124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0567 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0567  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
374 aa  743    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3948  glycosyl transferase family protein  33.87 
 
 
471 aa  169  6e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0785  glycosyl transferase family protein  33.51 
 
 
402 aa  162  8.000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.546497  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2373  glycosyl transferase family protein  33.59 
 
 
411 aa  112  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1811  glycosyl transferase family protein  30.89 
 
 
402 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000206288  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2119  glycosyl transferase family 2  30.89 
 
 
402 aa  106  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000829457  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2049  glycosyl transferase family 2  30.89 
 
 
402 aa  106  7e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.695075  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2031  glycosyl transferase family 2  25.48 
 
 
393 aa  100  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000685673 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5020  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.02 
 
 
390 aa  99.8  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971161  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3583  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
395 aa  99.8  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2016  glycosyl transferase family protein  29.9 
 
 
402 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.323936  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3105  glycosyl transferase family protein  30.71 
 
 
421 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359614  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0186  glycosyl transferase family 2  26.83 
 
 
390 aa  95.5  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0851797  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3705  glycosyl transferase family 2  24.49 
 
 
396 aa  92.8  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806401  normal  0.251051 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0296  putative transmembrane glycosyl transferase  23.67 
 
 
394 aa  83.2  0.000000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.617548  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0681  glycosyl transferase family 2  31.94 
 
 
379 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.923916 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3862  glycosyl transferase family 2  25.96 
 
 
403 aa  82  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245073  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2214  glycosyl transferase family 2  30.41 
 
 
371 aa  82  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02219  hypothetical protein  24.16 
 
 
398 aa  80.1  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3075  glycosyl transferase family protein  25.91 
 
 
374 aa  78.2  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003542  putative intercellular adhesion protein A  24.46 
 
 
395 aa  77.8  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0096  glycosyl transferase family 2  30.05 
 
 
382 aa  74.7  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.86731 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3063  glycosyl transferase family protein  32.39 
 
 
410 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.198233  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2368  glycosyl transferase family protein  26.16 
 
 
378 aa  70.9  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0930  glycosyl transferase family protein  24.24 
 
 
351 aa  69.7  0.00000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.569667  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2016  glycosyl transferase family protein  27.6 
 
 
378 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3389  glycosyl transferase family protein  23.16 
 
 
378 aa  67.8  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2470  glycosyl transferase family 2  26.61 
 
 
801 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3877  glycosyl transferase family 2  23.87 
 
 
393 aa  67.4  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.148656  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1777  glycosyl transferase family 2  27.06 
 
 
802 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  31.72 
 
 
299 aa  66.2  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1977  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.32 
 
 
380 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3399  glycosyl transferase, group 1  28.05 
 
 
379 aa  63.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2008  glycosyl transferase family protein  22.78 
 
 
379 aa  63.5  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05330  Glycosyl transferase, family 2  31.69 
 
 
383 aa  63.2  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0200039  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0472  glycosyl transferase family protein  27.06 
 
 
365 aa  62  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1844  glycosyl transferase family 2  27.04 
 
 
387 aa  61.2  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1351  glycosyl transferase family protein  25.23 
 
 
362 aa  60.1  0.00000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  27.12 
 
 
1101 aa  53.5  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1457  glycosyl transferase family protein  24.28 
 
 
356 aa  53.5  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.7433 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0245  glycosyl transferase family 2  22.37 
 
 
380 aa  53.1  0.000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  27.41 
 
 
752 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  27.83 
 
 
411 aa  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2190  glycosyl transferase family 2  25.2 
 
 
450 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0358  glycosyl transferase family protein  31.63 
 
 
458 aa  50.8  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2330  glycosyl transferase family protein  23.17 
 
 
376 aa  50.1  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000511851  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  23.65 
 
 
549 aa  50.1  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0663  hypothetical protein  24.39 
 
 
376 aa  49.7  0.00008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  33.66 
 
 
410 aa  49.7  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2760  glycosyl transferase family 2  30.09 
 
 
242 aa  48.9  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0363167  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1608  glycosyl transferase family protein  21.07 
 
 
373 aa  48.9  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0146  glycosyl transferase family protein  27.21 
 
 
336 aa  49.3  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  27.84 
 
 
305 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  26.94 
 
 
1124 aa  48.5  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  22.22 
 
 
333 aa  48.9  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04995  glycosyl transferase  24.44 
 
 
259 aa  48.5  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  28.87 
 
 
662 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1083  glycosyltransferase  24.64 
 
 
458 aa  47.8  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014105 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  30 
 
 
505 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0362  glycosyl transferase family protein  23.65 
 
 
364 aa  47.8  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.279909  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1816  glycosyl transferase family protein  26.99 
 
 
234 aa  47.8  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.61786  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0104  glycosyl transferase family 2  30.65 
 
 
255 aa  47.8  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4090  glycosyl transferase family 2  32.94 
 
 
441 aa  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157958  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  21.12 
 
 
694 aa  47.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1235  glycosyl transferase family protein  22.54 
 
 
249 aa  47.4  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  30 
 
 
520 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1090  glycosyl transferase family protein  26.96 
 
 
236 aa  47.8  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.11948  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  22.37 
 
 
461 aa  47  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  28.92 
 
 
789 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  28.92 
 
 
789 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  28.92 
 
 
789 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0148  cellulose synthase catalytic subunit  26 
 
 
867 aa  47  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.805146 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  23.16 
 
 
475 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  23.16 
 
 
475 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  25.11 
 
 
1099 aa  47  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1910  glycosyl transferase family 2  29.13 
 
 
622 aa  46.2  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00799183  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0057  putative glycosyltransferase  22.58 
 
 
443 aa  45.8  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1655  glycosyl transferase family protein  25.67 
 
 
385 aa  45.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.645193  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0968  hypothetical protein  27.55 
 
 
235 aa  45.8  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.683686  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4840  hyaluronan synthase  25.16 
 
 
478 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55692  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4777  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
393 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.340207 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1742  glycosyltransferase  27.18 
 
 
281 aa  45.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0794  cellulose synthase (UDP-forming)  29.03 
 
 
683 aa  45.4  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.298349  normal  0.0356093 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2212  glycosyl transferase family protein  24.41 
 
 
648 aa  45.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  27.14 
 
 
495 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0523  glycosyl transferase family protein  24.28 
 
 
356 aa  45.1  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.343071 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3556  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 
244 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0239607 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1567  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  35.45 
 
 
834 aa  45.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.554043  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3881  glycosyl transferase family 2  23.78 
 
 
305 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  26.92 
 
 
633 aa  44.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1573  glycosyl transferase family protein  26.45 
 
 
323 aa  44.3  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0784  glycosyl transferase family 2  31.78 
 
 
325 aa  44.3  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.33296  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3738  glycosyl transferase family 2  24 
 
 
279 aa  44.3  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  22.95 
 
 
1115 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  22.65 
 
 
1120 aa  44.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 
476 aa  44.3  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5836  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  28.97 
 
 
734 aa  43.9  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.481815 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0385  glycosyl transferase family 2  25.83 
 
 
311 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0394  glycosyl transferase family 2  25.83 
 
 
311 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0158  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
386 aa  43.9  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>