More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0186 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0186  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
390 aa  791    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0851797  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2031  glycosyl transferase family 2  58.31 
 
 
393 aa  481  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000685673 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3705  glycosyl transferase family 2  50.51 
 
 
396 aa  399  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806401  normal  0.251051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3862  glycosyl transferase family 2  52.58 
 
 
403 aa  381  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245073  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2016  glycosyl transferase family protein  37.28 
 
 
402 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.323936  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1811  glycosyl transferase family protein  37.19 
 
 
402 aa  263  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000206288  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2119  glycosyl transferase family 2  36.18 
 
 
402 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000829457  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2049  glycosyl transferase family 2  36.18 
 
 
402 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.695075  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5020  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.25 
 
 
390 aa  240  4e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971161  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2373  glycosyl transferase family protein  36.91 
 
 
411 aa  238  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3583  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 
395 aa  237  3e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3105  glycosyl transferase family protein  36.25 
 
 
421 aa  234  3e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359614  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2008  glycosyl transferase family protein  33.16 
 
 
379 aa  231  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1027  glycosyl transferase family 2  35.68 
 
 
408 aa  226  4e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379945  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3075  glycosyl transferase family protein  34.28 
 
 
374 aa  217  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2470  glycosyl transferase family 2  37.36 
 
 
801 aa  211  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1777  glycosyl transferase family 2  35.38 
 
 
802 aa  208  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1977  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.62 
 
 
380 aa  206  5e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3389  glycosyl transferase family protein  33.51 
 
 
378 aa  205  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3399  glycosyl transferase, group 1  32.23 
 
 
379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2368  glycosyl transferase family protein  33.16 
 
 
378 aa  196  7e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02219  hypothetical protein  33.17 
 
 
398 aa  196  7e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1844  glycosyl transferase family 2  31.66 
 
 
387 aa  191  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2330  glycosyl transferase family protein  34.27 
 
 
376 aa  191  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000511851  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2214  glycosyl transferase family 2  32.47 
 
 
371 aa  190  5e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003542  putative intercellular adhesion protein A  30.5 
 
 
395 aa  186  8e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3948  glycosyl transferase family protein  32.61 
 
 
471 aa  182  9.000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0245  glycosyl transferase family 2  29.11 
 
 
380 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0681  glycosyl transferase family 2  35.05 
 
 
379 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.923916 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0296  putative transmembrane glycosyl transferase  28 
 
 
394 aa  174  1.9999999999999998e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.617548  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0096  glycosyl transferase family 2  32.39 
 
 
382 aa  172  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.86731 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2341  glycosyl transferase family protein  29.01 
 
 
388 aa  171  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1655  glycosyl transferase family protein  30.03 
 
 
385 aa  171  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.645193  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0785  glycosyl transferase family protein  31.2 
 
 
402 aa  169  9e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.546497  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3877  glycosyl transferase family 2  28.46 
 
 
393 aa  166  8e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.148656  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0160  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.43 
 
 
379 aa  160  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3063  glycosyl transferase family protein  33.44 
 
 
410 aa  155  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.198233  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2016  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 
378 aa  149  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05330  Glycosyl transferase, family 2  29.24 
 
 
383 aa  130  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0200039  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  29.17 
 
 
927 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  29.17 
 
 
1115 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  29.17 
 
 
872 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  29.17 
 
 
1115 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  28.92 
 
 
1119 aa  113  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  28.75 
 
 
1115 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  28.26 
 
 
1115 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0288  N-glycosyltransferase  25.99 
 
 
424 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393224  normal  0.0606217 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  26.35 
 
 
425 aa  102  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3764  N-glycosyltransferase  26.35 
 
 
425 aa  102  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0663  hypothetical protein  29.37 
 
 
376 aa  100  3e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  27.54 
 
 
412 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498109 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  27.17 
 
 
441 aa  96.3  8e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  27.17 
 
 
441 aa  96.3  8e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  27.17 
 
 
441 aa  96.3  8e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  27.17 
 
 
441 aa  96.3  8e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  27.17 
 
 
441 aa  96.3  8e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  27.17 
 
 
412 aa  96.3  9e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  30.04 
 
 
1101 aa  95.5  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0567  glycosyl transferase family 2  26.83 
 
 
374 aa  95.5  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4484  N-glycosyltransferase  25.09 
 
 
423 aa  94  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.230285  normal  0.930554 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1608  glycosyl transferase family protein  28.07 
 
 
373 aa  93.6  6e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  26.15 
 
 
428 aa  91.7  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10838  putative glycosyltransferase  24.57 
 
 
480 aa  91.7  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0787082  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  28.11 
 
 
1002 aa  92  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  25.2 
 
 
410 aa  92  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  27.73 
 
 
422 aa  90.9  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  26.79 
 
 
475 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  26.79 
 
 
475 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0179  N-glycosyltransferase  25.71 
 
 
451 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574055  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  26.67 
 
 
789 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4264  N-glycosyltransferase  24.37 
 
 
423 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219891  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  26.67 
 
 
789 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3421  N-glycosyltransferase  24.37 
 
 
423 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.543844  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4102  N-glycosyltransferase  24.37 
 
 
423 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0468214  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  26.67 
 
 
789 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2293  N-glycosyltransferase  25 
 
 
412 aa  87  5e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00369291  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3513  N-glycosyltransferase  24.01 
 
 
423 aa  87  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1351  glycosyl transferase family protein  27.76 
 
 
362 aa  87  5e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  28.99 
 
 
461 aa  86.7  6e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3996  N-glycosyltransferase  24.01 
 
 
423 aa  87  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.706651  normal  0.0922124 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1942  N-glycosyltransferase  24.01 
 
 
423 aa  86.7  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  25.52 
 
 
694 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  26.89 
 
 
399 aa  85.5  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  26.04 
 
 
1154 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  26.89 
 
 
399 aa  85.5  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2790  N-glycosyltransferase  24.82 
 
 
418 aa  85.1  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.347496  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2925  N-glycosyltransferase  23.44 
 
 
421 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2129  N-glycosyltransferase  25 
 
 
444 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.772993  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4840  hyaluronan synthase  24.4 
 
 
478 aa  85.1  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55692  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2143  N-glycosyltransferase  25 
 
 
444 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.382592  normal  0.0135691 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2239  N-glycosyltransferase  25 
 
 
444 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.423629  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0930  glycosyl transferase family protein  25.19 
 
 
351 aa  84.7  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.569667  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0362  glycosyl transferase family protein  27.02 
 
 
364 aa  84.3  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.279909  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  26.85 
 
 
1120 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3301  family 2 glycosyl transferase  26.46 
 
 
469 aa  84.3  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144563  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2718  N-glycosyltransferase  25.7 
 
 
418 aa  84  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3010  N-glycosyltransferase  23.48 
 
 
421 aa  84  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0635  glycosyl transferase family protein  26.36 
 
 
471 aa  83.6  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00269925  normal  0.0269839 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  24.88 
 
 
1118 aa  82.8  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3117  N-glycosyltransferase  22.56 
 
 
421 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>