More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0681 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0681  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
379 aa  762    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.923916 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3063  glycosyl transferase family protein  66.4 
 
 
410 aa  456  1e-127  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.198233  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2214  glycosyl transferase family 2  56.99 
 
 
371 aa  419  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1655  glycosyl transferase family protein  34.02 
 
 
385 aa  194  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.645193  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3075  glycosyl transferase family protein  37.85 
 
 
374 aa  192  8e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1977  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.68 
 
 
380 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2470  glycosyl transferase family 2  38.73 
 
 
801 aa  190  4e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2016  glycosyl transferase family protein  35.88 
 
 
402 aa  189  9e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.323936  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0186  glycosyl transferase family 2  33.16 
 
 
390 aa  187  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0851797  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1777  glycosyl transferase family 2  36.99 
 
 
802 aa  188  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1811  glycosyl transferase family protein  35.68 
 
 
402 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000206288  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3399  glycosyl transferase, group 1  35.68 
 
 
379 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2119  glycosyl transferase family 2  34.92 
 
 
402 aa  179  9e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000829457  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2049  glycosyl transferase family 2  34.92 
 
 
402 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.695075  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0096  glycosyl transferase family 2  36.81 
 
 
382 aa  167  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.86731 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2368  glycosyl transferase family protein  35.28 
 
 
378 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2031  glycosyl transferase family 2  30.75 
 
 
393 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000685673 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3705  glycosyl transferase family 2  29.59 
 
 
396 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806401  normal  0.251051 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2008  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
379 aa  162  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3105  glycosyl transferase family protein  36.04 
 
 
421 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359614  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2330  glycosyl transferase family protein  30.45 
 
 
376 aa  158  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000511851  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3583  glycosyl transferase family protein  35.33 
 
 
395 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3877  glycosyl transferase family 2  31.23 
 
 
393 aa  155  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.148656  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5020  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.39 
 
 
390 aa  154  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971161  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2373  glycosyl transferase family protein  35.44 
 
 
411 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1844  glycosyl transferase family 2  32.05 
 
 
387 aa  149  8e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3862  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
403 aa  148  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245073  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0160  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.4 
 
 
379 aa  144  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05330  Glycosyl transferase, family 2  32.73 
 
 
383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0200039  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02219  hypothetical protein  29.39 
 
 
398 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0245  glycosyl transferase family 2  27.98 
 
 
380 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2016  glycosyl transferase family protein  30.79 
 
 
378 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003542  putative intercellular adhesion protein A  29.5 
 
 
395 aa  130  5.0000000000000004e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3389  glycosyl transferase family protein  31.88 
 
 
378 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0296  putative transmembrane glycosyl transferase  28.35 
 
 
394 aa  127  5e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.617548  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2341  glycosyl transferase family protein  27.87 
 
 
388 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3948  glycosyl transferase family protein  29.33 
 
 
471 aa  110  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0785  glycosyl transferase family protein  32.37 
 
 
402 aa  110  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.546497  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1027  glycosyl transferase family 2  24.68 
 
 
408 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379945  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2981  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 
387 aa  99.4  9e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0930  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 
351 aa  95.1  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.569667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  40.15 
 
 
752 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0472  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
365 aa  89.7  8e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1375  glycosyl transferase family 2  30.81 
 
 
433 aa  84.7  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0362  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 
364 aa  84.3  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.279909  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1351  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 
362 aa  82.8  0.000000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  35.62 
 
 
410 aa  81.6  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  31.5 
 
 
461 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0567  glycosyl transferase family 2  31.94 
 
 
374 aa  81.6  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  35.15 
 
 
1101 aa  81.6  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  40.35 
 
 
1099 aa  80.5  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
495 aa  80.1  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  38.81 
 
 
1118 aa  79  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  34.53 
 
 
505 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  34.85 
 
 
520 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  35.04 
 
 
399 aa  77.4  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  34.53 
 
 
662 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1083  glycosyltransferase  36.8 
 
 
458 aa  77  0.0000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014105 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  35.44 
 
 
1124 aa  77  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  31.71 
 
 
927 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  31.71 
 
 
1119 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  31.1 
 
 
872 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  38.02 
 
 
475 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  31.71 
 
 
1115 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  31.71 
 
 
1115 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  38.02 
 
 
475 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1457  glycosyl transferase family protein  31.6 
 
 
356 aa  75.9  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.7433 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  34.78 
 
 
633 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  36.42 
 
 
428 aa  74.7  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  37.04 
 
 
1154 aa  73.9  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2749  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 
502 aa  73.6  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924892  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21281  glycosyl transferase family protein  35.19 
 
 
438 aa  73.2  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.133481  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1272  glycosyl transferase family 2  32.87 
 
 
494 aa  73.2  0.000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102707  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1608  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 
373 aa  72.8  0.000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  36.02 
 
 
789 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  36.02 
 
 
789 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  36.02 
 
 
789 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  32.09 
 
 
1115 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0584  glycosyl transferase family protein  37.16 
 
 
481 aa  72  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  30.49 
 
 
1115 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  34.35 
 
 
509 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4704  glycosyl transferase family 2  32.55 
 
 
483 aa  71.2  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0279225  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4840  hyaluronan synthase  23.72 
 
 
478 aa  70.5  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55692  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1257  glycosyl transferase family protein  35.19 
 
 
438 aa  70.5  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  27.49 
 
 
549 aa  70.5  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2212  glycosyl transferase family protein  32.81 
 
 
648 aa  70.1  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  33.59 
 
 
509 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3301  family 2 glycosyl transferase  32.5 
 
 
469 aa  69.7  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144563  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  33.58 
 
 
398 aa  69.3  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3509  cellulose synthase (UDP-forming)  31.48 
 
 
666 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.901561  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1038  glycosyl transferase family protein  34.06 
 
 
355 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.378242  normal  0.03094 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  27.75 
 
 
509 aa  68.9  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18491  glycosyl transferase family protein  31.48 
 
 
433 aa  69.3  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.249822  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10838  putative glycosyltransferase  22.77 
 
 
480 aa  68.9  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0787082  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4949  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
446 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816666  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  28.47 
 
 
403 aa  68.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18491  glycosyl transferase family protein  26.25 
 
 
433 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.468741  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1751  glycosyl transferase family protein  28 
 
 
433 aa  68.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.121941  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  31.75 
 
 
420 aa  68.6  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  30.34 
 
 
476 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>