More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3948 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3948  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 471 aa  924    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0785  glycosyl transferase family protein  82.8 
 
 		 402 aa  598  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.546497  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0186  glycosyl transferase family 2  32.61 
 
 		 390 aa  182  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0851797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0567  glycosyl transferase family 2  34.22 
 
 		 374 aa  169  9e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2031  glycosyl transferase family 2  28.84 
 
 		 393 aa  169  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000685673 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3705  glycosyl transferase family 2  31.73 
 
 		 396 aa  156  7e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806401  normal  0.251051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2373  glycosyl transferase family protein  37 
 
 		 411 aa  150  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1811  glycosyl transferase family protein  36.81 
 
 		 402 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000206288  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3862  glycosyl transferase family 2  33.68 
 
 		 403 aa  147  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2016  glycosyl transferase family protein  35.65 
 
 		 402 aa  146  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.323936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3105  glycosyl transferase family protein  36.7 
 
 		 421 aa  145  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2119  glycosyl transferase family 2  36.23 
 
 		 402 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000829457  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2049  glycosyl transferase family 2  36.23 
 
 		 402 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.695075  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5020  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.96 
 
 		 390 aa  139  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971161  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3583  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 		 395 aa  137  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0296  putative transmembrane glycosyl transferase  29.74 
 
 		 394 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.617548  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1777  glycosyl transferase family 2  32.13 
 
 		 802 aa  134  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2214  glycosyl transferase family 2  31.49 
 
 		 371 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3075  glycosyl transferase family protein  31.09 
 
 		 374 aa  133  6.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2368  glycosyl transferase family protein  35.59 
 
 		 378 aa  131  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2470  glycosyl transferase family 2  34.5 
 
 		 801 aa  131  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1977  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.04 
 
 		 380 aa  130  6e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2008  glycosyl transferase family protein  27.91 
 
 		 379 aa  123  6e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3389  glycosyl transferase family protein  28.98 
 
 		 378 aa  123  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3399  glycosyl transferase, group 1  31.52 
 
 		 379 aa  123  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  32.87 
 
 		 752 aa  116  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02219  hypothetical protein  28.11 
 
 		 398 aa  114  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2981  glycosyl transferase family 2  32.29 
 
 		 387 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003542  putative intercellular adhesion protein A  30.97 
 
 		 395 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3063  glycosyl transferase family protein  31.46 
 
 		 410 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.198233  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0681  glycosyl transferase family 2  30.66 
 
 		 379 aa  107  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.923916 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0160  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.61 
 
 		 379 aa  107  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3877  glycosyl transferase family 2  26.74 
 
 		 393 aa  105  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.148656  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1844  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 		 387 aa  104  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  28.52 
 
 		 1115 aa  104  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  28.19 
 
 		 927 aa  103  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  28.19 
 
 		 1115 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  28.19 
 
 		 1119 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  27.85 
 
 		 872 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05330  Glycosyl transferase, family 2  34.87 
 
 		 383 aa  102  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0200039  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2016  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 		 378 aa  101  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  27.52 
 
 		 1115 aa  100  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1655  glycosyl transferase family protein  31.99 
 
 		 385 aa  98.2  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.645193  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0245  glycosyl transferase family 2  24.18 
 
 		 380 aa  97.8  3e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2330  glycosyl transferase family protein  29.2 
 
 		 376 aa  97.1  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000511851  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  27.42 
 
 		 1115 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0472  glycosyl transferase family protein  34.43 
 
 		 365 aa  96.7  8e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0096  glycosyl transferase family 2  30.21 
 
 		 382 aa  96.3  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.86731 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  30.32 
 
 		 1124 aa  95.9  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  32.16 
 
 		 637 aa  90.9  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  29.86 
 
 		 1101 aa  89  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1027  glycosyl transferase family 2  29.68 
 
 		 408 aa  89  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  29.26 
 
 		 1120 aa  87.4  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  30.77 
 
 		 1099 aa  85.1  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  25.88 
 
 		 694 aa  84  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 		 428 aa  83.2  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  28.57 
 
 		 461 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4840  hyaluronan synthase  25.95 
 
 		 478 aa  81.3  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55692  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1351  glycosyl transferase family protein  25.55 
 
 		 362 aa  80.1  0.00000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1105  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 		 632 aa  75.9  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.293938  normal  0.766721 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  31.1 
 
 		 495 aa  75.5  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  27.74 
 
 		 509 aa  74.7  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22610  glycosyl transferase  28.57 
 
 		 497 aa  74.3  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.634128  normal  0.441487 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1272  glycosyl transferase family 2  27.84 
 
 		 494 aa  73.9  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102707  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0930  glycosyl transferase family protein  25.61 
 
 		 351 aa  73.9  0.000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.569667  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  27.5 
 
 		 789 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  27.5 
 
 		 789 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  27.5 
 
 		 789 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  27.97 
 
 		 410 aa  71.2  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  26.57 
 
 		 1154 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0663  hypothetical protein  27.12 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1608  glycosyl transferase family protein  28 
 
 		 373 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  24.28 
 
 		 1002 aa  69.3  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1457  glycosyl transferase family protein  32.88 
 
 		 356 aa  69.3  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.7433 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2341  glycosyl transferase family protein  25.2 
 
 		 388 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  24.54 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  29.96 
 
 		 1118 aa  67  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0847  glycosyl transferase family 2  28.14 
 
 		 429 aa  67  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3010  N-glycosyltransferase  27.44 
 
 		 421 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2925  N-glycosyltransferase  26.33 
 
 		 421 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3947  glycosyl transferase family 2  31.3 
 
 		 445 aa  66.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  28.27 
 
 		 422 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3117  N-glycosyltransferase  26.33 
 
 		 421 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  26.07 
 
 		 433 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2931  glycosyl transferase family 2  36.05 
 
 		 664 aa  64.7  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  25.41 
 
 		 411 aa  64.3  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5361  N-acetylglucosaminyltransferase  24.71 
 
 		 433 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.190593  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1593  glycosyl transferase family protein  25.36 
 
 		 425 aa  63.9  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.901855  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5030  glycosyl transferase family protein  24.31 
 
 		 433 aa  63.5  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10838  putative glycosyltransferase  24.31 
 
 		 480 aa  63.5  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0787082  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5356  glycosyl transferase domain-containing protein  25.68 
 
 		 433 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0288  N-glycosyltransferase  23.85 
 
 		 424 aa  63.2  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393224  normal  0.0606217 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4918  glycosyl transferase  25.68 
 
 		 433 aa  63.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0768338  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4933  N-acetylglucosaminyltransferase  25.68 
 
 		 433 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.443938  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0752  N-glycosyltransferase  23.1 
 
 		 433 aa  63.2  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5327  glycosyl transferase, group 2 family  25.68 
 
 		 433 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76631e-28 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7281  hyaluronan synthase  24.44 
 
 		 426 aa  63.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.265868  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000617  glycosyltransferase  28.47 
 
 		 424 aa  63.2  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.786644  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2718  N-glycosyltransferase  25.1 
 
 		 418 aa  62  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0735  glycosyl transferase family 2  30.87 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>