More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2008 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2008  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 379 aa  771    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1977  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.11 
 
 		 380 aa  282  9e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1777  glycosyl transferase family 2  39.83 
 
 		 802 aa  242  7.999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2368  glycosyl transferase family protein  36.6 
 
 		 378 aa  239  8e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2330  glycosyl transferase family protein  36.63 
 
 		 376 aa  235  8e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000511851  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2373  glycosyl transferase family protein  37.88 
 
 		 411 aa  233  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1655  glycosyl transferase family protein  37.4 
 
 		 385 aa  233  4.0000000000000004e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.645193  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3399  glycosyl transferase, group 1  33.86 
 
 		 379 aa  232  9e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0186  glycosyl transferase family 2  33.16 
 
 		 390 aa  231  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0851797  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2470  glycosyl transferase family 2  38.3 
 
 		 801 aa  228  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3583  glycosyl transferase family protein  32.99 
 
 		 395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2031  glycosyl transferase family 2  33.77 
 
 		 393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000685673 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1811  glycosyl transferase family protein  36.11 
 
 		 402 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000206288  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2016  glycosyl transferase family protein  35.37 
 
 		 402 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.323936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1844  glycosyl transferase family 2  32.1 
 
 		 387 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2119  glycosyl transferase family 2  35.35 
 
 		 402 aa  216  7e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000829457  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2049  glycosyl transferase family 2  35.35 
 
 		 402 aa  215  9e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.695075  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3105  glycosyl transferase family protein  34.01 
 
 		 421 aa  213  5.999999999999999e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0245  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 380 aa  204  2e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5020  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.46 
 
 		 390 aa  204  3e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971161  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0160  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.78 
 
 		 379 aa  202  9e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3862  glycosyl transferase family 2  32.65 
 
 		 403 aa  199  9e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3075  glycosyl transferase family protein  33.69 
 
 		 374 aa  195  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2214  glycosyl transferase family 2  32.89 
 
 		 371 aa  191  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2341  glycosyl transferase family protein  30.42 
 
 		 388 aa  189  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3705  glycosyl transferase family 2  29.46 
 
 		 396 aa  184  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806401  normal  0.251051 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3877  glycosyl transferase family 2  28.27 
 
 		 393 aa  179  7e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.148656  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3389  glycosyl transferase family protein  30.95 
 
 		 378 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0096  glycosyl transferase family 2  31.76 
 
 		 382 aa  164  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.86731 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05330  Glycosyl transferase, family 2  30.29 
 
 		 383 aa  161  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0200039  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0681  glycosyl transferase family 2  32.4 
 
 		 379 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.923916 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3063  glycosyl transferase family protein  31.2 
 
 		 410 aa  155  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.198233  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2016  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 378 aa  153  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1027  glycosyl transferase family 2  26.82 
 
 		 408 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0296  putative transmembrane glycosyl transferase  25.19 
 
 		 394 aa  137  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.617548  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003542  putative intercellular adhesion protein A  26.09 
 
 		 395 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02219  hypothetical protein  24.13 
 
 		 398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3948  glycosyl transferase family protein  27.91 
 
 		 471 aa  123  4e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0785  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 		 402 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.546497  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0930  glycosyl transferase family protein  32.94 
 
 		 351 aa  104  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.569667  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  30.63 
 
 		 1099 aa  103  7e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  32.3 
 
 		 752 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  32.6 
 
 		 1101 aa  99  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1608  glycosyl transferase family protein  29.37 
 
 		 373 aa  98.6  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  31.78 
 
 		 476 aa  97.1  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0362  glycosyl transferase family protein  28.81 
 
 		 364 aa  95.1  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.279909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  26.97 
 
 		 1115 aa  92.8  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  25.76 
 
 		 509 aa  92  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  26.4 
 
 		 1115 aa  91.3  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  25 
 
 		 399 aa  90.1  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  25 
 
 		 399 aa  90.1  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  25.92 
 
 		 927 aa  89.7  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4949  glycosyl transferase family protein  29.49 
 
 		 446 aa  89.7  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816666  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  26.12 
 
 		 1115 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 		 1002 aa  89  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  25.84 
 
 		 1119 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  28.77 
 
 		 495 aa  88.6  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  26.35 
 
 		 872 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  28.1 
 
 		 1115 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1351  glycosyl transferase family protein  27.05 
 
 		 362 aa  87.4  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  25.7 
 
 		 403 aa  87  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10838  putative glycosyltransferase  25.56 
 
 		 480 aa  86.7  6e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0787082  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  27.81 
 
 		 411 aa  86.3  8e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  30.05 
 
 		 420 aa  86.3  9e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  31.46 
 
 		 637 aa  85.1  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  27.45 
 
 		 461 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  29.37 
 
 		 399 aa  85.1  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  29.43 
 
 		 1118 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1375  glycosyl transferase family 2  29.78 
 
 		 433 aa  84.7  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1272  glycosyl transferase family 2  27.45 
 
 		 494 aa  84.3  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102707  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2981  glycosyl transferase family 2  30.32 
 
 		 387 aa  84  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  28.78 
 
 		 505 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  28.78 
 
 		 520 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3509  cellulose synthase (UDP-forming)  25.53 
 
 		 666 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.901561  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 		 509 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  24.45 
 
 		 789 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  28.78 
 
 		 662 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  24.45 
 
 		 789 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  24.45 
 
 		 789 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  28.32 
 
 		 1154 aa  80.5  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  29.28 
 
 		 1120 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  27.64 
 
 		 509 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0663  hypothetical protein  25.09 
 
 		 376 aa  80.1  0.00000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22610  glycosyl transferase  28 
 
 		 497 aa  79.7  0.00000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.634128  normal  0.441487 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  24.38 
 
 		 549 aa  79.3  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4840  hyaluronan synthase  22.29 
 
 		 478 aa  78.2  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55692  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  27.62 
 
 		 633 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0852  glycosyl transferase family protein  27.7 
 
 		 520 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1315  glycosyl transferase family protein  27.7 
 
 		 520 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1333  glycosyl transferase family protein  27.7 
 
 		 520 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0472  glycosyl transferase family protein  26.54 
 
 		 365 aa  77.8  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  26.79 
 
 		 428 aa  77  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  26.61 
 
 		 1124 aa  76.6  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2293  N-glycosyltransferase  25.11 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00369291  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2749  glycosyl transferase family protein  28.89 
 
 		 502 aa  74.7  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924892  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  26.74 
 
 		 694 aa  72.8  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3933  glycosyl transferase family 2  27.57 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0374  cellulose synthase (UDP-forming)  25 
 
 		 661 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  24.69 
 
 		 422 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2212  glycosyl transferase family protein  31.97 
 
 		 648 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>