase family 2  34.73 
 
 		 393 aa  204  5e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000685673 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2049  glycosyl transferase family 2  36.87 
 
 		 402 aa  203  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.695075  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2119  glycosyl transferase family 2  36.87 
 
 		 402 aa  203  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000829457  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5020  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.59 
 
 		 390 aa  199  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971161  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2330  glycosyl transferase family protein  34.83 
 
 		 376 aa  198  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000511851  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3705  glycosyl transferase family 2  31.88 
 
 		 396 aa  197  7e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806401  normal  0.251051 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3583  glycosyl transferase family protein  35.01 
 
 		 395 aa  196  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0681  glycosyl transferase family 2  39.86 
 
 		 379 aa  189  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.923916 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0160  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.17 
 
 		 379 aa  186  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2368  glycosyl transferase family protein  39.09 
 
 		 378 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3399  glycosyl transferase, group 1  32.98 
 
 		 379 aa  185  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0245  glycosyl transferase family 2  30.56 
 
 		 380 aa  184  6e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3075  glycosyl transferase family protein  32.25 
 
 		 374 aa  182  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3063  glycosyl transferase family protein  32.74 
 
 		 410 aa  171  6e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.198233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2341  glycosyl transferase family protein  30.48 
 
 		 388 aa  168  4e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1844  glycosyl transferase family 2  32.1 
 
 		 387 aa  164  6e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0296  putative transmembrane glycosyl transferase  33.81 
 
 		 394 aa  162  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.617548  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3389  glycosyl transferase family protein  31.23 
 
 		 378 aa  161  4e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0096  glycosyl transferase family 2  35.43 
 
 		 382 aa  153  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.86731 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02219  hypothetical protein  27.44 
 
 		 398 aa  150  9e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3877  glycosyl transferase family 2  30.97 
 
 		 393 aa  150  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.148656  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003542  putative intercellular adhesion protein A  28 
 
 		 395 aa  147  6e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1027  glycosyl transferase family 2  32.7 
 
 		 408 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3948  glycosyl transferase family protein  32.62 
 
 		 471 aa  142  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05330  Glycosyl transferase, family 2  31.27 
 
 		 383 aa  134  6e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0200039  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0785  glycosyl transferase family protein  32.42 
 
 		 402 aa  127  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.546497  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2016  glycosyl transferase family protein  28.07 
 
 		 378 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  29.9 
 
 		 1101 aa  117  7.999999999999999e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0472  glycosyl transferase family protein  29.33 
 
 		 365 aa  110  1e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  30.6 
 
 		 1099 aa  107  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0362  glycosyl transferase family protein  35.8 
 
 		 364 aa  105  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.279909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2981  glycosyl transferase family 2  34.58 
 
 		 387 aa  104  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0930  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 		 351 aa  102  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.569667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  32.93 
 
 		 752 aa  102  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  30.68 
 
 		 495 aa  100  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  28.89 
 
 		 927 aa  100  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  31.23 
 
 		 1124 aa  100  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  28.89 
 
 		 1115 aa  100  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  28.89 
 
 		 1115 aa  99.8  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  30.51 
 
 		 872 aa  99  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  28.66 
 
 		 1119 aa  98.2  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  28.71 
 
 		 1115 aa  97.4  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  28.39 
 
 		 1115 aa  97.4  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  28.85 
 
 		 520 aa  95.5  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4704  glycosyl transferase family 2  30.67 
 
 		 483 aa  95.5  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0279225  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1351  glycosyl transferase family protein  28.74 
 
 		 362 aa  95.1  4e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  28.72 
 
 		 505 aa  95.5  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 		 410 aa  95.1  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  28.85 
 
 		 662 aa  94.7  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  30.45 
 
 		 1154 aa  93.6  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1457  glycosyl transferase family protein  31.49 
 
 		 356 aa  93.6  1e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.7433 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0663  hypothetical protein  27.48 
 
 		 376 aa  92.8  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  29.85 
 
 		 633 aa  92.8  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3947  glycosyl transferase family 2  24.85 
 
 		 445 aa  92.8  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  29.97 
 
 		 1002 aa  91.7  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  27.13 
 
 		 1118 aa  91.7  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1315  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 		 520 aa  90.5  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4949  glycosyl transferase family protein  36.26 
 
 		 446 aa  89.4  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816666  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  26.37 
 
 		 461 aa  90.1  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0852  glycosyl transferase family protein  28.03 
 
 		 520 aa  89  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1333  glycosyl transferase family protein  28.03 
 
 		 520 aa  89  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  34.1 
 
 		 476 aa  89.4  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  24.8 
 
 		 399 aa  88.2  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  24.8 
 
 		 399 aa  88.2  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1375  glycosyl transferase family 2  29.1 
 
 		 433 aa  87.8  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1272  glycosyl transferase family 2  27.51 
 
 		 494 aa  87.4  9e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102707  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  27.67 
 
 		 509 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22610  glycosyl transferase  26.04 
 
 		 497 aa  87  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.634128  normal  0.441487 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0847  glycosyl transferase family 2  28.34 
 
 		 429 aa  86.3  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  27.85 
 
 		 509 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  28.67 
 
 		 1120 aa  85.9  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  34.68 
 
 		 399 aa  85.5  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2293  N-glycosyltransferase  27.2 
 
 		 412 aa  85.1  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00369291  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1083  glycosyltransferase  26.49 
 
 		 458 aa  85.1  0.000000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014105 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  26.02 
 
 		 549 aa  84.3  0.000000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  26.05 
 
 		 789 aa  83.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  27.5 
 
 		 422 aa  84  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  26.05 
 
 		 789 aa  83.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  31.2 
 
 		 420 aa  84  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  26.05 
 
 		 789 aa  83.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  24.84 
 
 		 509 aa  82.4  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  30.87 
 
 		 637 aa  82.4  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4840  hyaluronan synthase  28.7 
 
 		 478 aa  81.6  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55692  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 		 475 aa  81.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 		 475 aa  81.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2925  N-glycosyltransferase  27.59 
 
 		 421 aa  80.9  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1608  glycosyl transferase family protein  25.07 
 
 		 373 aa  80.1  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1593  glycosyl transferase family protein  27.49 
 
 		 425 aa  79  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.901855  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>