More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2031 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2031  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
393 aa  801    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000685673 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0186  glycosyl transferase family 2  58.31 
 
 
390 aa  481  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0851797  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3705  glycosyl transferase family 2  49.74 
 
 
396 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806401  normal  0.251051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3862  glycosyl transferase family 2  45.24 
 
 
403 aa  337  1.9999999999999998e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245073  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3583  glycosyl transferase family protein  37.19 
 
 
395 aa  247  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5020  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.07 
 
 
390 aa  245  9e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971161  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3105  glycosyl transferase family protein  35.73 
 
 
421 aa  239  8e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359614  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1811  glycosyl transferase family protein  34.51 
 
 
402 aa  237  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000206288  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2119  glycosyl transferase family 2  34.76 
 
 
402 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000829457  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2049  glycosyl transferase family 2  34.76 
 
 
402 aa  235  8e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.695075  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2016  glycosyl transferase family protein  34.59 
 
 
402 aa  233  6e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.323936  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2373  glycosyl transferase family protein  35.82 
 
 
411 aa  232  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2008  glycosyl transferase family protein  33.77 
 
 
379 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1027  glycosyl transferase family 2  32.11 
 
 
408 aa  215  8e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379945  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3389  glycosyl transferase family protein  35.77 
 
 
378 aa  202  8e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1777  glycosyl transferase family 2  34.24 
 
 
802 aa  191  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3075  glycosyl transferase family protein  32.31 
 
 
374 aa  191  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003542  putative intercellular adhesion protein A  31.91 
 
 
395 aa  190  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0296  putative transmembrane glycosyl transferase  30.67 
 
 
394 aa  186  6e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.617548  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3399  glycosyl transferase, group 1  29.56 
 
 
379 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02219  hypothetical protein  30.5 
 
 
398 aa  181  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2470  glycosyl transferase family 2  37.36 
 
 
801 aa  181  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2368  glycosyl transferase family protein  31.39 
 
 
378 aa  178  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1844  glycosyl transferase family 2  28.46 
 
 
387 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2214  glycosyl transferase family 2  31.19 
 
 
371 aa  170  3e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3948  glycosyl transferase family protein  28.84 
 
 
471 aa  169  7e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2330  glycosyl transferase family protein  29.26 
 
 
376 aa  168  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000511851  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1977  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.35 
 
 
380 aa  167  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0681  glycosyl transferase family 2  33.97 
 
 
379 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.923916 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0785  glycosyl transferase family protein  29.8 
 
 
402 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.546497  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0245  glycosyl transferase family 2  29.47 
 
 
380 aa  160  3e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3877  glycosyl transferase family 2  26.7 
 
 
393 aa  159  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.148656  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0160  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.68 
 
 
379 aa  153  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0096  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
382 aa  153  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.86731 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1655  glycosyl transferase family protein  25.89 
 
 
385 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.645193  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2341  glycosyl transferase family protein  27.74 
 
 
388 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05330  Glycosyl transferase, family 2  28.77 
 
 
383 aa  137  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0200039  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2016  glycosyl transferase family protein  27.13 
 
 
378 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3063  glycosyl transferase family protein  28.83 
 
 
410 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.198233  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1351  glycosyl transferase family protein  30.28 
 
 
362 aa  103  6e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1608  glycosyl transferase family protein  29.05 
 
 
373 aa  100  5e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  26.55 
 
 
428 aa  100  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0567  glycosyl transferase family 2  25.48 
 
 
374 aa  100  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0472  glycosyl transferase family protein  27.33 
 
 
365 aa  96.7  6e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  28.42 
 
 
1154 aa  96.3  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  26.13 
 
 
425 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3764  N-glycosyltransferase  26.13 
 
 
425 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  24.21 
 
 
1124 aa  92.8  9e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0930  glycosyl transferase family protein  26.29 
 
 
351 aa  91.7  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.569667  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0663  hypothetical protein  24.6 
 
 
376 aa  91.7  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0288  N-glycosyltransferase  24.75 
 
 
424 aa  91.3  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393224  normal  0.0606217 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  25.71 
 
 
399 aa  89.7  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  25.52 
 
 
1002 aa  89.7  8e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  25.71 
 
 
399 aa  89.7  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  23.6 
 
 
1115 aa  87  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  23.53 
 
 
1115 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2190  glycosyl transferase family 2  26.81 
 
 
450 aa  86.3  9e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  26.79 
 
 
475 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  30.64 
 
 
461 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  26.79 
 
 
475 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  26.8 
 
 
410 aa  84  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  24.56 
 
 
422 aa  84.3  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  27.84 
 
 
633 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  26.62 
 
 
476 aa  83.2  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1315  glycosyl transferase family protein  28.67 
 
 
520 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375095  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0852  glycosyl transferase family protein  28.67 
 
 
520 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  25.21 
 
 
789 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  25.21 
 
 
789 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1333  glycosyl transferase family protein  28.67 
 
 
520 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  25.21 
 
 
789 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2718  N-glycosyltransferase  25.61 
 
 
418 aa  81.6  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0635  glycosyl transferase family protein  28.99 
 
 
471 aa  81.6  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00269925  normal  0.0269839 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2293  N-glycosyltransferase  23.68 
 
 
412 aa  80.9  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00369291  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  22.11 
 
 
927 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3301  family 2 glycosyl transferase  29.77 
 
 
469 aa  81.3  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144563  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  22.73 
 
 
1119 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2790  N-glycosyltransferase  25.42 
 
 
418 aa  80.9  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.347496  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  22.7 
 
 
872 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  22.73 
 
 
1115 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  22.62 
 
 
1115 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 
509 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2217  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 
468 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368513  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4484  N-glycosyltransferase  24.03 
 
 
423 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.230285  normal  0.930554 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  26.45 
 
 
1101 aa  79  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  27.18 
 
 
520 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  27.11 
 
 
662 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  22.83 
 
 
411 aa  78.6  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  27.18 
 
 
505 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2749  glycosyl transferase family protein  29.24 
 
 
502 aa  78.2  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924892  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1375  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
433 aa  78.2  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  26.17 
 
 
509 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0362  glycosyl transferase family protein  26.47 
 
 
364 aa  77.4  0.0000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.279909  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  24.24 
 
 
442 aa  77.4  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  24.82 
 
 
549 aa  77  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04326  N-glycosyltransferase  25 
 
 
417 aa  77  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.780445  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3509  cellulose synthase (UDP-forming)  23.62 
 
 
666 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.901561  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  24.57 
 
 
403 aa  76.6  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3117  N-glycosyltransferase  25.78 
 
 
421 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  24.83 
 
 
412 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1083  glycosyltransferase  26.53 
 
 
458 aa  75.5  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014105 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>