More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0296 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0296  putative transmembrane glycosyl transferase  100 
 
 
394 aa  816    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.617548  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02219  hypothetical protein  49.48 
 
 
398 aa  396  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003542  putative intercellular adhesion protein A  49.37 
 
 
395 aa  397  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1811  glycosyl transferase family protein  32.1 
 
 
402 aa  226  4e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000206288  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2119  glycosyl transferase family 2  31.85 
 
 
402 aa  225  8e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000829457  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2049  glycosyl transferase family 2  31.85 
 
 
402 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.695075  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2016  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 
402 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.323936  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5020  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.91 
 
 
390 aa  203  4e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971161  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2031  glycosyl transferase family 2  30.67 
 
 
393 aa  186  6e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000685673 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0186  glycosyl transferase family 2  28 
 
 
390 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0851797  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2470  glycosyl transferase family 2  34.1 
 
 
801 aa  167  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3705  glycosyl transferase family 2  33.01 
 
 
396 aa  166  9e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806401  normal  0.251051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3862  glycosyl transferase family 2  26.72 
 
 
403 aa  154  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245073  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2368  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 
378 aa  152  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1777  glycosyl transferase family 2  32.66 
 
 
802 aa  149  6e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2373  glycosyl transferase family protein  28.71 
 
 
411 aa  145  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3075  glycosyl transferase family protein  25.96 
 
 
374 aa  142  9e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3583  glycosyl transferase family protein  27.11 
 
 
395 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3105  glycosyl transferase family protein  26.35 
 
 
421 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359614  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3389  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 
378 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3399  glycosyl transferase, group 1  27.25 
 
 
379 aa  140  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2008  glycosyl transferase family protein  25.19 
 
 
379 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1977  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.65 
 
 
380 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3948  glycosyl transferase family protein  29.74 
 
 
471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3877  glycosyl transferase family 2  23.8 
 
 
393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.148656  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0785  glycosyl transferase family protein  29.37 
 
 
402 aa  127  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.546497  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0681  glycosyl transferase family 2  28.35 
 
 
379 aa  126  5e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.923916 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0930  glycosyl transferase family protein  32 
 
 
351 aa  117  3e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.569667  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1655  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 
385 aa  117  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.645193  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1844  glycosyl transferase family 2  25.08 
 
 
387 aa  117  5e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2214  glycosyl transferase family 2  27.24 
 
 
371 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0096  glycosyl transferase family 2  28.84 
 
 
382 aa  113  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.86731 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2330  glycosyl transferase family protein  26.52 
 
 
376 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000511851  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05330  Glycosyl transferase, family 2  26.65 
 
 
383 aa  103  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0200039  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3063  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 
410 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.198233  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0245  glycosyl transferase family 2  24.04 
 
 
380 aa  100  5e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1027  glycosyl transferase family 2  23.75 
 
 
408 aa  99.8  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379945  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2341  glycosyl transferase family protein  22.06 
 
 
388 aa  99.4  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2016  glycosyl transferase family protein  27.03 
 
 
378 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0160  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.94 
 
 
379 aa  94.7  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  25.91 
 
 
461 aa  90.9  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2981  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 
387 aa  90.5  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  28 
 
 
1115 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0362  glycosyl transferase family protein  26.44 
 
 
364 aa  87.4  4e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.279909  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  27.76 
 
 
872 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  26.94 
 
 
1119 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  27.4 
 
 
927 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  27.24 
 
 
1115 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  27.53 
 
 
1115 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0567  glycosyl transferase family 2  23.67 
 
 
374 aa  83.2  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  26.88 
 
 
1115 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0472  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 
365 aa  82  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  23.03 
 
 
410 aa  80.5  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 
509 aa  77  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  24.82 
 
 
549 aa  76.6  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  26.77 
 
 
399 aa  75.9  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3513  N-glycosyltransferase  24.14 
 
 
423 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  26.77 
 
 
399 aa  75.9  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3996  N-glycosyltransferase  24.14 
 
 
423 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.706651  normal  0.0922124 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0663  hypothetical protein  25.37 
 
 
376 aa  73.9  0.000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  23.22 
 
 
422 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3421  N-glycosyltransferase  23.79 
 
 
423 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.543844  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2293  N-glycosyltransferase  25.54 
 
 
412 aa  71.2  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00369291  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1608  glycosyl transferase family protein  28.05 
 
 
373 aa  71.6  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4264  N-glycosyltransferase  23.79 
 
 
423 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219891  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4102  N-glycosyltransferase  23.79 
 
 
423 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0468214  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1942  N-glycosyltransferase  23.79 
 
 
423 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  26.12 
 
 
1154 aa  70.1  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  25.97 
 
 
428 aa  69.7  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4840  hyaluronan synthase  22.44 
 
 
478 aa  69.7  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55692  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0081  glycosyltransferase  21.57 
 
 
435 aa  69.7  0.00000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000323026  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4484  N-glycosyltransferase  22.49 
 
 
423 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.230285  normal  0.930554 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3301  family 2 glycosyl transferase  26.9 
 
 
469 aa  69.3  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144563  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1351  glycosyl transferase family protein  24.31 
 
 
362 aa  68.2  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10838  putative glycosyltransferase  22.87 
 
 
480 aa  68.2  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0787082  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  26.16 
 
 
752 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1375  glycosyl transferase family 2  22.78 
 
 
433 aa  67.8  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2190  glycosyl transferase family 2  25.4 
 
 
450 aa  67  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  23.1 
 
 
425 aa  67  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3764  N-glycosyltransferase  23.1 
 
 
425 aa  67  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0288  N-glycosyltransferase  23.37 
 
 
424 aa  66.2  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393224  normal  0.0606217 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2925  N-glycosyltransferase  24.58 
 
 
421 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  21.43 
 
 
420 aa  65.1  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22610  glycosyl transferase  24.33 
 
 
497 aa  64.7  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.634128  normal  0.441487 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  24.51 
 
 
1120 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2217  glycosyl transferase family protein  23.26 
 
 
468 aa  64.3  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368513  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3010  N-glycosyltransferase  22.46 
 
 
421 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3117  N-glycosyltransferase  24.15 
 
 
421 aa  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  25.1 
 
 
412 aa  63.2  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  25.1 
 
 
412 aa  63.2  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498109 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  25.1 
 
 
441 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  25.1 
 
 
441 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  25.1 
 
 
441 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  25.1 
 
 
441 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  25.1 
 
 
441 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  24.13 
 
 
789 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  24.13 
 
 
789 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  24.13 
 
 
789 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0714  glycosyl transferase family protein  24.33 
 
 
501 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0487319  decreased coverage  0.00470024 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5208  cellulose synthase (UDP-forming)  23.28 
 
 
726 aa  62  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.823689  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>